RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 CEP162Q5TB80 1403 aa23.25■■□□□ 1.31
CMTM3-215ENST00000568477 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.25■■□□□ 1.31
CMTM3-215ENST00000568477 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-215ENST00000568477 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-215ENST00000568477 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.21■■□□□ 1.31
CMTM3-215ENST00000568477 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.18■■□□□ 1.3
CMTM3-215ENST00000568477 PREX2Q70Z35 1606 aa23.18■■□□□ 1.3
CMTM3-215ENST00000568477 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.16■■□□□ 1.3
CMTM3-215ENST00000568477 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.16■■□□□ 1.3
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.15■■□□□ 1.3
CMTM3-215ENST00000568477 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.14■■□□□ 1.3
CMTM3-215ENST00000568477 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.12■■□□□ 1.29
CMTM3-215ENST00000568477 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.11■■□□□ 1.29
CMTM3-215ENST00000568477 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.1■■□□□ 1.29
CMTM3-215ENST00000568477 KDM5CP41229 1560 aa23.1■■□□□ 1.29
CMTM3-215ENST00000568477 ABCC1P33527 1531 aa23.09■■□□□ 1.29
CMTM3-215ENST00000568477 AFAP1Q8N556 730 aa23.09■■□□□ 1.29
CMTM3-215ENST00000568477 PTPRMP28827 1452 aa23.09■■□□□ 1.29
CMTM3-215ENST00000568477 MADDQ8WXG6 1647 aa23.08■■□□□ 1.29
CMTM3-215ENST00000568477 ATP10AO60312 1499 aa23.07■■□□□ 1.28
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CMTM3-215ENST00000568477 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.05■■□□□ 1.28
CMTM3-215ENST00000568477 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.04■■□□□ 1.28
CMTM3-215ENST00000568477 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.04■■□□□ 1.28
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.04■■□□□ 1.28
CMTM3-215ENST00000568477 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.04■■□□□ 1.28
CMTM3-215ENST00000568477 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.04■■□□□ 1.28
CMTM3-215ENST00000568477 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.04■■□□□ 1.28
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
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CMTM3-215ENST00000568477 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CMTM3-215ENST00000568477 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23■■□□□ 1.27
CMTM3-215ENST00000568477 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.99■■□□□ 1.27
CMTM3-215ENST00000568477 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.98■■□□□ 1.27
CMTM3-215ENST00000568477 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.98■■□□□ 1.27
CMTM3-215ENST00000568477 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.98■■□□□ 1.27
CMTM3-215ENST00000568477 ABCA6Q8N139 1617 aa22.96■■□□□ 1.27
CMTM3-215ENST00000568477 TIAM1Q13009 1591 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-215ENST00000568477 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.95■■□□□ 1.26
CMTM3-215ENST00000568477 REREQ9P2R6 1566 aa22.94■■□□□ 1.26
CMTM3-215ENST00000568477 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
CMTM3-215ENST00000568477 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.92■■□□□ 1.26
CMTM3-215ENST00000568477 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.91■■□□□ 1.26
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CMTM3-215ENST00000568477 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CMTM3-215ENST00000568477 NCOA2Q15596 1464 aa22.89■■□□□ 1.25
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CMTM3-215ENST00000568477 AGLP35573 1532 aa22.87■■□□□ 1.25
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CMTM3-215ENST00000568477 ATP7AQ04656 1500 aa22.85■■□□□ 1.25
CMTM3-215ENST00000568477 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.85■■□□□ 1.25
CMTM3-215ENST00000568477 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CMTM3-215ENST00000568477 MAP3K1Q13233 1512 aa22.82■■□□□ 1.24
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CMTM3-215ENST00000568477 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 A2MP01023 1474 aa22.76■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 PLXNC1O60486 1568 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.74■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.73■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 APLP2Q06481 763 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.72■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.71■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 HSPA2P54652 639 aa22.71■■□□□ 1.23
CMTM3-215ENST00000568477 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-215ENST00000568477 C3P01024 1663 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-215ENST00000568477 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM3-215ENST00000568477 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-215ENST00000568477 MIA2Q96PC5 1412 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-215ENST00000568477 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-215ENST00000568477 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
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CMTM3-215ENST00000568477 MROH2AA6NES4 1674 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-215ENST00000568477 TSPY4P0CV99 314 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-215ENST00000568477 TSPY10P0CW01 314 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-215ENST00000568477 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-215ENST00000568477 ZMYM3Q14202 1370 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-215ENST00000568477 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CMTM3-215ENST00000568477 NPATQ14207 1427 aa22.57■■□□□ 1.2
CMTM3-215ENST00000568477 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.56■■□□□ 1.2
CMTM3-215ENST00000568477 KIF3BO15066 747 aa22.56■■□□□ 1.2
CMTM3-215ENST00000568477 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CMTM3-215ENST00000568477 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.51■■□□□ 1.19
CMTM3-215ENST00000568477 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.51■■□□□ 1.19
CMTM3-215ENST00000568477 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.5■■□□□ 1.19
CMTM3-215ENST00000568477 PTPRKQ15262 1439 aa22.49■■□□□ 1.19
CMTM3-215ENST00000568477 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.48■■□□□ 1.19
CMTM3-215ENST00000568477 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CMTM3-215ENST00000568477 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.47■■□□□ 1.19
CMTM3-215ENST00000568477 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.46■■□□□ 1.19
CMTM3-215ENST00000568477 ABCC5O15440 1437 aa22.46■■□□□ 1.19
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