RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580691.5

CYB561-211, Transcript of cytochrome b561, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYB561, Length 1,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561-211ENST00000580691 RICTORQ6R327 1708 aa36.32■■■■□ 3.4
CYB561-211ENST00000580691 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.32■■■■□ 3.4
CYB561-211ENST00000580691 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.31■■■■□ 3.4
CYB561-211ENST00000580691 PREX2Q70Z35 1606 aa36.31■■■■□ 3.4
CYB561-211ENST00000580691 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.31■■■■□ 3.4
CYB561-211ENST00000580691 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.29■■■■□ 3.4
CYB561-211ENST00000580691 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.29■■■■□ 3.4
CYB561-211ENST00000580691 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.25■■■■□ 3.39
CYB561-211ENST00000580691 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.25■■■■□ 3.39
CYB561-211ENST00000580691 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.24■■■■□ 3.39
CYB561-211ENST00000580691 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
CYB561-211ENST00000580691 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.21■■■■□ 3.39
CYB561-211ENST00000580691 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.2■■■■□ 3.39
CYB561-211ENST00000580691 TIAM1Q13009 1591 aa36.2■■■■□ 3.39
CYB561-211ENST00000580691 MAP3K1Q13233 1512 aa36.2■■■■□ 3.39
CYB561-211ENST00000580691 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
CYB561-211ENST00000580691 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.17■■■■□ 3.38
CYB561-211ENST00000580691 ABCC1P33527 1531 aa36.15■■■■□ 3.38
CYB561-211ENST00000580691 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.15■■■■□ 3.38
CYB561-211ENST00000580691 APLP2Q06481 763 aa36.12■■■■□ 3.37
CYB561-211ENST00000580691 KDM5CP41229 1560 aa36.1■■■■□ 3.37
CYB561-211ENST00000580691 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.09■■■■□ 3.37
CYB561-211ENST00000580691 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CYB561-211ENST00000580691 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CYB561-211ENST00000580691 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.08■■■■□ 3.37
CYB561-211ENST00000580691 AFAP1Q8N556 730 aa36.08■■■■□ 3.37
CYB561-211ENST00000580691 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
CYB561-211ENST00000580691 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.07■■■■□ 3.37
CYB561-211ENST00000580691 NCOA2Q15596 1464 aa36.05■■■■□ 3.36
CYB561-211ENST00000580691 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.05■■■■□ 3.36
CYB561-211ENST00000580691 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.05■■■■□ 3.36
CYB561-211ENST00000580691 ATP10AO60312 1499 aa36.04■■■■□ 3.36
CYB561-211ENST00000580691 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.02■■■■□ 3.36
CYB561-211ENST00000580691 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.02■■■■□ 3.36
CYB561-211ENST00000580691 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.02■■■■□ 3.36
CYB561-211ENST00000580691 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.01■■■■□ 3.35
CYB561-211ENST00000580691 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36■■■■□ 3.35
CYB561-211ENST00000580691 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36■■■■□ 3.35
CYB561-211ENST00000580691 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.96■■■■□ 3.35
CYB561-211ENST00000580691 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.93■■■■□ 3.34
CYB561-211ENST00000580691 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.92■■■■□ 3.34
CYB561-211ENST00000580691 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.91■■■■□ 3.34
CYB561-211ENST00000580691 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
CYB561-211ENST00000580691 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
CYB561-211ENST00000580691 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.89■■■■□ 3.34
CYB561-211ENST00000580691 REREQ9P2R6 1566 aa35.89■■■■□ 3.34
CYB561-211ENST00000580691 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.85■■■■□ 3.33
CYB561-211ENST00000580691 MIA2Q96PC5 1412 aa35.82■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 MBD5Q9P267 1494 aa35.8■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 ABCA6Q8N139 1617 aa35.79■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.79■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.79■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.78■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 PTPRMP28827 1452 aa35.78■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 AGLP35573 1532 aa35.77■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 ATP7AQ04656 1500 aa35.77■■■■□ 3.32
CYB561-211ENST00000580691 MADDQ8WXG6 1647 aa35.75■■■■□ 3.31
CYB561-211ENST00000580691 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.75■■■■□ 3.31
CYB561-211ENST00000580691 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.75■■■■□ 3.31
CYB561-211ENST00000580691 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
CYB561-211ENST00000580691 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.72■■■■□ 3.31
CYB561-211ENST00000580691 MLECQ14165 292 aa35.72■■■■□ 3.31
CYB561-211ENST00000580691 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.69■■■■□ 3.3
CYB561-211ENST00000580691 TSPY4P0CV99 314 aa35.68■■■■□ 3.3
CYB561-211ENST00000580691 TSPY10P0CW01 314 aa35.68■■■■□ 3.3
CYB561-211ENST00000580691 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CYB561-211ENST00000580691 A2MP01023 1474 aa35.63■■■■□ 3.29
CYB561-211ENST00000580691 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.61■■■■□ 3.29
CYB561-211ENST00000580691 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
CYB561-211ENST00000580691 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.59■■■■□ 3.29
CYB561-211ENST00000580691 PLXNC1O60486 1568 aa35.57■■■■□ 3.28
CYB561-211ENST00000580691 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.55■■■■□ 3.28
CYB561-211ENST00000580691 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.54■■■■□ 3.28
CYB561-211ENST00000580691 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
CYB561-211ENST00000580691 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.53■■■■□ 3.28
CYB561-211ENST00000580691 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.5■■■■□ 3.27
CYB561-211ENST00000580691 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.49■■■■□ 3.27
CYB561-211ENST00000580691 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CYB561-211ENST00000580691 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.42■■■■□ 3.26
CYB561-211ENST00000580691 GGT6Q6P531 493 aa35.38■■■■□ 3.25
CYB561-211ENST00000580691 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.38■■■■□ 3.25
CYB561-211ENST00000580691 ABCC5O15440 1437 aa35.36■■■■□ 3.25
CYB561-211ENST00000580691 DAPK1P53355 1430 aa35.34■■■■□ 3.25
CYB561-211ENST00000580691 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.34■■■■□ 3.25
CYB561-211ENST00000580691 KIF3BO15066 747 aa35.34■■■■□ 3.25
CYB561-211ENST00000580691 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CYB561-211ENST00000580691 MROH2AA6NES4 1674 aa35.33■■■■□ 3.25
CYB561-211ENST00000580691 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
CYB561-211ENST00000580691 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.3■■■■□ 3.24
CYB561-211ENST00000580691 ZMYM3Q14202 1370 aa35.28■■■■□ 3.24
CYB561-211ENST00000580691 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.28■■■■□ 3.24
CYB561-211ENST00000580691 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.28■■■■□ 3.24
CYB561-211ENST00000580691 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CYB561-211ENST00000580691 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CYB561-211ENST00000580691 C3P01024 1663 aa35.27■■■■□ 3.24
CYB561-211ENST00000580691 NPATQ14207 1427 aa35.26■■■■□ 3.24
CYB561-211ENST00000580691 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.25■■■■□ 3.23
CYB561-211ENST00000580691 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CYB561-211ENST00000580691 KIF15Q9NS87 1388 aa35.24■■■■□ 3.23
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