RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNH8Q96L42 1107 aa26.52■■□□□ 1.84
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASXL2Q76L83 1435 aa26.5■■□□□ 1.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.5■■□□□ 1.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 DAPK1P53355 1430 aa26.49■■□□□ 1.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.49■■□□□ 1.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 HFM1A2PYH4 1435 aa26.47■■□□□ 1.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCC5O15440 1437 aa26.47■■□□□ 1.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.46■■□□□ 1.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.44■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKNAQ7Z591 1439 aa26.44■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLCH2O75038 1416 aa26.44■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.41■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.41■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAIPQ13075 1403 aa26.4■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ROCK1Q13464 1354 aa26.4■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.39■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.39■■□□□ 1.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.39■■□□□ 1.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.37■■□□□ 1.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.37■■□□□ 1.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MBD5Q9P267 1494 aa26.36■■□□□ 1.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.35■■□□□ 1.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAPKBP1O60336 1514 aa26.34■■□□□ 1.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.34■■□□□ 1.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.33■■□□□ 1.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.33■■□□□ 1.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.32■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.32■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.32■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADGRL2O95490 1459 aa26.31■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.29■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.29■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.28■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.28■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCOA1Q15788 1441 aa26.27■■□□□ 1.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.25■■□□□ 1.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCC1P33527 1531 aa26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSPY4P0CV99 314 aa26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSPY10P0CW01 314 aa26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.23■■□□□ 1.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 FANCAO15360 1455 aa26.22■■□□□ 1.79
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM6BO15054 1643 aa26.2■■□□□ 1.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.19■■□□□ 1.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD109Q6YHK3 1445 aa26.19■■□□□ 1.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLI2P10070 1586 aa26.15■■□□□ 1.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.12■■□□□ 1.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.11■■□□□ 1.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADGRL1O94910 1474 aa26.1■■□□□ 1.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF15Q9NS87 1388 aa26.09■■□□□ 1.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.09■■□□□ 1.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.09■■□□□ 1.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLXNC1O60486 1568 aa26.08■■□□□ 1.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM52Q96A61 297 aa26.07■■□□□ 1.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 DIP2BQ9P265 1576 aa26.07■■□□□ 1.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.07■■□□□ 1.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.04■■□□□ 1.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEO1Q92859 1461 aa26.03■■□□□ 1.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 AFAP1Q8N556 730 aa26.02■■□□□ 1.76
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM69CQ0P6D2 419 aa26■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIN3AQ96ST3 1273 aa26■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.99■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEUROD1Q13562 356 aa25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.97■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP7AQ04656 1500 aa25.95■■□□□ 1.74
USP3-AS1-208ENST00000560962 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.94■■□□□ 1.74
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERBINQ96RT1 1412 aa25.93■■□□□ 1.74
USP3-AS1-208ENST00000560962 PZPP20742 1482 aa25.93■■□□□ 1.74
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.92■■□□□ 1.74
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM5CP41229 1560 aa25.91■■□□□ 1.74
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUP155O75694 1391 aa25.87■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.86■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.86■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 UNC13BO14795 1591 aa25.86■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.85■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.85■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXD1Q16676 465 aa25.83■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.83■■□□□ 1.73
USP3-AS1-208ENST00000560962 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.82■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.81■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 RICTORQ6R327 1708 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSPOAP1O95153 1857 aa25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAPGEF3O95398 923 aa25.78■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.78■■□□□ 1.72
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