RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578528.1

RPL17-201, Transcript of ribosomal protein L17, humanhuman

TSL 3

Gene RPL17, Length 481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-201ENST00000578528 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.18■■■■□ 3.38
RPL17-201ENST00000578528 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.18■■■■□ 3.38
RPL17-201ENST00000578528 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.16■■■■□ 3.38
RPL17-201ENST00000578528 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.16■■■■□ 3.38
RPL17-201ENST00000578528 FANCAO15360 1455 aa36.15■■■■□ 3.38
RPL17-201ENST00000578528 NEO1Q92859 1461 aa36.15■■■■□ 3.38
RPL17-201ENST00000578528 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.12■■■■□ 3.37
RPL17-201ENST00000578528 MIA2Q96PC5 1412 aa36.11■■■■□ 3.37
RPL17-201ENST00000578528 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
RPL17-201ENST00000578528 AKNAQ7Z591 1439 aa36.05■■■■□ 3.36
RPL17-201ENST00000578528 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.04■■■■□ 3.36
RPL17-201ENST00000578528 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.04■■■■□ 3.36
RPL17-201ENST00000578528 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.99■■■■□ 3.35
RPL17-201ENST00000578528 ABCC1P33527 1531 aa35.98■■■■□ 3.35
RPL17-201ENST00000578528 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
RPL17-201ENST00000578528 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.97■■■■□ 3.35
RPL17-201ENST00000578528 ADGRL1O94910 1474 aa35.96■■■■□ 3.35
RPL17-201ENST00000578528 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.96■■■■□ 3.35
RPL17-201ENST00000578528 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.95■■■■□ 3.35
RPL17-201ENST00000578528 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
RPL17-201ENST00000578528 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
RPL17-201ENST00000578528 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.91■■■■□ 3.34
RPL17-201ENST00000578528 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
RPL17-201ENST00000578528 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.9■■■■□ 3.34
RPL17-201ENST00000578528 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.88■■■■□ 3.33
RPL17-201ENST00000578528 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
RPL17-201ENST00000578528 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
RPL17-201ENST00000578528 MBD5Q9P267 1494 aa35.86■■■■□ 3.33
RPL17-201ENST00000578528 KDM6BO15054 1643 aa35.85■■■■□ 3.33
RPL17-201ENST00000578528 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.84■■■■□ 3.33
RPL17-201ENST00000578528 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.83■■■■□ 3.33
RPL17-201ENST00000578528 RICTORQ6R327 1708 aa35.83■■■■□ 3.33
RPL17-201ENST00000578528 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.83■■■■□ 3.33
RPL17-201ENST00000578528 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.81■■■■□ 3.32
RPL17-201ENST00000578528 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.79■■■■□ 3.32
RPL17-201ENST00000578528 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.79■■■■□ 3.32
RPL17-201ENST00000578528 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.79■■■■□ 3.32
RPL17-201ENST00000578528 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.77■■■■□ 3.32
RPL17-201ENST00000578528 KDM5CP41229 1560 aa35.76■■■■□ 3.31
RPL17-201ENST00000578528 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.74■■■■□ 3.31
RPL17-201ENST00000578528 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
RPL17-201ENST00000578528 RAPGEF3O95398 923 aa35.73■■■■□ 3.31
RPL17-201ENST00000578528 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
RPL17-201ENST00000578528 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.73■■■■□ 3.31
RPL17-201ENST00000578528 AFAP1Q8N556 730 aa35.7■■■■□ 3.31
RPL17-201ENST00000578528 ABCC5O15440 1437 aa35.68■■■■□ 3.3
RPL17-201ENST00000578528 DAPK1P53355 1430 aa35.67■■■■□ 3.3
RPL17-201ENST00000578528 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.67■■■■□ 3.3
