RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561187.1

SNRPA1-215, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A', human

TSL 2

Gene SNRPA1, Length 509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRPA1-215	ENST00000561187	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	44.3	■■■■■ 4.68
SNRPA1-215	ENST00000561187	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	44.29	■■■■■ 4.68
SNRPA1-215	ENST00000561187	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		44.26	■■■■■ 4.68
SNRPA1-215	ENST00000561187	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		44.24	■■■■■ 4.67
SNRPA1-215	ENST00000561187	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	44.23	■■■■■ 4.67
SNRPA1-215	ENST00000561187	CLIP1	P30622	1438 aa		44.23	■■■■■ 4.67
SNRPA1-215	ENST00000561187	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		44.19	■■■■■ 4.67
SNRPA1-215	ENST00000561187	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		44.19	■■■■■ 4.66
SNRPA1-215	ENST00000561187	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		44.16	■■■■■ 4.66
SNRPA1-215	ENST00000561187	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		44.16	■■■■■ 4.66
SNRPA1-215	ENST00000561187	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		44.15	■■■■■ 4.66
SNRPA1-215	ENST00000561187	MLEC	Q14165	292 aa		44.13	■■■■■ 4.66
SNRPA1-215	ENST00000561187	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	44.13	■■■■■ 4.66
SNRPA1-215	ENST00000561187	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		44.09	■■■■■ 4.65
SNRPA1-215	ENST00000561187	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		44.03	■■■■■ 4.64
SNRPA1-215	ENST00000561187	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		44.01	■■■■■ 4.64
SNRPA1-215	ENST00000561187	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		44	■■■■■ 4.63
SNRPA1-215	ENST00000561187	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.99	■■■■■ 4.63
SNRPA1-215	ENST00000561187	ATP10A	O60312	1499 aa		43.98	■■■■■ 4.63
SNRPA1-215	ENST00000561187	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.98	■■■■■ 4.63
SNRPA1-215	ENST00000561187	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.98	■■■■■ 4.63
SNRPA1-215	ENST00000561187	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.97	■■■■■ 4.63
SNRPA1-215	ENST00000561187	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.97	■■■■■ 4.63
SNRPA1-215	ENST00000561187	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.96	■■■■■ 4.63
SNRPA1-215	ENST00000561187	KDM5C	P41229	1560 aa		43.93	■■■■■ 4.62
SNRPA1-215	ENST00000561187	ABCC1	P33527	1531 aa		43.88	■■■■■ 4.61
SNRPA1-215	ENST00000561187	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.86	■■■■■ 4.61
SNRPA1-215	ENST00000561187	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.85	■■■■■ 4.61
SNRPA1-215	ENST00000561187	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.84	■■■■■ 4.61
SNRPA1-215	ENST00000561187	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.83	■■■■■ 4.61
SNRPA1-215	ENST00000561187	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.83	■■■■■ 4.61
SNRPA1-215	ENST00000561187	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.81	■■■■■ 4.6
SNRPA1-215	ENST00000561187	HSPA2	P54652	639 aa		43.81	■■■■■ 4.6
SNRPA1-215	ENST00000561187	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.77	■■■■■ 4.6
SNRPA1-215	ENST00000561187	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.71	■■■■■ 4.59
SNRPA1-215	ENST00000561187	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	43.69	■■■■■ 4.58
SNRPA1-215	ENST00000561187	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.69	■■■■■ 4.58
SNRPA1-215	ENST00000561187	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.66	■■■■■ 4.58
SNRPA1-215	ENST00000561187	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.66	■■■■■ 4.58
SNRPA1-215	ENST00000561187	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.63	■■■■■ 4.58
SNRPA1-215	ENST00000561187	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.63	■■■■■ 4.57
SNRPA1-215	ENST00000561187	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.62	■■■■■ 4.57
SNRPA1-215	ENST00000561187	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.6	■■■■■ 4.57
SNRPA1-215	ENST00000561187	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.56	■■■■■ 4.56
SNRPA1-215	ENST00000561187	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.55	■■■■■ 4.56
SNRPA1-215	ENST00000561187	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.53	■■■■■ 4.56
SNRPA1-215	ENST00000561187	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.52	■■■■■ 4.56
SNRPA1-215	ENST00000561187	AGL	P35573	1532 aa		43.51	■■■■■ 4.56
SNRPA1-215	ENST00000561187	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
SNRPA1-215	ENST00000561187	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.46	■■■■■ 4.55
SNRPA1-215	ENST00000561187	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.45	■■■■■ 4.55
SNRPA1-215	ENST00000561187	C3	P01024	1663 aa		43.44	■■■■■ 4.54
SNRPA1-215	ENST00000561187	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	43.44	■■■■■ 4.54
SNRPA1-215	ENST00000561187	FBXO41	Q8TF61	875 aa		43.42	■■■■■ 4.54
SNRPA1-215	ENST00000561187	ATP7A	Q04656	1500 aa		43.42	■■■■■ 4.54
SNRPA1-215	ENST00000561187	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.4	■■■■■ 4.54
SNRPA1-215	ENST00000561187	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	43.39	■■■■■ 4.54
SNRPA1-215	ENST00000561187	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		43.39	■■■■■ 4.54
SNRPA1-215	ENST00000561187	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.38	■■■■■ 4.53
SNRPA1-215	ENST00000561187	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	43.37	■■■■■ 4.53
SNRPA1-215	ENST00000561187	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	43.36	■■■■■ 4.53
SNRPA1-215	ENST00000561187	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.27	■■■■■ 4.52
SNRPA1-215	ENST00000561187	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
SNRPA1-215	ENST00000561187	A2M	P01023	1474 aa		43.25	■■■■■ 4.51
SNRPA1-215	ENST00000561187	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		43.25	■■■■■ 4.51
SNRPA1-215	ENST00000561187	PLXNC1	O60486	1568 aa		43.24	■■■■■ 4.51
SNRPA1-215	ENST00000561187	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.21	■■■■■ 4.51
SNRPA1-215	ENST00000561187	NCOA2	Q15596	1464 aa		43.2	■■■■■ 4.51
SNRPA1-215	ENST00000561187	MBD5	Q9P267	1494 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SNRPA1-215	ENST00000561187	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	43.17	■■■■■ 4.5
SNRPA1-215	ENST00000561187	MROH2A	A6NES4	1674 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SNRPA1-215	ENST00000561187	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SNRPA1-215	ENST00000561187	GGT6	Q6P531	493 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SNRPA1-215	ENST00000561187	ZMYM3	Q14202	1370 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SNRPA1-215	ENST00000561187	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SNRPA1-215	ENST00000561187	CERK	Q8TCT0	537 aa		43.1	■■■■■ 4.49
SNRPA1-215	ENST00000561187	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.09	■■■■■ 4.49
SNRPA1-215	ENST00000561187	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		43.04	■■■■■ 4.48
SNRPA1-215	ENST00000561187	NPAT	Q14207	1427 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SNRPA1-215	ENST00000561187	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		43.01	■■■■■ 4.48
SNRPA1-215	ENST00000561187	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SNRPA1-215	ENST00000561187	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.98	■■■■■ 4.47
SNRPA1-215	ENST00000561187	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SNRPA1-215	ENST00000561187	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.94	■■■■■ 4.46
SNRPA1-215	ENST00000561187	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SNRPA1-215	ENST00000561187	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.92	■■■■■ 4.46
SNRPA1-215	ENST00000561187	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SNRPA1-215	ENST00000561187	PTPRT	O14522	1441 aa		42.89	■■■■■ 4.46
SNRPA1-215	ENST00000561187	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
SNRPA1-215	ENST00000561187	KIF3B	O15066	747 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SNRPA1-215	ENST00000561187	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SNRPA1-215	ENST00000561187	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.84	■■■■■ 4.45
SNRPA1-215	ENST00000561187	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.83	■■■■■ 4.45
SNRPA1-215	ENST00000561187	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SNRPA1-215	ENST00000561187	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.78	■■■■■ 4.44
SNRPA1-215	ENST00000561187	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.78	■■■■■ 4.44
SNRPA1-215	ENST00000561187	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SNRPA1-215	ENST00000561187	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SNRPA1-215	ENST00000561187	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.75	■■■■■ 4.43
SNRPA1-215	ENST00000561187	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.73	■■■■■ 4.43

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