RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575061.2

MCRIP1-208, Transcript of MAPK regulated corepressor interacting protein 1, human

TSL 5 BASIC

Gene MCRIP1, Length 618 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MCRIP1-208	ENST00000575061	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.03	■■■□□ 2.88
MCRIP1-208	ENST00000575061	NEO1	Q92859	1461 aa		33.02	■■■□□ 2.88
MCRIP1-208	ENST00000575061	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.01	■■■□□ 2.87
MCRIP1-208	ENST00000575061	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33	■■■□□ 2.87
MCRIP1-208	ENST00000575061	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
MCRIP1-208	ENST00000575061	FANCA	O15360	1455 aa		32.99	■■■□□ 2.87
MCRIP1-208	ENST00000575061	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.96	■■■□□ 2.87
MCRIP1-208	ENST00000575061	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
MCRIP1-208	ENST00000575061	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.94	■■■□□ 2.86
MCRIP1-208	ENST00000575061	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
MCRIP1-208	ENST00000575061	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MCRIP1-208	ENST00000575061	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.89	■■■□□ 2.86
MCRIP1-208	ENST00000575061	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86
MCRIP1-208	ENST00000575061	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.88	■■■□□ 2.85
MCRIP1-208	ENST00000575061	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
MCRIP1-208	ENST00000575061	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
MCRIP1-208	ENST00000575061	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.85	■■■□□ 2.85
MCRIP1-208	ENST00000575061	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.84	■■■□□ 2.85
MCRIP1-208	ENST00000575061	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MCRIP1-208	ENST00000575061	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MCRIP1-208	ENST00000575061	ABCC1	P33527	1531 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MCRIP1-208	ENST00000575061	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MCRIP1-208	ENST00000575061	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
MCRIP1-208	ENST00000575061	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.75	■■■□□ 2.83
MCRIP1-208	ENST00000575061	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MCRIP1-208	ENST00000575061	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
MCRIP1-208	ENST00000575061	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.71	■■■□□ 2.83
MCRIP1-208	ENST00000575061	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.71	■■■□□ 2.83
MCRIP1-208	ENST00000575061	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.71	■■■□□ 2.83
MCRIP1-208	ENST00000575061	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.82
MCRIP1-208	ENST00000575061	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MCRIP1-208	ENST00000575061	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.67	■■■□□ 2.82
MCRIP1-208	ENST00000575061	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
MCRIP1-208	ENST00000575061	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.66	■■■□□ 2.82
MCRIP1-208	ENST00000575061	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
MCRIP1-208	ENST00000575061	KDM6B	O15054	1643 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.62	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	KDM5C	P41229	1560 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.61	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	DAPK1	P53355	1430 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MCRIP1-208	ENST00000575061	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MCRIP1-208	ENST00000575061	ABCC5	O15440	1437 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MCRIP1-208	ENST00000575061	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MCRIP1-208	ENST00000575061	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MCRIP1-208	ENST00000575061	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MCRIP1-208	ENST00000575061	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
MCRIP1-208	ENST00000575061	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MCRIP1-208	ENST00000575061	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MCRIP1-208	ENST00000575061	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
MCRIP1-208	ENST00000575061	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MCRIP1-208	ENST00000575061	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MCRIP1-208	ENST00000575061	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MCRIP1-208	ENST00000575061	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MCRIP1-208	ENST00000575061	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
MCRIP1-208	ENST00000575061	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MCRIP1-208	ENST00000575061	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MCRIP1-208	ENST00000575061	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.45	■■■□□ 2.78
MCRIP1-208	ENST00000575061	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MCRIP1-208	ENST00000575061	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MCRIP1-208	ENST00000575061	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MCRIP1-208	ENST00000575061	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MCRIP1-208	ENST00000575061	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MCRIP1-208	ENST00000575061	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MCRIP1-208	ENST00000575061	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MCRIP1-208	ENST00000575061	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MCRIP1-208	ENST00000575061	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MCRIP1-208	ENST00000575061	ITGAE	P38570	1179 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MCRIP1-208	ENST00000575061	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.32	■■■□□ 2.77
MCRIP1-208	ENST00000575061	ATP10A	O60312	1499 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MCRIP1-208	ENST00000575061	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MCRIP1-208	ENST00000575061	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MCRIP1-208	ENST00000575061	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MCRIP1-208	ENST00000575061	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MCRIP1-208	ENST00000575061	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MCRIP1-208	ENST00000575061	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.26	■■■□□ 2.76
MCRIP1-208	ENST00000575061	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.26	■■■□□ 2.76
MCRIP1-208	ENST00000575061	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
MCRIP1-208	ENST00000575061	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
MCRIP1-208	ENST00000575061	A2M	P01023	1474 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MCRIP1-208	ENST00000575061	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MCRIP1-208	ENST00000575061	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.2	■■■□□ 2.75
MCRIP1-208	ENST00000575061	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.2	■■■□□ 2.74
MCRIP1-208	ENST00000575061	AGL	P35573	1532 aa		32.2	■■■□□ 2.74
MCRIP1-208	ENST00000575061	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
MCRIP1-208	ENST00000575061	NAIP	Q13075	1403 aa		32.17	■■■□□ 2.74
MCRIP1-208	ENST00000575061	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.17	■■■□□ 2.74
MCRIP1-208	ENST00000575061	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.16	■■■□□ 2.74
MCRIP1-208	ENST00000575061	HRC	P23327	699 aa		32.11	■■■□□ 2.73
MCRIP1-208	ENST00000575061	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MCRIP1-208	ENST00000575061	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MCRIP1-208	ENST00000575061	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MCRIP1-208	ENST00000575061	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
MCRIP1-208	ENST00000575061	KIF3B	O15066	747 aa		32	■■■□□ 2.71
MCRIP1-208	ENST00000575061	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.99	■■■□□ 2.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms