RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574157.5

NOMO3-211, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 3

Gene NOMO3, Length 821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-211ENST00000574157 ADGRL1O94910 1474 aa13.8□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.8□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.8□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 ARID3CA6NKF2 412 aa13.79□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.79□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 PREX2Q70Z35 1606 aa13.79□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.78□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.78□□□□□ -0.2
NOMO3-211ENST00000574157 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.77□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.77□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.76□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.74□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.74□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 GLI2P10070 1586 aa13.74□□□□□ -0.21
NOMO3-211ENST00000574157 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.7□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.7□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.69□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.68□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 PLCH2O75038 1416 aa13.68□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 KCNH8Q96L42 1107 aa13.68□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.67□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.67□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.66□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.66□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.66□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.65□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.65□□□□□ -0.22
NOMO3-211ENST00000574157 AKNAQ7Z591 1439 aa13.64□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 ABCC1P33527 1531 aa13.64□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.64□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.64□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 DAPK1P53355 1430 aa13.62□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 CD109Q6YHK3 1445 aa13.62□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 MBD5Q9P267 1494 aa13.61□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 FANCAO15360 1455 aa13.6□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 ADGRL2O95490 1459 aa13.6□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.59□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.59□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 ABCC5O15440 1437 aa13.59□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 PTPRKQ15262 1439 aa13.59□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.59□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 NEO1Q92859 1461 aa13.59□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.59□□□□□ -0.23
NOMO3-211ENST00000574157 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.58□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 ROCK1Q13464 1354 aa13.58□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 HFM1A2PYH4 1435 aa13.57□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.57□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.55□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 PLXNC1O60486 1568 aa13.54□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.54□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.53□□□□□ -0.24
NOMO3-211ENST00000574157 NAIPQ13075 1403 aa13.52□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 KDM5CP41229 1560 aa13.52□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.5□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.5□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.5□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.49□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.49□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 NCOA1Q15788 1441 aa13.49□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 FBXO41Q8TF61 875 aa13.49□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.48□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 HRCP23327 699 aa13.48□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.47□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.47□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.46□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 ATP7AQ04656 1500 aa13.46□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.46□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 ITGAEP38570 1179 aa13.46□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 RICTORQ6R327 1708 aa13.46□□□□□ -0.25
NOMO3-211ENST00000574157 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.45□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 RAPGEF3O95398 923 aa13.45□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.44□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 PTPRMP28827 1452 aa13.43□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.43□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 TSPY4P0CV99 314 aa13.42□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 TSPY10P0CW01 314 aa13.42□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 KIF15Q9NS87 1388 aa13.42□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 ERBINQ96RT1 1412 aa13.41□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.41□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.4□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.4□□□□□ -0.26
NOMO3-211ENST00000574157 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms