RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567928.5

MLST8-229, Transcript of MTOR associated protein, LST8 homolog, human

TSL 2

Gene MLST8, Length 545 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLST8-229	ENST00000567928	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.13	■■■■■ 4.17
MLST8-229	ENST00000567928	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.13	■■■■■ 4.17
MLST8-229	ENST00000567928	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		41.11	■■■■■ 4.17
MLST8-229	ENST00000567928	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.1	■■■■■ 4.17
MLST8-229	ENST00000567928	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.1	■■■■■ 4.17
MLST8-229	ENST00000567928	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.06	■■■■■ 4.16
MLST8-229	ENST00000567928	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.05	■■■■■ 4.16
MLST8-229	ENST00000567928	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.04	■■■■■ 4.16
MLST8-229	ENST00000567928	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.02	■■■■■ 4.16
MLST8-229	ENST00000567928	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.01	■■■■■ 4.16
MLST8-229	ENST00000567928	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.99	■■■■■ 4.15
MLST8-229	ENST00000567928	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		40.98	■■■■■ 4.15
MLST8-229	ENST00000567928	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	40.96	■■■■■ 4.15
MLST8-229	ENST00000567928	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.95	■■■■■ 4.15
MLST8-229	ENST00000567928	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.94	■■■■■ 4.14
MLST8-229	ENST00000567928	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		40.93	■■■■■ 4.14
MLST8-229	ENST00000567928	ABCC1	P33527	1531 aa		40.93	■■■■■ 4.14
MLST8-229	ENST00000567928	AFAP1	Q8N556	730 aa		40.89	■■■■■ 4.14
MLST8-229	ENST00000567928	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
MLST8-229	ENST00000567928	KDM5C	P41229	1560 aa		40.88	■■■■■ 4.13
MLST8-229	ENST00000567928	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.88	■■■■■ 4.13
MLST8-229	ENST00000567928	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.87	■■■■■ 4.13
MLST8-229	ENST00000567928	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.86	■■■■■ 4.13
MLST8-229	ENST00000567928	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.85	■■■■■ 4.13
MLST8-229	ENST00000567928	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		40.84	■■■■■ 4.13
MLST8-229	ENST00000567928	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.83	■■■■■ 4.13
MLST8-229	ENST00000567928	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.82	■■■■■ 4.13
MLST8-229	ENST00000567928	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.82	■■■■■ 4.13
MLST8-229	ENST00000567928	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.81	■■■■■ 4.12
MLST8-229	ENST00000567928	ATP10A	O60312	1499 aa		40.8	■■■■■ 4.12
MLST8-229	ENST00000567928	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.8	■■■■■ 4.12
MLST8-229	ENST00000567928	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
MLST8-229	ENST00000567928	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.76	■■■■■ 4.12
MLST8-229	ENST00000567928	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.76	■■■■■ 4.12
MLST8-229	ENST00000567928	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.75	■■■■■ 4.11
MLST8-229	ENST00000567928	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.73	■■■■■ 4.11
MLST8-229	ENST00000567928	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.72	■■■■■ 4.11
MLST8-229	ENST00000567928	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.71	■■■■■ 4.11
MLST8-229	ENST00000567928	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		40.71	■■■■■ 4.11
MLST8-229	ENST00000567928	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.71	■■■■■ 4.11
MLST8-229	ENST00000567928	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.7	■■■■■ 4.11
MLST8-229	ENST00000567928	MADD	Q8WXG6	1647 aa		40.69	■■■■■ 4.1
MLST8-229	ENST00000567928	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.69	■■■■■ 4.1
MLST8-229	ENST00000567928	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.66	■■■■■ 4.1
MLST8-229	ENST00000567928	PTPRM	P28827	1452 aa		40.65	■■■■■ 4.1
MLST8-229	ENST00000567928	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.64	■■■■■ 4.1
MLST8-229	ENST00000567928	APLP2	Q06481	763 aa		40.63	■■■■■ 4.09
MLST8-229	ENST00000567928	MLEC	Q14165	292 aa		40.61	■■■■■ 4.09
