RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.85■■■■□ 3.17
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.84■■■■□ 3.17
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.84■■■■□ 3.17
CDIPT-210ENST00000570016 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.84■■■■□ 3.17
CDIPT-210ENST00000570016 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.83■■■■□ 3.17
CDIPT-210ENST00000570016 PREX2Q70Z35 1606 aa34.83■■■■□ 3.17
CDIPT-210ENST00000570016 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.75■■■■□ 3.15
CDIPT-210ENST00000570016 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.74■■■■□ 3.15
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.73■■■■□ 3.15
CDIPT-210ENST00000570016 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.71■■■■□ 3.15
CDIPT-210ENST00000570016 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.71■■■■□ 3.15
CDIPT-210ENST00000570016 KDM5CP41229 1560 aa34.7■■■■□ 3.15
CDIPT-210ENST00000570016 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
CDIPT-210ENST00000570016 ABCC1P33527 1531 aa34.68■■■■□ 3.14
CDIPT-210ENST00000570016 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.68■■■■□ 3.14
CDIPT-210ENST00000570016 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.68■■■■□ 3.14
CDIPT-210ENST00000570016 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.67■■■■□ 3.14
CDIPT-210ENST00000570016 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.66■■■■□ 3.14
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.63■■■■□ 3.13
CDIPT-210ENST00000570016 AFAP1Q8N556 730 aa34.6■■■■□ 3.13
CDIPT-210ENST00000570016 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.59■■■■□ 3.13
CDIPT-210ENST00000570016 ATP10AO60312 1499 aa34.59■■■■□ 3.13
CDIPT-210ENST00000570016 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.58■■■■□ 3.13
CDIPT-210ENST00000570016 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.58■■■■□ 3.13
CDIPT-210ENST00000570016 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.58■■■■□ 3.13
CDIPT-210ENST00000570016 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.58■■■■□ 3.13
CDIPT-210ENST00000570016 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.58■■■■□ 3.13
CDIPT-210ENST00000570016 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
CDIPT-210ENST00000570016 TIAM1Q13009 1591 aa34.56■■■■□ 3.12
CDIPT-210ENST00000570016 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.56■■■■□ 3.12
CDIPT-210ENST00000570016 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.54■■■■□ 3.12
CDIPT-210ENST00000570016 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.53■■■■□ 3.12
CDIPT-210ENST00000570016 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
CDIPT-210ENST00000570016 PTPRMP28827 1452 aa34.51■■■■□ 3.12
CDIPT-210ENST00000570016 MAP3K1Q13233 1512 aa34.51■■■■□ 3.11
CDIPT-210ENST00000570016 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.5■■■■□ 3.11
CDIPT-210ENST00000570016 MADDQ8WXG6 1647 aa34.5■■■■□ 3.11
CDIPT-210ENST00000570016 REREQ9P2R6 1566 aa34.49■■■■□ 3.11
CDIPT-210ENST00000570016 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.49■■■■□ 3.11
CDIPT-210ENST00000570016 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.47■■■■□ 3.11
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CDIPT-210ENST00000570016 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
CDIPT-210ENST00000570016 NCOA2Q15596 1464 aa34.44■■■■□ 3.1
CDIPT-210ENST00000570016 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.44■■■■□ 3.1
CDIPT-210ENST00000570016 ABCA6Q8N139 1617 aa34.44■■■■□ 3.1
CDIPT-210ENST00000570016 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.42■■■■□ 3.1
CDIPT-210ENST00000570016 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
CDIPT-210ENST00000570016 AGLP35573 1532 aa34.36■■■■□ 3.09
CDIPT-210ENST00000570016 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
CDIPT-210ENST00000570016 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.35■■■■□ 3.09
CDIPT-210ENST00000570016 MBD5Q9P267 1494 aa34.34■■■■□ 3.09
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
CDIPT-210ENST00000570016 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
CDIPT-210ENST00000570016 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
CDIPT-210ENST00000570016 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
CDIPT-210ENST00000570016 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.29■■■■□ 3.08
CDIPT-210ENST00000570016 ATP7AQ04656 1500 aa34.29■■■■□ 3.08
CDIPT-210ENST00000570016 MLECQ14165 292 aa34.28■■■■□ 3.08
CDIPT-210ENST00000570016 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.23■■■■□ 3.07
CDIPT-210ENST00000570016 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.22■■■■□ 3.07
CDIPT-210ENST00000570016 PLXNC1O60486 1568 aa34.19■■■■□ 3.06
CDIPT-210ENST00000570016 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.19■■■■□ 3.06
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.17■■■■□ 3.06
CDIPT-210ENST00000570016 MIA2Q96PC5 1412 aa34.15■■■■□ 3.06
CDIPT-210ENST00000570016 A2MP01023 1474 aa34.14■■■■□ 3.06
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.14■■■■□ 3.06
CDIPT-210ENST00000570016 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.14■■■■□ 3.06
CDIPT-210ENST00000570016 APLP2Q06481 763 aa34.12■■■■□ 3.05
CDIPT-210ENST00000570016 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.12■■■■□ 3.05
CDIPT-210ENST00000570016 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.11■■■■□ 3.05
CDIPT-210ENST00000570016 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.05■■■■□ 3.04
CDIPT-210ENST00000570016 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
CDIPT-210ENST00000570016 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
CDIPT-210ENST00000570016 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.99■■■■□ 3.03
CDIPT-210ENST00000570016 C3P01024 1663 aa33.99■■■■□ 3.03
CDIPT-210ENST00000570016 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.98■■■■□ 3.03
CDIPT-210ENST00000570016 TSPY4P0CV99 314 aa33.97■■■■□ 3.03
CDIPT-210ENST00000570016 TSPY10P0CW01 314 aa33.97■■■■□ 3.03
CDIPT-210ENST00000570016 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CDIPT-210ENST00000570016 MROH2AA6NES4 1674 aa33.96■■■■□ 3.03
CDIPT-210ENST00000570016 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.95■■■■□ 3.03
CDIPT-210ENST00000570016 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
CDIPT-210ENST00000570016 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.94■■■■□ 3.02
CDIPT-210ENST00000570016 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.9■■■■□ 3.02
CDIPT-210ENST00000570016 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.89■■■■□ 3.02
CDIPT-210ENST00000570016 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
CDIPT-210ENST00000570016 ZMYM3Q14202 1370 aa33.87■■■■□ 3.01
CDIPT-210ENST00000570016 GGT6Q6P531 493 aa33.86■■■■□ 3.01
CDIPT-210ENST00000570016 NPATQ14207 1427 aa33.84■■■■□ 3.01
CDIPT-210ENST00000570016 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
CDIPT-210ENST00000570016 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.84■■■■□ 3.01
CDIPT-210ENST00000570016 HSPA2P54652 639 aa33.83■■■■□ 3.01
CDIPT-210ENST00000570016 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.83■■■■□ 3.01
CDIPT-210ENST00000570016 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.83■■■■□ 3.01
CDIPT-210ENST00000570016 ABCC5O15440 1437 aa33.81■■■■□ 3
CDIPT-210ENST00000570016 KIF3BO15066 747 aa33.8■■■■□ 3
CDIPT-210ENST00000570016 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.79■■■■□ 3
CDIPT-210ENST00000570016 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
CDIPT-210ENST00000570016 DAPK1P53355 1430 aa33.76■■■□□ 2.99
CDIPT-210ENST00000570016 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.4 ms