RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563545.1

CHTF18-214, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-214ENST00000563545 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.37■■■■□ 3.41
CHTF18-214ENST00000563545 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.37■■■■□ 3.41
CHTF18-214ENST00000563545 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.37■■■■□ 3.41
CHTF18-214ENST00000563545 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.37■■■■□ 3.41
CHTF18-214ENST00000563545 CLIP1P30622 1438 aa36.36■■■■□ 3.41
CHTF18-214ENST00000563545 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
CHTF18-214ENST00000563545 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-214ENST00000563545 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-214ENST00000563545 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-214ENST00000563545 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.29■■■■□ 3.4
CHTF18-214ENST00000563545 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.28■■■■□ 3.4
CHTF18-214ENST00000563545 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.22■■■■□ 3.39
CHTF18-214ENST00000563545 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.19■■■■□ 3.38
CHTF18-214ENST00000563545 ATP10AO60312 1499 aa36.18■■■■□ 3.38
CHTF18-214ENST00000563545 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.18■■■■□ 3.38
CHTF18-214ENST00000563545 PREX2Q70Z35 1606 aa36.16■■■■□ 3.38
CHTF18-214ENST00000563545 MLECQ14165 292 aa36.15■■■■□ 3.38
CHTF18-214ENST00000563545 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.15■■■■□ 3.38
CHTF18-214ENST00000563545 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.14■■■■□ 3.38
CHTF18-214ENST00000563545 KDM5CP41229 1560 aa36.14■■■■□ 3.38
CHTF18-214ENST00000563545 AFAP1Q8N556 730 aa36.13■■■■□ 3.37
CHTF18-214ENST00000563545 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.1■■■■□ 3.37
CHTF18-214ENST00000563545 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.09■■■■□ 3.37
CHTF18-214ENST00000563545 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.08■■■■□ 3.37
CHTF18-214ENST00000563545 ABCC1P33527 1531 aa36.05■■■■□ 3.36
CHTF18-214ENST00000563545 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.05■■■■□ 3.36
CHTF18-214ENST00000563545 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.04■■■■□ 3.36
CHTF18-214ENST00000563545 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.03■■■■□ 3.36
CHTF18-214ENST00000563545 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.02■■■■□ 3.36
CHTF18-214ENST00000563545 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36■■■■□ 3.35
CHTF18-214ENST00000563545 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.99■■■■□ 3.35
CHTF18-214ENST00000563545 ABCA6Q8N139 1617 aa35.97■■■■□ 3.35
CHTF18-214ENST00000563545 REREQ9P2R6 1566 aa35.94■■■■□ 3.34
CHTF18-214ENST00000563545 HSPA2P54652 639 aa35.91■■■■□ 3.34
CHTF18-214ENST00000563545 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CHTF18-214ENST00000563545 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.89■■■■□ 3.34
CHTF18-214ENST00000563545 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.89■■■■□ 3.34
CHTF18-214ENST00000563545 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
CHTF18-214ENST00000563545 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.84■■■■□ 3.33
CHTF18-214ENST00000563545 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.83■■■■□ 3.33
CHTF18-214ENST00000563545 AGLP35573 1532 aa35.83■■■■□ 3.33
CHTF18-214ENST00000563545 CEP162Q5TB80 1403 aa35.81■■■■□ 3.32
CHTF18-214ENST00000563545 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.81■■■■□ 3.32
CHTF18-214ENST00000563545 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.8■■■■□ 3.32
CHTF18-214ENST00000563545 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.78■■■■□ 3.32
CHTF18-214ENST00000563545 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
CHTF18-214ENST00000563545 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
CHTF18-214ENST00000563545 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
CHTF18-214ENST00000563545 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.73■■■■□ 3.31
CHTF18-214ENST00000563545 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.73■■■■□ 3.31
CHTF18-214ENST00000563545 FBXO41Q8TF61 875 aa35.72■■■■□ 3.31
CHTF18-214ENST00000563545 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.72■■■■□ 3.31
CHTF18-214ENST00000563545 C3P01024 1663 aa35.71■■■■□ 3.31
CHTF18-214ENST00000563545 TIAM1Q13009 1591 aa35.69■■■■□ 3.3
CHTF18-214ENST00000563545 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
CHTF18-214ENST00000563545 ATP7AQ04656 1500 aa35.67■■■■□ 3.3
CHTF18-214ENST00000563545 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
CHTF18-214ENST00000563545 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
CHTF18-214ENST00000563545 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.64■■■■□ 3.3
CHTF18-214ENST00000563545 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.61■■■■□ 3.29
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CHTF18-214ENST00000563545 PLXNC1O60486 1568 aa35.55■■■■□ 3.28
CHTF18-214ENST00000563545 A2MP01023 1474 aa35.55■■■■□ 3.28
CHTF18-214ENST00000563545 STRCQ7RTU9 1775 aa35.55■■■■□ 3.28
CHTF18-214ENST00000563545 MROH2AA6NES4 1674 aa35.54■■■■□ 3.28
CHTF18-214ENST00000563545 MBD5Q9P267 1494 aa35.53■■■■□ 3.28
CHTF18-214ENST00000563545 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.51■■■■□ 3.28
CHTF18-214ENST00000563545 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.51■■■■□ 3.28
CHTF18-214ENST00000563545 NCOA2Q15596 1464 aa35.49■■■■□ 3.27
CHTF18-214ENST00000563545 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
CHTF18-214ENST00000563545 ZMYM3Q14202 1370 aa35.45■■■■□ 3.27
CHTF18-214ENST00000563545 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.44■■■■□ 3.26
CHTF18-214ENST00000563545 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.43■■■■□ 3.26
CHTF18-214ENST00000563545 CERKQ8TCT0 537 aa35.43■■■■□ 3.26
CHTF18-214ENST00000563545 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.42■■■■□ 3.26
CHTF18-214ENST00000563545 GGT6Q6P531 493 aa35.42■■■■□ 3.26
CHTF18-214ENST00000563545 NPATQ14207 1427 aa35.41■■■■□ 3.26
CHTF18-214ENST00000563545 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.41■■■■□ 3.26
CHTF18-214ENST00000563545 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.37■■■■□ 3.25
CHTF18-214ENST00000563545 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.34■■■■□ 3.25
CHTF18-214ENST00000563545 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CHTF18-214ENST00000563545 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.32■■■■□ 3.24
CHTF18-214ENST00000563545 PTPRTO14522 1441 aa35.32■■■■□ 3.24
CHTF18-214ENST00000563545 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.31■■■■□ 3.24
CHTF18-214ENST00000563545 NCOA1Q15788 1441 aa35.3■■■■□ 3.24
CHTF18-214ENST00000563545 PTPRKQ15262 1439 aa35.28■■■■□ 3.24
CHTF18-214ENST00000563545 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.27■■■■□ 3.24
CHTF18-214ENST00000563545 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.26■■■■□ 3.24
CHTF18-214ENST00000563545 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.26■■■■□ 3.24
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
CHTF18-214ENST00000563545 MAP3K1Q13233 1512 aa35.23■■■■□ 3.23
CHTF18-214ENST00000563545 KIF3BO15066 747 aa35.22■■■■□ 3.23
CHTF18-214ENST00000563545 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
CHTF18-214ENST00000563545 TSPY4P0CV99 314 aa35.19■■■■□ 3.22
CHTF18-214ENST00000563545 TSPY10P0CW01 314 aa35.19■■■■□ 3.22
CHTF18-214ENST00000563545 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
CHTF18-214ENST00000563545 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.12■■■■□ 3.21
CHTF18-214ENST00000563545 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.12■■■■□ 3.21
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