RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565787.1

CHTF18-216, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 607 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-216ENST00000565787 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.95■■■■□ 3.67
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CHTF18-216ENST00000565787 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.91■■■■□ 3.66
CHTF18-216ENST00000565787 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.9■■■■□ 3.66
CHTF18-216ENST00000565787 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.89■■■■□ 3.66
CHTF18-216ENST00000565787 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.8■■■■□ 3.64
CHTF18-216ENST00000565787 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.8■■■■□ 3.64
CHTF18-216ENST00000565787 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.79■■■■□ 3.64
CHTF18-216ENST00000565787 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.79■■■■□ 3.64
CHTF18-216ENST00000565787 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.77■■■■□ 3.64
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CHTF18-216ENST00000565787 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.75■■■■□ 3.63
CHTF18-216ENST00000565787 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
CHTF18-216ENST00000565787 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.74■■■■□ 3.63
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CHTF18-216ENST00000565787 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.72■■■■□ 3.63
CHTF18-216ENST00000565787 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.69■■■■□ 3.62
CHTF18-216ENST00000565787 TIAM1Q13009 1591 aa37.69■■■■□ 3.62
CHTF18-216ENST00000565787 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.69■■■■□ 3.62
CHTF18-216ENST00000565787 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.69■■■■□ 3.62
CHTF18-216ENST00000565787 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.67■■■■□ 3.62
CHTF18-216ENST00000565787 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.66■■■■□ 3.62
CHTF18-216ENST00000565787 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.66■■■■□ 3.62
CHTF18-216ENST00000565787 AFAP1Q8N556 730 aa37.64■■■■□ 3.62
CHTF18-216ENST00000565787 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.63■■■■□ 3.61
CHTF18-216ENST00000565787 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
CHTF18-216ENST00000565787 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.61■■■■□ 3.61
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CHTF18-216ENST00000565787 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.56■■■■□ 3.6
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CHTF18-216ENST00000565787 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.53■■■■□ 3.6
CHTF18-216ENST00000565787 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.53■■■■□ 3.6
CHTF18-216ENST00000565787 NCOA2Q15596 1464 aa37.52■■■■□ 3.6
CHTF18-216ENST00000565787 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.52■■■■□ 3.6
CHTF18-216ENST00000565787 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.52■■■■□ 3.6
CHTF18-216ENST00000565787 ABCA6Q8N139 1617 aa37.51■■■■□ 3.6
CHTF18-216ENST00000565787 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.51■■■■□ 3.59
CHTF18-216ENST00000565787 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.49■■■■□ 3.59
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CHTF18-216ENST00000565787 REREQ9P2R6 1566 aa37.45■■■■□ 3.59
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CHTF18-216ENST00000565787 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.99■■■■□ 3.51
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CHTF18-216ENST00000565787 TSPY10P0CW01 314 aa36.96■■■■□ 3.51
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CHTF18-216ENST00000565787 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
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CHTF18-216ENST00000565787 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.82■■■■□ 3.48
CHTF18-216ENST00000565787 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.81■■■■□ 3.48
CHTF18-216ENST00000565787 ZMYM3Q14202 1370 aa36.79■■■■□ 3.48
CHTF18-216ENST00000565787 KIF3BO15066 747 aa36.79■■■■□ 3.48
CHTF18-216ENST00000565787 DAPK1P53355 1430 aa36.77■■■■□ 3.48
CHTF18-216ENST00000565787 HSPA2P54652 639 aa36.77■■■■□ 3.48
CHTF18-216ENST00000565787 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.75■■■■□ 3.47
CHTF18-216ENST00000565787 NPATQ14207 1427 aa36.74■■■■□ 3.47
CHTF18-216ENST00000565787 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.74■■■■□ 3.47
CHTF18-216ENST00000565787 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
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