RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
NME3-209ENST00000566600 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.97■■■■■ 4.15
NME3-209ENST00000566600 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.95■■■■■ 4.15
NME3-209ENST00000566600 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.95■■■■■ 4.15
NME3-209ENST00000566600 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
NME3-209ENST00000566600 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
NME3-209ENST00000566600 NCOA2Q15596 1464 aa40.9■■■■■ 4.14
NME3-209ENST00000566600 ADGRL1O94910 1474 aa40.89■■■■■ 4.14
NME3-209ENST00000566600 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
NME3-209ENST00000566600 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.83■■■■■ 4.13
NME3-209ENST00000566600 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
NME3-209ENST00000566600 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.82■■■■■ 4.12
NME3-209ENST00000566600 RAPGEF3O95398 923 aa40.81■■■■■ 4.12
NME3-209ENST00000566600 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
NME3-209ENST00000566600 RICTORQ6R327 1708 aa40.75■■■■■ 4.11
NME3-209ENST00000566600 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.74■■■■■ 4.11
NME3-209ENST00000566600 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.73■■■■■ 4.11
NME3-209ENST00000566600 ABCC1P33527 1531 aa40.72■■■■■ 4.11
NME3-209ENST00000566600 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.7■■■■■ 4.11
NME3-209ENST00000566600 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.69■■■■■ 4.11
NME3-209ENST00000566600 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.66■■■■■ 4.1
NME3-209ENST00000566600 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.64■■■■■ 4.1
NME3-209ENST00000566600 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.64■■■■■ 4.1
NME3-209ENST00000566600 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.61■■■■■ 4.09
NME3-209ENST00000566600 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.61■■■■■ 4.09
NME3-209ENST00000566600 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.59■■■■■ 4.09
NME3-209ENST00000566600 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.57■■■■■ 4.09
NME3-209ENST00000566600 AFAP1Q8N556 730 aa40.57■■■■■ 4.09
NME3-209ENST00000566600 MIA2Q96PC5 1412 aa40.57■■■■■ 4.08
NME3-209ENST00000566600 KDM5CP41229 1560 aa40.56■■■■■ 4.08
NME3-209ENST00000566600 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.55■■■■■ 4.08
NME3-209ENST00000566600 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
NME3-209ENST00000566600 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
NME3-209ENST00000566600 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.51■■■■■ 4.08
NME3-209ENST00000566600 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.5■■■■■ 4.07
NME3-209ENST00000566600 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.49■■■■■ 4.07
NME3-209ENST00000566600 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.46■■■■■ 4.07
NME3-209ENST00000566600 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.45■■■■■ 4.07
NME3-209ENST00000566600 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.44■■■■■ 4.06
NME3-209ENST00000566600 MBD5Q9P267 1494 aa40.44■■■■■ 4.06
NME3-209ENST00000566600 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.43■■■■■ 4.06
NME3-209ENST00000566600 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.42■■■■■ 4.06
NME3-209ENST00000566600 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.4■■■■■ 4.06
NME3-209ENST00000566600 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
NME3-209ENST00000566600 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.36■■■■■ 4.05
NME3-209ENST00000566600 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.36■■■■■ 4.05
NME3-209ENST00000566600 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.34■■■■■ 4.05
NME3-209ENST00000566600 ATP10AO60312 1499 aa40.34■■■■■ 4.05
NME3-209ENST00000566600 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
NME3-209ENST00000566600 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.3■■■■■ 4.04
NME3-209ENST00000566600 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
NME3-209ENST00000566600 ATP7AQ04656 1500 aa40.28■■■■■ 4.04
NME3-209ENST00000566600 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.28■■■■■ 4.04
NME3-209ENST00000566600 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
NME3-209ENST00000566600 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.27■■■■■ 4.04
NME3-209ENST00000566600 ABCA6Q8N139 1617 aa40.26■■■■■ 4.04
NME3-209ENST00000566600 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.25■■■■■ 4.03
NME3-209ENST00000566600 TSPY4P0CV99 314 aa40.25■■■■■ 4.03
NME3-209ENST00000566600 TSPY10P0CW01 314 aa40.25■■■■■ 4.03
NME3-209ENST00000566600 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
NME3-209ENST00000566600 REREQ9P2R6 1566 aa40.21■■■■■ 4.03
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NME3-209ENST00000566600 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.13■■■■■ 4.01
NME3-209ENST00000566600 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.13■■■■■ 4.01
NME3-209ENST00000566600 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
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NME3-209ENST00000566600 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.1■■■■■ 4.01
NME3-209ENST00000566600 ABCC5O15440 1437 aa40.09■■■■■ 4.01
NME3-209ENST00000566600 DAPK1P53355 1430 aa40.08■■■■■ 4.01
NME3-209ENST00000566600 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.08■■■■■ 4.01
NME3-209ENST00000566600 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.08■■■■■ 4.01
NME3-209ENST00000566600 AGLP35573 1532 aa40.07■■■■■ 4.01
NME3-209ENST00000566600 A2MP01023 1474 aa40.07■■■■■ 4
NME3-209ENST00000566600 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.06■■■■■ 4
NME3-209ENST00000566600 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.01■■■■■ 4
NME3-209ENST00000566600 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.01■■■■■ 4
NME3-209ENST00000566600 PLXNC1O60486 1568 aa40■■■■□ 3.99
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NME3-209ENST00000566600 MLECQ14165 292 aa39.97■■■■□ 3.99
NME3-209ENST00000566600 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
NME3-209ENST00000566600 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
NME3-209ENST00000566600 MADDQ8WXG6 1647 aa39.89■■■■□ 3.98
NME3-209ENST00000566600 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.88■■■■□ 3.97
NME3-209ENST00000566600 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.87■■■■□ 3.97
NME3-209ENST00000566600 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.85■■■■□ 3.97
NME3-209ENST00000566600 KIF15Q9NS87 1388 aa39.84■■■■□ 3.97
NME3-209ENST00000566600 ADGRL2O95490 1459 aa39.83■■■■□ 3.97
NME3-209ENST00000566600 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.82■■■■□ 3.97
NME3-209ENST00000566600 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.82■■■■□ 3.97
NME3-209ENST00000566600 NCOA1Q15788 1441 aa39.82■■■■□ 3.96
NME3-209ENST00000566600 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
NME3-209ENST00000566600 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
NME3-209ENST00000566600 KIF3BO15066 747 aa39.78■■■■□ 3.96
NME3-209ENST00000566600 PTPRMP28827 1452 aa39.77■■■■□ 3.96
NME3-209ENST00000566600 PTPRKQ15262 1439 aa39.76■■■■□ 3.96
NME3-209ENST00000566600 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.76■■■■□ 3.96
NME3-209ENST00000566600 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.95
NME3-209ENST00000566600 ITGAEP38570 1179 aa39.75■■■■□ 3.95
NME3-209ENST00000566600 GGT6Q6P531 493 aa39.75■■■■□ 3.95
NME3-209ENST00000566600 ERBINQ96RT1 1412 aa39.74■■■■□ 3.95
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