RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577315.5

MKS1-205, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKS1, Length 495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-205ENST00000577315 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
MKS1-205ENST00000577315 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.25■■□□□ 1.47
MKS1-205ENST00000577315 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.24■■□□□ 1.47
MKS1-205ENST00000577315 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.24■■□□□ 1.47
MKS1-205ENST00000577315 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.23■■□□□ 1.47
MKS1-205ENST00000577315 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.22■■□□□ 1.47
MKS1-205ENST00000577315 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.2■■□□□ 1.47
MKS1-205ENST00000577315 PTPRMP28827 1452 aa24.19■■□□□ 1.46
MKS1-205ENST00000577315 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.18■■□□□ 1.46
MKS1-205ENST00000577315 MADDQ8WXG6 1647 aa24.17■■□□□ 1.46
MKS1-205ENST00000577315 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.15■■□□□ 1.46
MKS1-205ENST00000577315 PREX2Q70Z35 1606 aa24.15■■□□□ 1.46
MKS1-205ENST00000577315 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.15■■□□□ 1.46
MKS1-205ENST00000577315 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MKS1-205ENST00000577315 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.1■■□□□ 1.45
MKS1-205ENST00000577315 ATP10AO60312 1499 aa24.1■■□□□ 1.45
MKS1-205ENST00000577315 KDM5CP41229 1560 aa24.1■■□□□ 1.45
MKS1-205ENST00000577315 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.09■■□□□ 1.45
MKS1-205ENST00000577315 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.08■■□□□ 1.45
MKS1-205ENST00000577315 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.06■■□□□ 1.44
MKS1-205ENST00000577315 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.05■■□□□ 1.44
MKS1-205ENST00000577315 ABCC1P33527 1531 aa24.05■■□□□ 1.44
MKS1-205ENST00000577315 AFAP1Q8N556 730 aa24.03■■□□□ 1.44
MKS1-205ENST00000577315 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.01■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.01■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 REREQ9P2R6 1566 aa24■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.99■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 MLECQ14165 292 aa23.98■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 CEP162Q5TB80 1403 aa23.98■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.98■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.97■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.96■■□□□ 1.43
MKS1-205ENST00000577315 ABCA6Q8N139 1617 aa23.95■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.94■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.93■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.93■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.92■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.92■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.92■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 AGLP35573 1532 aa23.9■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
MKS1-205ENST00000577315 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.89■■□□□ 1.41
MKS1-205ENST00000577315 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.89■■□□□ 1.41
MKS1-205ENST00000577315 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.87■■□□□ 1.41
MKS1-205ENST00000577315 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.83■■□□□ 1.41
MKS1-205ENST00000577315 TIAM1Q13009 1591 aa23.83■■□□□ 1.41
MKS1-205ENST00000577315 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
MKS1-205ENST00000577315 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
MKS1-205ENST00000577315 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
MKS1-205ENST00000577315 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
MKS1-205ENST00000577315 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
MKS1-205ENST00000577315 ATP7AQ04656 1500 aa23.8■■□□□ 1.4
MKS1-205ENST00000577315 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
MKS1-205ENST00000577315 C3P01024 1663 aa23.76■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.76■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.76■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.74■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.74■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 HSPA2P54652 639 aa23.74■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 MROH2AA6NES4 1674 aa23.73■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 NCOA2Q15596 1464 aa23.72■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 A2MP01023 1474 aa23.71■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.71■■□□□ 1.39
MKS1-205ENST00000577315 PLXNC1O60486 1568 aa23.7■■□□□ 1.38
MKS1-205ENST00000577315 MBD5Q9P267 1494 aa23.7■■□□□ 1.38
MKS1-205ENST00000577315 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.69■■□□□ 1.38
MKS1-205ENST00000577315 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.69■■□□□ 1.38
MKS1-205ENST00000577315 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
MKS1-205ENST00000577315 MAP3K1Q13233 1512 aa23.68■■□□□ 1.38
MKS1-205ENST00000577315 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.66■■□□□ 1.38
MKS1-205ENST00000577315 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.64■■□□□ 1.38
MKS1-205ENST00000577315 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.64■■□□□ 1.38
MKS1-205ENST00000577315 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.64■■□□□ 1.37
MKS1-205ENST00000577315 FBXO41Q8TF61 875 aa23.62■■□□□ 1.37
MKS1-205ENST00000577315 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
MKS1-205ENST00000577315 NPATQ14207 1427 aa23.61■■□□□ 1.37
MKS1-205ENST00000577315 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.61■■□□□ 1.37
MKS1-205ENST00000577315 ZMYM3Q14202 1370 aa23.6■■□□□ 1.37
MKS1-205ENST00000577315 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.6■■□□□ 1.37
MKS1-205ENST00000577315 STRCQ7RTU9 1775 aa23.6■■□□□ 1.37
MKS1-205ENST00000577315 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
MKS1-205ENST00000577315 GGT6Q6P531 493 aa23.57■■□□□ 1.36
MKS1-205ENST00000577315 TSPY4P0CV99 314 aa23.55■■□□□ 1.36
MKS1-205ENST00000577315 TSPY10P0CW01 314 aa23.55■■□□□ 1.36
MKS1-205ENST00000577315 MIA2Q96PC5 1412 aa23.53■■□□□ 1.36
MKS1-205ENST00000577315 APLP2Q06481 763 aa23.52■■□□□ 1.36
MKS1-205ENST00000577315 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.52■■□□□ 1.36
MKS1-205ENST00000577315 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
MKS1-205ENST00000577315 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.5■■□□□ 1.35
MKS1-205ENST00000577315 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.49■■□□□ 1.35
MKS1-205ENST00000577315 PTPRTO14522 1441 aa23.49■■□□□ 1.35
MKS1-205ENST00000577315 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
MKS1-205ENST00000577315 PTPRKQ15262 1439 aa23.48■■□□□ 1.35
MKS1-205ENST00000577315 KIF3BO15066 747 aa23.47■■□□□ 1.35
MKS1-205ENST00000577315 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.46■■□□□ 1.35
MKS1-205ENST00000577315 CERKQ8TCT0 537 aa23.46■■□□□ 1.35
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