RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CTU2-204ENST00000564105 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU2-204ENST00000564105 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.39■■■□□ 2.3
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU2-204ENST00000564105 PLCH2O75038 1416 aa29.38■■■□□ 2.29
CTU2-204ENST00000564105 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.37■■■□□ 2.29
CTU2-204ENST00000564105 CD109Q6YHK3 1445 aa29.37■■■□□ 2.29
CTU2-204ENST00000564105 MIA2Q96PC5 1412 aa29.37■■■□□ 2.29
CTU2-204ENST00000564105 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.36■■■□□ 2.29
CTU2-204ENST00000564105 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CTU2-204ENST00000564105 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CTU2-204ENST00000564105 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.32■■■□□ 2.28
CTU2-204ENST00000564105 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.31■■■□□ 2.28
CTU2-204ENST00000564105 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.28■■■□□ 2.28
CTU2-204ENST00000564105 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CTU2-204ENST00000564105 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CTU2-204ENST00000564105 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.27■■■□□ 2.28
CTU2-204ENST00000564105 FANCAO15360 1455 aa29.26■■■□□ 2.28
CTU2-204ENST00000564105 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.26■■■□□ 2.27
CTU2-204ENST00000564105 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CTU2-204ENST00000564105 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CTU2-204ENST00000564105 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CTU2-204ENST00000564105 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.27
CTU2-204ENST00000564105 ABCC1P33527 1531 aa29.19■■■□□ 2.26
CTU2-204ENST00000564105 NEO1Q92859 1461 aa29.18■■■□□ 2.26
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.17■■■□□ 2.26
CTU2-204ENST00000564105 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.17■■■□□ 2.26
CTU2-204ENST00000564105 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CTU2-204ENST00000564105 AKNAQ7Z591 1439 aa29.16■■■□□ 2.26
CTU2-204ENST00000564105 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.16■■■□□ 2.26
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.14■■■□□ 2.25
CTU2-204ENST00000564105 ADGRL1O94910 1474 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU2-204ENST00000564105 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.11■■■□□ 2.25
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.1■■■□□ 2.25
CTU2-204ENST00000564105 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
CTU2-204ENST00000564105 MBD5Q9P267 1494 aa29.08■■■□□ 2.25
CTU2-204ENST00000564105 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.07■■■□□ 2.24
CTU2-204ENST00000564105 RICTORQ6R327 1708 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU2-204ENST00000564105 DAPK1P53355 1430 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU2-204ENST00000564105 ITGAEP38570 1179 aa29.05■■■□□ 2.24
CTU2-204ENST00000564105 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.05■■■□□ 2.24
CTU2-204ENST00000564105 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.04■■■□□ 2.24
CTU2-204ENST00000564105 ABCC5O15440 1437 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU2-204ENST00000564105 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.01■■■□□ 2.24
CTU2-204ENST00000564105 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.01■■■□□ 2.23
CTU2-204ENST00000564105 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.99■■■□□ 2.23
CTU2-204ENST00000564105 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CTU2-204ENST00000564105 PTPRKQ15262 1439 aa28.98■■■□□ 2.23
CTU2-204ENST00000564105 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.97■■■□□ 2.23
CTU2-204ENST00000564105 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.97■■■□□ 2.23
CTU2-204ENST00000564105 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.96■■■□□ 2.23
CTU2-204ENST00000564105 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.96■■■□□ 2.23
CTU2-204ENST00000564105 KDM5CP41229 1560 aa28.95■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.95■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 TSPY4P0CV99 314 aa28.93■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 TSPY10P0CW01 314 aa28.93■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 AFAP1Q8N556 730 aa28.92■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.92■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.91■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.91■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.89■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 RAPGEF3O95398 923 aa28.89■■■□□ 2.22
CTU2-204ENST00000564105 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.88■■■□□ 2.21
CTU2-204ENST00000564105 ATP7AQ04656 1500 aa28.87■■■□□ 2.21
CTU2-204ENST00000564105 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.87■■■□□ 2.21
CTU2-204ENST00000564105 ADGRL2O95490 1459 aa28.87■■■□□ 2.21
CTU2-204ENST00000564105 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CTU2-204ENST00000564105 PLXNC1O60486 1568 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU2-204ENST00000564105 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.85■■■□□ 2.21
CTU2-204ENST00000564105 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.83■■■□□ 2.21
CTU2-204ENST00000564105 ROCK1Q13464 1354 aa28.83■■■□□ 2.21
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.82■■■□□ 2.2
CTU2-204ENST00000564105 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.82■■■□□ 2.2
CTU2-204ENST00000564105 NCOA1Q15788 1441 aa28.81■■■□□ 2.2
CTU2-204ENST00000564105 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.8■■■□□ 2.2
CTU2-204ENST00000564105 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.79■■■□□ 2.2
CTU2-204ENST00000564105 ABCA6Q8N139 1617 aa28.78■■■□□ 2.2
CTU2-204ENST00000564105 HFM1A2PYH4 1435 aa28.76■■■□□ 2.19
CTU2-204ENST00000564105 NAIPQ13075 1403 aa28.74■■■□□ 2.19
CTU2-204ENST00000564105 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.74■■■□□ 2.19
CTU2-204ENST00000564105 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.73■■■□□ 2.19
CTU2-204ENST00000564105 KIF15Q9NS87 1388 aa28.73■■■□□ 2.19
CTU2-204ENST00000564105 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.7■■■□□ 2.19
CTU2-204ENST00000564105 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.7■■■□□ 2.19
CTU2-204ENST00000564105 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.68■■■□□ 2.18
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.68■■■□□ 2.18
CTU2-204ENST00000564105 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.67■■■□□ 2.18
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.62■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 A2MP01023 1474 aa28.62■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 ERBINQ96RT1 1412 aa28.6■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 ATP10AO60312 1499 aa28.6■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 REREQ9P2R6 1566 aa28.59■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU2-204ENST00000564105 MADDQ8WXG6 1647 aa28.55■■■□□ 2.16
CTU2-204ENST00000564105 PTPRMP28827 1452 aa28.55■■■□□ 2.16
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