RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.39■■□□□ 1.82
ITGAE-202ENST00000570360 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.38■■□□□ 1.81
ITGAE-202ENST00000570360 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.38■■□□□ 1.81
ITGAE-202ENST00000570360 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.37■■□□□ 1.81
ITGAE-202ENST00000570360 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.37■■□□□ 1.81
ITGAE-202ENST00000570360 MIA2Q96PC5 1412 aa26.36■■□□□ 1.81
ITGAE-202ENST00000570360 FANCAO15360 1455 aa26.33■■□□□ 1.81
ITGAE-202ENST00000570360 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ITGAE-202ENST00000570360 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ITGAE-202ENST00000570360 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
ITGAE-202ENST00000570360 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.3■■□□□ 1.8
ITGAE-202ENST00000570360 ABCC1P33527 1531 aa26.3■■□□□ 1.8
ITGAE-202ENST00000570360 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
ITGAE-202ENST00000570360 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.3■■□□□ 1.8
ITGAE-202ENST00000570360 NEO1Q92859 1461 aa26.29■■□□□ 1.8
ITGAE-202ENST00000570360 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.24■■□□□ 1.79
ITGAE-202ENST00000570360 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.24■■□□□ 1.79
ITGAE-202ENST00000570360 AKNAQ7Z591 1439 aa26.23■■□□□ 1.79
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
ITGAE-202ENST00000570360 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.22■■□□□ 1.79
ITGAE-202ENST00000570360 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.22■■□□□ 1.79
ITGAE-202ENST00000570360 ADGRL1O94910 1474 aa26.21■■□□□ 1.79
ITGAE-202ENST00000570360 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.21■■□□□ 1.79
ITGAE-202ENST00000570360 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
ITGAE-202ENST00000570360 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.2■■□□□ 1.78
ITGAE-202ENST00000570360 RICTORQ6R327 1708 aa26.19■■□□□ 1.78
ITGAE-202ENST00000570360 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.18■■□□□ 1.78
ITGAE-202ENST00000570360 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
ITGAE-202ENST00000570360 MBD5Q9P267 1494 aa26.17■■□□□ 1.78
ITGAE-202ENST00000570360 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.16■■□□□ 1.78
ITGAE-202ENST00000570360 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.14■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.11■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.11■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.11■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 KDM5CP41229 1560 aa26.1■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 DAPK1P53355 1430 aa26.08■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 KDM6BO15054 1643 aa26.08■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
ITGAE-202ENST00000570360 ABCC5O15440 1437 aa26.07■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.07■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.06■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.06■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.04■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.04■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 PTPRKQ15262 1439 aa26.03■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.02■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.02■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.02■■□□□ 1.76
ITGAE-202ENST00000570360 RAPGEF3O95398 923 aa25.98■■□□□ 1.75
ITGAE-202ENST00000570360 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
ITGAE-202ENST00000570360 AFAP1Q8N556 730 aa25.98■■□□□ 1.75
ITGAE-202ENST00000570360 ATP7AQ04656 1500 aa25.98■■□□□ 1.75
ITGAE-202ENST00000570360 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.97■■□□□ 1.75
ITGAE-202ENST00000570360 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.97■■□□□ 1.75
ITGAE-202ENST00000570360 PLXNC1O60486 1568 aa25.97■■□□□ 1.75
ITGAE-202ENST00000570360 ADGRL2O95490 1459 aa25.95■■□□□ 1.74
ITGAE-202ENST00000570360 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.95■■□□□ 1.74
ITGAE-202ENST00000570360 ABCA6Q8N139 1617 aa25.94■■□□□ 1.74
ITGAE-202ENST00000570360 ITGAEP38570 1179 aa25.93■■□□□ 1.74
ITGAE-202ENST00000570360 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.92■■□□□ 1.74
ITGAE-202ENST00000570360 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.91■■□□□ 1.74
ITGAE-202ENST00000570360 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.9■■□□□ 1.74
ITGAE-202ENST00000570360 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.9■■□□□ 1.74
ITGAE-202ENST00000570360 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ITGAE-202ENST00000570360 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.88■■□□□ 1.73
ITGAE-202ENST00000570360 ROCK1Q13464 1354 aa25.87■■□□□ 1.73
ITGAE-202ENST00000570360 TSPY4P0CV99 314 aa25.87■■□□□ 1.73
ITGAE-202ENST00000570360 TSPY10P0CW01 314 aa25.87■■□□□ 1.73
ITGAE-202ENST00000570360 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.86■■□□□ 1.73
ITGAE-202ENST00000570360 NCOA1Q15788 1441 aa25.86■■□□□ 1.73
ITGAE-202ENST00000570360 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.85■■□□□ 1.73
ITGAE-202ENST00000570360 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.82■■□□□ 1.72
ITGAE-202ENST00000570360 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.8■■□□□ 1.72
ITGAE-202ENST00000570360 HFM1A2PYH4 1435 aa25.8■■□□□ 1.72
ITGAE-202ENST00000570360 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.79■■□□□ 1.72
ITGAE-202ENST00000570360 KIF15Q9NS87 1388 aa25.79■■□□□ 1.72
ITGAE-202ENST00000570360 REREQ9P2R6 1566 aa25.78■■□□□ 1.72
ITGAE-202ENST00000570360 NAIPQ13075 1403 aa25.78■■□□□ 1.72
ITGAE-202ENST00000570360 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.76■■□□□ 1.71
ITGAE-202ENST00000570360 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ITGAE-202ENST00000570360 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.74■■□□□ 1.71
ITGAE-202ENST00000570360 ATP10AO60312 1499 aa25.74■■□□□ 1.71
ITGAE-202ENST00000570360 A2MP01023 1474 aa25.74■■□□□ 1.71
ITGAE-202ENST00000570360 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.74■■□□□ 1.71
ITGAE-202ENST00000570360 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.73■■□□□ 1.71
ITGAE-202ENST00000570360 ERBINQ96RT1 1412 aa25.71■■□□□ 1.71
ITGAE-202ENST00000570360 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.69■■□□□ 1.7
ITGAE-202ENST00000570360 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
ITGAE-202ENST00000570360 DEPDC5O75140 1603 aa25.67■■□□□ 1.7
ITGAE-202ENST00000570360 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.67■■□□□ 1.7
ITGAE-202ENST00000570360 AGLP35573 1532 aa25.67■■□□□ 1.7
ITGAE-202ENST00000570360 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
ITGAE-202ENST00000570360 UNC13BO14795 1591 aa25.65■■□□□ 1.7
ITGAE-202ENST00000570360 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.63■■□□□ 1.69
ITGAE-202ENST00000570360 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.61■■□□□ 1.69
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