RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.34■■□□□ 1.65
RNPS1-208ENST00000563857 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-208ENST00000563857 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-208ENST00000563857 APLP2Q06481 763 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-208ENST00000563857 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-208ENST00000563857 PREX2Q70Z35 1606 aa25.32■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 RICTORQ6R327 1708 aa25.32■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.31■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.31■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.31■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.28■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 MAP3K1Q13233 1512 aa25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RNPS1-208ENST00000563857 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-208ENST00000563857 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-208ENST00000563857 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-208ENST00000563857 TIAM1Q13009 1591 aa25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-208ENST00000563857 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-208ENST00000563857 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.2■■□□□ 1.63
RNPS1-208ENST00000563857 AFAP1Q8N556 730 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 ABCC1P33527 1531 aa25.19■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 ATP10AO60312 1499 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.17■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 KDM5CP41229 1560 aa25.17■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 NCOA2Q15596 1464 aa25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-208ENST00000563857 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-208ENST00000563857 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-208ENST00000563857 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-208ENST00000563857 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-208ENST00000563857 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-208ENST00000563857 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.1■■□□□ 1.61
RNPS1-208ENST00000563857 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-208ENST00000563857 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
RNPS1-208ENST00000563857 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-208ENST00000563857 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-208ENST00000563857 REREQ9P2R6 1566 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-208ENST00000563857 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-208ENST00000563857 MIA2Q96PC5 1412 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-208ENST00000563857 TSPY4P0CV99 314 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 TSPY10P0CW01 314 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 MLECQ14165 292 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 AGLP35573 1532 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 PTPRMP28827 1452 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 MBD5Q9P267 1494 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 ATP7AQ04656 1500 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.95■■□□□ 1.59
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-208ENST00000563857 ABCA6Q8N139 1617 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-208ENST00000563857 MADDQ8WXG6 1647 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.9■■□□□ 1.58
RNPS1-208ENST00000563857 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
RNPS1-208ENST00000563857 A2MP01023 1474 aa24.89■■□□□ 1.57
RNPS1-208ENST00000563857 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.88■■□□□ 1.57
RNPS1-208ENST00000563857 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
RNPS1-208ENST00000563857 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.86■■□□□ 1.57
RNPS1-208ENST00000563857 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.85■■□□□ 1.57
RNPS1-208ENST00000563857 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.85■■□□□ 1.57
RNPS1-208ENST00000563857 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.83■■□□□ 1.57
RNPS1-208ENST00000563857 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RNPS1-208ENST00000563857 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.79■■□□□ 1.56
RNPS1-208ENST00000563857 PLXNC1O60486 1568 aa24.78■■□□□ 1.56
RNPS1-208ENST00000563857 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.76■■□□□ 1.55
RNPS1-208ENST00000563857 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.75■■□□□ 1.55
RNPS1-208ENST00000563857 GGT6Q6P531 493 aa24.75■■□□□ 1.55
RNPS1-208ENST00000563857 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.75■■□□□ 1.55
RNPS1-208ENST00000563857 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RNPS1-208ENST00000563857 KIF3BO15066 747 aa24.72■■□□□ 1.55
RNPS1-208ENST00000563857 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.71■■□□□ 1.55
RNPS1-208ENST00000563857 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
RNPS1-208ENST00000563857 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.69■■□□□ 1.54
RNPS1-208ENST00000563857 ABCC5O15440 1437 aa24.67■■□□□ 1.54
RNPS1-208ENST00000563857 MROH2AA6NES4 1674 aa24.66■■□□□ 1.54
RNPS1-208ENST00000563857 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
RNPS1-208ENST00000563857 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
RNPS1-208ENST00000563857 DAPK1P53355 1430 aa24.66■■□□□ 1.54
RNPS1-208ENST00000563857 ZMYM3Q14202 1370 aa24.66■■□□□ 1.54
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.65■■□□□ 1.54
RNPS1-208ENST00000563857 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 NPATQ14207 1427 aa24.63■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.63■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 KIF15Q9NS87 1388 aa24.6■■□□□ 1.53
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