RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 TMC2Q8TDI7 906 aa10.34□□□□□ -0.75
GDE1-202ENST00000563645 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
GDE1-202ENST00000563645 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
GDE1-202ENST00000563645 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
GDE1-202ENST00000563645 CFAP44Q96MT7 982 aa10.31□□□□□ -0.76
GDE1-202ENST00000563645 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
GDE1-202ENST00000563645 DOK7Q18PE1 504 aa10.29□□□□□ -0.76
GDE1-202ENST00000563645 ST18O60284 1047 aa10.28□□□□□ -0.76
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GDE1-202ENST00000563645 P3H3Q8IVL6 736 aa9.86□□□□□ -0.83
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GDE1-202ENST00000563645 PTPREP23469 700 aa9.76□□□□□ -0.85
GDE1-202ENST00000563645 NBR1Q14596 966 aa9.75□□□□□ -0.85
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GDE1-202ENST00000563645 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.74□□□□□ -0.85
GDE1-202ENST00000563645 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.73□□□□□ -0.85
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