RPL17-201ENST00000578528 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.65■■■■□ 3.3
RPL17-201ENST00000578528 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.64■■■■□ 3.3
RPL17-201ENST00000578528 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.64■■■■□ 3.3
RPL17-201ENST00000578528 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.63■■■■□ 3.29
RPL17-201ENST00000578528 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.63■■■■□ 3.29
RPL17-201ENST00000578528 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
RPL17-201ENST00000578528 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.6■■■■□ 3.29
RPL17-201ENST00000578528 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
RPL17-201ENST00000578528 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.58■■■■□ 3.29
RPL17-201ENST00000578528 TSPY4P0CV99 314 aa35.58■■■■□ 3.29
RPL17-201ENST00000578528 TSPY10P0CW01 314 aa35.58■■■■□ 3.29
RPL17-201ENST00000578528 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.58■■■■□ 3.29
RPL17-201ENST00000578528 ATP7AQ04656 1500 aa35.57■■■■□ 3.28
RPL17-201ENST00000578528 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.56■■■■□ 3.28
RPL17-201ENST00000578528 PTPRKQ15262 1439 aa35.54■■■■□ 3.28
RPL17-201ENST00000578528 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.5■■■■□ 3.27
RPL17-201ENST00000578528 ADGRL2O95490 1459 aa35.49■■■■□ 3.27
RPL17-201ENST00000578528 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.49■■■■□ 3.27
RPL17-201ENST00000578528 PLXNC1O60486 1568 aa35.48■■■■□ 3.27
RPL17-201ENST00000578528 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.48■■■■□ 3.27
RPL17-201ENST00000578528 ABCA6Q8N139 1617 aa35.47■■■■□ 3.27
RPL17-201ENST00000578528 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.47■■■■□ 3.27
RPL17-201ENST00000578528 ROCK1Q13464 1354 aa35.43■■■■□ 3.26
RPL17-201ENST00000578528 ITGAEP38570 1179 aa35.42■■■■□ 3.26
RPL17-201ENST00000578528 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.42■■■■□ 3.26
RPL17-201ENST00000578528 NCOA1Q15788 1441 aa35.41■■■■□ 3.26
RPL17-201ENST00000578528 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.41■■■■□ 3.26
RPL17-201ENST00000578528 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.4■■■■□ 3.26
RPL17-201ENST00000578528 ATP10AO60312 1499 aa35.4■■■■□ 3.26
RPL17-201ENST00000578528 REREQ9P2R6 1566 aa35.39■■■■□ 3.26
RPL17-201ENST00000578528 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
RPL17-201ENST00000578528 KIF15Q9NS87 1388 aa35.33■■■■□ 3.25
RPL17-201ENST00000578528 A2MP01023 1474 aa35.33■■■■□ 3.25
RPL17-201ENST00000578528 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.32■■■■□ 3.24
RPL17-201ENST00000578528 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
RPL17-201ENST00000578528 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.28■■■■□ 3.24
RPL17-201ENST00000578528 AGLP35573 1532 aa35.26■■■■□ 3.23
RPL17-201ENST00000578528 HFM1A2PYH4 1435 aa35.24■■■■□ 3.23
RPL17-201ENST00000578528 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.24■■■■□ 3.23
RPL17-201ENST00000578528 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.24■■■■□ 3.23
RPL17-201ENST00000578528 ERBINQ96RT1 1412 aa35.23■■■■□ 3.23
RPL17-201ENST00000578528 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.22■■■■□ 3.23
RPL17-201ENST00000578528 NAIPQ13075 1403 aa35.21■■■■□ 3.23
RPL17-201ENST00000578528 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
RPL17-201ENST00000578528 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.18■■■■□ 3.22
RPL17-201ENST00000578528 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
RPL17-201ENST00000578528 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.06■■■■□ 3.2
RPL17-201ENST00000578528 KIF3BO15066 747 aa35.06■■■■□ 3.2
RPL17-201ENST00000578528 DEPDC5O75140 1603 aa35.05■■■■□ 3.2
RPL17-201ENST00000578528 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
RPL17-201ENST00000578528 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.01■■■■□ 3.19
RPL17-201ENST00000578528 UNC13BO14795 1591 aa35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms