RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565849.5

E2F4-206, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 3

Gene E2F4, Length 639 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-206	ENST00000565849	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.1	■■■■■ 4.49
E2F4-206	ENST00000565849	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.08	■■■■■ 4.49
E2F4-206	ENST00000565849	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.04	■■■■■ 4.48
E2F4-206	ENST00000565849	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		43.03	■■■■■ 4.48
E2F4-206	ENST00000565849	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.02	■■■■■ 4.48
E2F4-206	ENST00000565849	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		43.02	■■■■■ 4.48
E2F4-206	ENST00000565849	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.99	■■■■■ 4.47
E2F4-206	ENST00000565849	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.93	■■■■■ 4.46
E2F4-206	ENST00000565849	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.93	■■■■■ 4.46
E2F4-206	ENST00000565849	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.91	■■■■■ 4.46
E2F4-206	ENST00000565849	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.91	■■■■■ 4.46
E2F4-206	ENST00000565849	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.89	■■■■■ 4.46
E2F4-206	ENST00000565849	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.46
E2F4-206	ENST00000565849	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.87	■■■■■ 4.45
E2F4-206	ENST00000565849	ABCC1	P33527	1531 aa		42.87	■■■■■ 4.45
E2F4-206	ENST00000565849	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.84	■■■■■ 4.45
E2F4-206	ENST00000565849	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.82	■■■■■ 4.45
E2F4-206	ENST00000565849	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.81	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.81	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	KDM5C	P41229	1560 aa		42.81	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.81	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.81	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.78	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.78	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.77	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.76	■■■■■ 4.44
E2F4-206	ENST00000565849	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.75	■■■■■ 4.43
E2F4-206	ENST00000565849	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.73	■■■■■ 4.43
E2F4-206	ENST00000565849	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
E2F4-206	ENST00000565849	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.68	■■■■■ 4.42
E2F4-206	ENST00000565849	ATP10A	O60312	1499 aa		42.68	■■■■■ 4.42
E2F4-206	ENST00000565849	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.68	■■■■■ 4.42
E2F4-206	ENST00000565849	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.68	■■■■■ 4.42
E2F4-206	ENST00000565849	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.65	■■■■■ 4.42
E2F4-206	ENST00000565849	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.64	■■■■■ 4.42
E2F4-206	ENST00000565849	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.64	■■■■■ 4.42
E2F4-206	ENST00000565849	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.62	■■■■■ 4.41
E2F4-206	ENST00000565849	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.62	■■■■■ 4.41
E2F4-206	ENST00000565849	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.61	■■■■■ 4.41
E2F4-206	ENST00000565849	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.6	■■■■■ 4.41
E2F4-206	ENST00000565849	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.59	■■■■■ 4.41
E2F4-206	ENST00000565849	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.59	■■■■■ 4.41
E2F4-206	ENST00000565849	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.57	■■■■■ 4.41
E2F4-206	ENST00000565849	PTPRM	P28827	1452 aa		42.56	■■■■■ 4.4
E2F4-206	ENST00000565849	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.56	■■■■■ 4.4
E2F4-206	ENST00000565849	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.55	■■■■■ 4.4
E2F4-206	ENST00000565849	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
E2F4-206	ENST00000565849	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
E2F4-206	ENST00000565849	MLEC	Q14165	292 aa		42.52	■■■■■ 4.4
E2F4-206	ENST00000565849	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
E2F4-206	ENST00000565849	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.48	■■■■■ 4.39
E2F4-206	ENST00000565849	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
E2F4-206	ENST00000565849	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.43	■■■■■ 4.38
E2F4-206	ENST00000565849	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.41	■■■■■ 4.38
E2F4-206	ENST00000565849	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.4	■■■■■ 4.38
E2F4-206	ENST00000565849	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.39	■■■■■ 4.38
E2F4-206	ENST00000565849	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.39	■■■■■ 4.38
E2F4-206	ENST00000565849	APLP2	Q06481	763 aa		42.39	■■■■■ 4.38
E2F4-206	ENST00000565849	AGL	P35573	1532 aa		42.32	■■■■■ 4.37
E2F4-206	ENST00000565849	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.3	■■■■■ 4.36
E2F4-206	ENST00000565849	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.25	■■■■■ 4.35
E2F4-206	ENST00000565849	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.23	■■■■■ 4.35
E2F4-206	ENST00000565849	A2M	P01023	1474 aa		42.19	■■■■■ 4.34
E2F4-206	ENST00000565849	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.19	■■■■■ 4.34
E2F4-206	ENST00000565849	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.18	■■■■■ 4.34
E2F4-206	ENST00000565849	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.18	■■■■■ 4.34
E2F4-206	ENST00000565849	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.17	■■■■■ 4.34
E2F4-206	ENST00000565849	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.16	■■■■■ 4.34
E2F4-206	ENST00000565849	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.14	■■■■■ 4.34
E2F4-206	ENST00000565849	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
E2F4-206	ENST00000565849	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.07	■■■■■ 4.33
E2F4-206	ENST00000565849	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.06	■■■■■ 4.32
E2F4-206	ENST00000565849	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.02	■■■■■ 4.32
E2F4-206	ENST00000565849	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.02	■■■■■ 4.32
E2F4-206	ENST00000565849	C3	P01024	1663 aa		42.02	■■■■■ 4.32
E2F4-206	ENST00000565849	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.01	■■■■■ 4.32
E2F4-206	ENST00000565849	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
E2F4-206	ENST00000565849	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.97	■■■■■ 4.31
E2F4-206	ENST00000565849	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.97	■■■■■ 4.31
E2F4-206	ENST00000565849	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.95	■■■■■ 4.31
E2F4-206	ENST00000565849	GGT6	Q6P531	493 aa		41.94	■■■■■ 4.3
E2F4-206	ENST00000565849	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.92	■■■■■ 4.3
E2F4-206	ENST00000565849	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.92	■■■■■ 4.3
E2F4-206	ENST00000565849	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.91	■■■■■ 4.3
E2F4-206	ENST00000565849	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.87	■■■■■ 4.29
E2F4-206	ENST00000565849	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.87	■■■■■ 4.29
E2F4-206	ENST00000565849	HSPA2	P54652	639 aa		41.86	■■■■■ 4.29
E2F4-206	ENST00000565849	KIF3B	O15066	747 aa		41.84	■■■■■ 4.29
E2F4-206	ENST00000565849	ABCC5	O15440	1437 aa		41.83	■■■■■ 4.29
E2F4-206	ENST00000565849	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.81	■■■■■ 4.28
E2F4-206	ENST00000565849	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.8	■■■■■ 4.28
E2F4-206	ENST00000565849	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	41.8	■■■■■ 4.28
E2F4-206	ENST00000565849	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.79	■■■■■ 4.28
E2F4-206	ENST00000565849	DAPK1	P53355	1430 aa		41.78	■■■■■ 4.28
E2F4-206	ENST00000565849	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.78	■■■■■ 4.28
E2F4-206	ENST00000565849	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		41.77	■■■■■ 4.28
E2F4-206	ENST00000565849	NPAT	Q14207	1427 aa		41.69	■■■■■ 4.27
E2F4-206	ENST00000565849	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.69	■■■■■ 4.26
E2F4-206	ENST00000565849	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.68	■■■■■ 4.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms