RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578709.5

ERBB2-209, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 2, human

TSL 4

Gene ERBB2, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB2-209	ENST00000578709	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	37.28	■■■■□ 3.56
ERBB2-209	ENST00000578709	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		37.28	■■■■□ 3.56
ERBB2-209	ENST00000578709	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	37.27	■■■■□ 3.56
ERBB2-209	ENST00000578709	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		37.27	■■■■□ 3.56
ERBB2-209	ENST00000578709	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	37.26	■■■■□ 3.56
ERBB2-209	ENST00000578709	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		37.24	■■■■□ 3.55
ERBB2-209	ENST00000578709	NCOA2	Q15596	1464 aa		37.23	■■■■□ 3.55
ERBB2-209	ENST00000578709	ADGRL1	O94910	1474 aa		37.18	■■■■□ 3.54
ERBB2-209	ENST00000578709	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	37.16	■■■■□ 3.54
ERBB2-209	ENST00000578709	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		37.13	■■■■□ 3.53
ERBB2-209	ENST00000578709	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		37.12	■■■■□ 3.53
ERBB2-209	ENST00000578709	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		37.12	■■■■□ 3.53
ERBB2-209	ENST00000578709	RAPGEF3	O95398	923 aa		37.12	■■■■□ 3.53
ERBB2-209	ENST00000578709	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	37.11	■■■■□ 3.53
ERBB2-209	ENST00000578709	RICTOR	Q6R327	1708 aa		37.1	■■■■□ 3.53
ERBB2-209	ENST00000578709	ABCC1	P33527	1531 aa		37.07	■■■■□ 3.53
ERBB2-209	ENST00000578709	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		37.07	■■■■□ 3.52
ERBB2-209	ENST00000578709	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		37.06	■■■■□ 3.52
ERBB2-209	ENST00000578709	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		37.01	■■■■□ 3.52
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	37.01	■■■■□ 3.52
ERBB2-209	ENST00000578709	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		37	■■■■□ 3.51
ERBB2-209	ENST00000578709	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		37	■■■■□ 3.51
ERBB2-209	ENST00000578709	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		36.99	■■■■□ 3.51
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		36.98	■■■■□ 3.51
ERBB2-209	ENST00000578709	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		36.97	■■■■□ 3.51
ERBB2-209	ENST00000578709	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		36.94	■■■■□ 3.5
ERBB2-209	ENST00000578709	KDM5C	P41229	1560 aa		36.93	■■■■□ 3.5
ERBB2-209	ENST00000578709	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		36.93	■■■■□ 3.5
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	36.92	■■■■□ 3.5
ERBB2-209	ENST00000578709	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		36.91	■■■■□ 3.5
ERBB2-209	ENST00000578709	AFAP1	Q8N556	730 aa		36.91	■■■■□ 3.5
ERBB2-209	ENST00000578709	MIA2	Q96PC5	1412 aa		36.91	■■■■□ 3.5
ERBB2-209	ENST00000578709	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		36.88	■■■■□ 3.49
ERBB2-209	ENST00000578709	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	36.87	■■■■□ 3.49
ERBB2-209	ENST00000578709	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		36.85	■■■■□ 3.49
ERBB2-209	ENST00000578709	MBD5	Q9P267	1494 aa		36.85	■■■■□ 3.49
ERBB2-209	ENST00000578709	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		36.83	■■■■□ 3.49
ERBB2-209	ENST00000578709	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		36.81	■■■■□ 3.48
ERBB2-209	ENST00000578709	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		36.8	■■■■□ 3.48
ERBB2-209	ENST00000578709	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		36.8	■■■■□ 3.48
ERBB2-209	ENST00000578709	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		36.78	■■■■□ 3.48
ERBB2-209	ENST00000578709	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		36.74	■■■■□ 3.47
ERBB2-209	ENST00000578709	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		36.73	■■■■□ 3.47
ERBB2-209	ENST00000578709	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		36.73	■■■■□ 3.47
ERBB2-209	ENST00000578709	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		36.71	■■■■□ 3.47
ERBB2-209	ENST00000578709	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	36.71	■■■■□ 3.47
ERBB2-209	ENST00000578709	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	36.71	■■■■□ 3.47
