RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 PLCH2O75038 1416 aa28.71■■■□□ 2.19
SPNS1-210ENST00000568388 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.71■■■□□ 2.19
SPNS1-210ENST00000568388 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.7■■■□□ 2.19
SPNS1-210ENST00000568388 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
SPNS1-210ENST00000568388 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
SPNS1-210ENST00000568388 CD109Q6YHK3 1445 aa28.66■■■□□ 2.18
SPNS1-210ENST00000568388 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.64■■■□□ 2.17
SPNS1-210ENST00000568388 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.63■■■□□ 2.17
SPNS1-210ENST00000568388 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SPNS1-210ENST00000568388 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
SPNS1-210ENST00000568388 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.61■■■□□ 2.17
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SPNS1-210ENST00000568388 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.59■■■□□ 2.17
SPNS1-210ENST00000568388 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
SPNS1-210ENST00000568388 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.54■■■□□ 2.16
SPNS1-210ENST00000568388 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.54■■■□□ 2.16
SPNS1-210ENST00000568388 FANCAO15360 1455 aa28.53■■■□□ 2.16
SPNS1-210ENST00000568388 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.53■■■□□ 2.16
SPNS1-210ENST00000568388 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.52■■■□□ 2.16
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
SPNS1-210ENST00000568388 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SPNS1-210ENST00000568388 NEO1Q92859 1461 aa28.5■■■□□ 2.15
SPNS1-210ENST00000568388 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.49■■■□□ 2.15
SPNS1-210ENST00000568388 AKNAQ7Z591 1439 aa28.46■■■□□ 2.15
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC1P33527 1531 aa28.45■■■□□ 2.15
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-210ENST00000568388 MBD5Q9P267 1494 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-210ENST00000568388 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-210ENST00000568388 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-210ENST00000568388 ADGRL1O94910 1474 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-210ENST00000568388 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.39■■■□□ 2.14
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.39■■■□□ 2.14
SPNS1-210ENST00000568388 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-210ENST00000568388 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.37■■■□□ 2.13
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC5O15440 1437 aa28.36■■■□□ 2.13
SPNS1-210ENST00000568388 DAPK1P53355 1430 aa28.36■■■□□ 2.13
SPNS1-210ENST00000568388 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.36■■■□□ 2.13
SPNS1-210ENST00000568388 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-210ENST00000568388 PTPRKQ15262 1439 aa28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-210ENST00000568388 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-210ENST00000568388 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.3■■■□□ 2.12
SPNS1-210ENST00000568388 ITGAEP38570 1179 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-210ENST00000568388 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.29■■■□□ 2.12
SPNS1-210ENST00000568388 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-210ENST00000568388 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-210ENST00000568388 TSPY4P0CV99 314 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-210ENST00000568388 TSPY10P0CW01 314 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.26■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 RICTORQ6R327 1708 aa28.26■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.26■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.24■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 AFAP1Q8N556 730 aa28.23■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 KDM5CP41229 1560 aa28.23■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 ADGRL2O95490 1459 aa28.22■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.22■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 ROCK1Q13464 1354 aa28.22■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.21■■■□□ 2.11
SPNS1-210ENST00000568388 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.18■■■□□ 2.1
SPNS1-210ENST00000568388 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.18■■■□□ 2.1
SPNS1-210ENST00000568388 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SPNS1-210ENST00000568388 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
SPNS1-210ENST00000568388 NCOA1Q15788 1441 aa28.17■■■□□ 2.1
SPNS1-210ENST00000568388 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.16■■■□□ 2.1
SPNS1-210ENST00000568388 RAPGEF3O95398 923 aa28.16■■■□□ 2.1
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.15■■■□□ 2.1
SPNS1-210ENST00000568388 PLXNC1O60486 1568 aa28.14■■■□□ 2.1
SPNS1-210ENST00000568388 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.14■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.13■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.13■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 ATP7AQ04656 1500 aa28.13■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.12■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 HFM1A2PYH4 1435 aa28.12■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.1■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.09■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 NAIPQ13075 1403 aa28.09■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.08■■■□□ 2.09
SPNS1-210ENST00000568388 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.06■■■□□ 2.08
SPNS1-210ENST00000568388 KIF15Q9NS87 1388 aa28.04■■■□□ 2.08
SPNS1-210ENST00000568388 HRCP23327 699 aa28.02■■■□□ 2.08
SPNS1-210ENST00000568388 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.02■■■□□ 2.08
SPNS1-210ENST00000568388 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.01■■■□□ 2.07
SPNS1-210ENST00000568388 ABCA6Q8N139 1617 aa28■■■□□ 2.07
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.99■■■□□ 2.07
SPNS1-210ENST00000568388 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.98■■■□□ 2.07
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.96■■■□□ 2.07
SPNS1-210ENST00000568388 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SPNS1-210ENST00000568388 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.95■■■□□ 2.07
SPNS1-210ENST00000568388 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.95■■■□□ 2.06
SPNS1-210ENST00000568388 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SPNS1-210ENST00000568388 ERBINQ96RT1 1412 aa27.94■■■□□ 2.06
SPNS1-210ENST00000568388 A2MP01023 1474 aa27.93■■■□□ 2.06
SPNS1-210ENST00000568388 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.93■■■□□ 2.06
SPNS1-210ENST00000568388 ATP10AO60312 1499 aa27.92■■■□□ 2.06
SPNS1-210ENST00000568388 REREQ9P2R6 1566 aa27.91■■■□□ 2.06
SPNS1-210ENST00000568388 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.9■■■□□ 2.06
SPNS1-210ENST00000568388 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SPNS1-210ENST00000568388 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.84■■■□□ 2.05
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