MLST8-229	ENST00000567928	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.61	■■■■■ 4.09
MLST8-229	ENST00000567928	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
MLST8-229	ENST00000567928	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.59	■■■■■ 4.09
MLST8-229	ENST00000567928	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
MLST8-229	ENST00000567928	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
MLST8-229	ENST00000567928	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
MLST8-229	ENST00000567928	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		40.51	■■■■■ 4.07
MLST8-229	ENST00000567928	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.5	■■■■■ 4.07
MLST8-229	ENST00000567928	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.48	■■■■■ 4.07
MLST8-229	ENST00000567928	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.47	■■■■■ 4.07
MLST8-229	ENST00000567928	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
MLST8-229	ENST00000567928	AGL	P35573	1532 aa		40.46	■■■■■ 4.07
MLST8-229	ENST00000567928	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.4	■■■■■ 4.06
MLST8-229	ENST00000567928	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.38	■■■■■ 4.05
MLST8-229	ENST00000567928	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.37	■■■■■ 4.05
MLST8-229	ENST00000567928	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.36	■■■■■ 4.05
MLST8-229	ENST00000567928	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MLST8-229	ENST00000567928	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MLST8-229	ENST00000567928	A2M	P01023	1474 aa		40.32	■■■■■ 4.05
MLST8-229	ENST00000567928	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.31	■■■■■ 4.04
MLST8-229	ENST00000567928	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.31	■■■■■ 4.04
MLST8-229	ENST00000567928	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
MLST8-229	ENST00000567928	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.27	■■■■■ 4.04
MLST8-229	ENST00000567928	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MLST8-229	ENST00000567928	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.24	■■■■■ 4.03
MLST8-229	ENST00000567928	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
MLST8-229	ENST00000567928	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.16	■■■■■ 4.02
MLST8-229	ENST00000567928	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.14	■■■■■ 4.02
MLST8-229	ENST00000567928	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.14	■■■■■ 4.02
MLST8-229	ENST00000567928	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.12	■■■■■ 4.01
MLST8-229	ENST00000567928	GGT6	Q6P531	493 aa		40.1	■■■■■ 4.01
MLST8-229	ENST00000567928	C3	P01024	1663 aa		40.1	■■■■■ 4.01
MLST8-229	ENST00000567928	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.1	■■■■■ 4.01
MLST8-229	ENST00000567928	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.08	■■■■■ 4.01
MLST8-229	ENST00000567928	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.05	■■■■■ 4
MLST8-229	ENST00000567928	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		40.04	■■■■■ 4
MLST8-229	ENST00000567928	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.03	■■■■■ 4
MLST8-229	ENST00000567928	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.01	■■■■■ 4
MLST8-229	ENST00000567928	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40	■■■■□ 3.99
MLST8-229	ENST00000567928	KIF3B	O15066	747 aa		40	■■■■□ 3.99
MLST8-229	ENST00000567928	ZMYM3	Q14202	1370 aa		39.97	■■■■□ 3.99
MLST8-229	ENST00000567928	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	39.95	■■■■□ 3.99
MLST8-229	ENST00000567928	HSPA2	P54652	639 aa		39.95	■■■■□ 3.99
MLST8-229	ENST00000567928	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		39.95	■■■■□ 3.99
MLST8-229	ENST00000567928	ABCC5	O15440	1437 aa		39.94	■■■■□ 3.98
MLST8-229	ENST00000567928	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		39.94	■■■■□ 3.98
MLST8-229	ENST00000567928	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		39.94	■■■■□ 3.98
MLST8-229	ENST00000567928	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	39.93	■■■■□ 3.98
MLST8-229	ENST00000567928	DAPK1	P53355	1430 aa		39.91	■■■■□ 3.98
MLST8-229	ENST00000567928	NPAT	Q14207	1427 aa		39.87	■■■■□ 3.97
MLST8-229	ENST00000567928	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		39.85	■■■■□ 3.97
MLST8-229	ENST00000567928	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		39.85	■■■■□ 3.97

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