ERBB2-209	ENST00000578709	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		36.71	■■■■□ 3.47
ERBB2-209	ENST00000578709	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	36.7	■■■■□ 3.47
ERBB2-209	ENST00000578709	ATP10A	O60312	1499 aa		36.69	■■■■□ 3.46
ERBB2-209	ENST00000578709	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	36.68	■■■■□ 3.46
ERBB2-209	ENST00000578709	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		36.66	■■■■□ 3.46
ERBB2-209	ENST00000578709	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		36.66	■■■■□ 3.46
ERBB2-209	ENST00000578709	ABCA6	Q8N139	1617 aa		36.66	■■■■□ 3.46
ERBB2-209	ENST00000578709	ATP7A	Q04656	1500 aa		36.65	■■■■□ 3.46
ERBB2-209	ENST00000578709	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		36.63	■■■■□ 3.45
ERBB2-209	ENST00000578709	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		36.62	■■■■□ 3.45
ERBB2-209	ENST00000578709	RERE	Q9P2R6	1566 aa		36.59	■■■■□ 3.45
ERBB2-209	ENST00000578709	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		36.57	■■■■□ 3.45
ERBB2-209	ENST00000578709	TSPY4	P0CV99	314 aa		36.54	■■■■□ 3.44
ERBB2-209	ENST00000578709	TSPY10	P0CW01	314 aa		36.54	■■■■□ 3.44
ERBB2-209	ENST00000578709	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		36.53	■■■■□ 3.44
ERBB2-209	ENST00000578709	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	36.52	■■■■□ 3.44
ERBB2-209	ENST00000578709	ABCC5	O15440	1437 aa		36.52	■■■■□ 3.44
ERBB2-209	ENST00000578709	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		36.52	■■■■□ 3.44
ERBB2-209	ENST00000578709	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	36.52	■■■■□ 3.44
ERBB2-209	ENST00000578709	DAPK1	P53355	1430 aa		36.49	■■■■□ 3.43
ERBB2-209	ENST00000578709	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		36.49	■■■■□ 3.43
ERBB2-209	ENST00000578709	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		36.48	■■■■□ 3.43
ERBB2-209	ENST00000578709	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	36.48	■■■■□ 3.43
ERBB2-209	ENST00000578709	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		36.48	■■■■□ 3.43
ERBB2-209	ENST00000578709	AGL	P35573	1532 aa		36.47	■■■■□ 3.43
ERBB2-209	ENST00000578709	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		36.47	■■■■□ 3.43
ERBB2-209	ENST00000578709	A2M	P01023	1474 aa		36.44	■■■■□ 3.42
ERBB2-209	ENST00000578709	PLXNC1	O60486	1568 aa		36.44	■■■■□ 3.42
ERBB2-209	ENST00000578709	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	36.43	■■■■□ 3.42
ERBB2-209	ENST00000578709	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		36.42	■■■■□ 3.42
ERBB2-209	ENST00000578709	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	36.42	■■■■□ 3.42
ERBB2-209	ENST00000578709	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	36.37	■■■■□ 3.41
ERBB2-209	ENST00000578709	MLEC	Q14165	292 aa		36.3	■■■■□ 3.4
ERBB2-209	ENST00000578709	MADD	Q8WXG6	1647 aa		36.29	■■■■□ 3.4
ERBB2-209	ENST00000578709	ADGRL2	O95490	1459 aa		36.28	■■■■□ 3.4
ERBB2-209	ENST00000578709	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		36.27	■■■■□ 3.4
ERBB2-209	ENST00000578709	PTPRK	Q15262	1439 aa		36.26	■■■■□ 3.4
ERBB2-209	ENST00000578709	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		36.26	■■■■□ 3.4
ERBB2-209	ENST00000578709	KIF15	Q9NS87	1388 aa		36.26	■■■■□ 3.39
ERBB2-209	ENST00000578709	NCOA1	Q15788	1441 aa		36.25	■■■■□ 3.39
ERBB2-209	ENST00000578709	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		36.24	■■■■□ 3.39
ERBB2-209	ENST00000578709	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		36.22	■■■■□ 3.39
ERBB2-209	ENST00000578709	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		36.21	■■■■□ 3.39
ERBB2-209	ENST00000578709	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	36.18	■■■■□ 3.38
ERBB2-209	ENST00000578709	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	36.17	■■■■□ 3.38
ERBB2-209	ENST00000578709	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	36.17	■■■■□ 3.38
ERBB2-209	ENST00000578709	PTPRM	P28827	1452 aa		36.17	■■■■□ 3.38
ERBB2-209	ENST00000578709	ROCK1	Q13464	1354 aa		36.16	■■■■□ 3.38
ERBB2-209	ENST00000578709	KIF3B	O15066	747 aa		36.16	■■■■□ 3.38
ERBB2-209	ENST00000578709	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		36.15	■■■■□ 3.38
ERBB2-209	ENST00000578709	ITGAE	P38570	1179 aa		36.12	■■■■□ 3.37
ERBB2-209	ENST00000578709	GGT6	Q6P531	493 aa		36.12	■■■■□ 3.37
ERBB2-209	ENST00000578709	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		36.12	■■■■□ 3.37

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