RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560915.1

KATNBL1-215, Transcript of katanin regulatory subunit B1 like 1, human

Gene KATNBL1, Length 1,553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KATNBL1-215	ENST00000560915	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		43.37	■■■■■ 4.53
KATNBL1-215	ENST00000560915	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.36	■■■■■ 4.53
KATNBL1-215	ENST00000560915	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		43.36	■■■■■ 4.53
KATNBL1-215	ENST00000560915	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.34	■■■■■ 4.53
KATNBL1-215	ENST00000560915	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.29	■■■■■ 4.52
KATNBL1-215	ENST00000560915	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
KATNBL1-215	ENST00000560915	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.25	■■■■■ 4.51
KATNBL1-215	ENST00000560915	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.24	■■■■■ 4.51
KATNBL1-215	ENST00000560915	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		43.23	■■■■■ 4.51
KATNBL1-215	ENST00000560915	FANCA	O15360	1455 aa		43.22	■■■■■ 4.51
KATNBL1-215	ENST00000560915	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.22	■■■■■ 4.51
KATNBL1-215	ENST00000560915	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		43.2	■■■■■ 4.51
KATNBL1-215	ENST00000560915	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.2	■■■■■ 4.51
KATNBL1-215	ENST00000560915	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	43.19	■■■■■ 4.51
KATNBL1-215	ENST00000560915	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	43.19	■■■■■ 4.5
KATNBL1-215	ENST00000560915	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	43.17	■■■■■ 4.5
KATNBL1-215	ENST00000560915	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	43.15	■■■■■ 4.5
KATNBL1-215	ENST00000560915	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	43.15	■■■■■ 4.5
KATNBL1-215	ENST00000560915	ABCC1	P33527	1531 aa		43.09	■■■■■ 4.49
KATNBL1-215	ENST00000560915	NEO1	Q92859	1461 aa		43.08	■■■■■ 4.49
KATNBL1-215	ENST00000560915	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.07	■■■■■ 4.49
KATNBL1-215	ENST00000560915	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		43.07	■■■■■ 4.49
KATNBL1-215	ENST00000560915	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.07	■■■■■ 4.48
KATNBL1-215	ENST00000560915	AKNA	Q7Z591	1439 aa		43.05	■■■■■ 4.48
KATNBL1-215	ENST00000560915	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	43.03	■■■■■ 4.48
KATNBL1-215	ENST00000560915	ADGRL1	O94910	1474 aa		43.02	■■■■■ 4.48
KATNBL1-215	ENST00000560915	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.02	■■■■■ 4.48
KATNBL1-215	ENST00000560915	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43	■■■■■ 4.47
KATNBL1-215	ENST00000560915	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		43	■■■■■ 4.47
KATNBL1-215	ENST00000560915	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.99	■■■■■ 4.47
KATNBL1-215	ENST00000560915	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.96	■■■■■ 4.47
KATNBL1-215	ENST00000560915	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.96	■■■■■ 4.47
KATNBL1-215	ENST00000560915	DAPK1	P53355	1430 aa		42.92	■■■■■ 4.46
KATNBL1-215	ENST00000560915	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.92	■■■■■ 4.46
KATNBL1-215	ENST00000560915	ITGAE	P38570	1179 aa		42.92	■■■■■ 4.46
KATNBL1-215	ENST00000560915	ABCC5	O15440	1437 aa		42.9	■■■■■ 4.46
KATNBL1-215	ENST00000560915	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.9	■■■■■ 4.46
KATNBL1-215	ENST00000560915	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.86	■■■■■ 4.45
KATNBL1-215	ENST00000560915	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.85	■■■■■ 4.45
KATNBL1-215	ENST00000560915	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.85	■■■■■ 4.45
KATNBL1-215	ENST00000560915	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.82	■■■■■ 4.45
KATNBL1-215	ENST00000560915	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.81	■■■■■ 4.44
KATNBL1-215	ENST00000560915	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.79	■■■■■ 4.44
KATNBL1-215	ENST00000560915	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
KATNBL1-215	ENST00000560915	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.79	■■■■■ 4.44
KATNBL1-215	ENST00000560915	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.78	■■■■■ 4.44
KATNBL1-215	ENST00000560915	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.76	■■■■■ 4.44
KATNBL1-215	ENST00000560915	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.74	■■■■■ 4.43
KATNBL1-215	ENST00000560915	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.74	■■■■■ 4.43
KATNBL1-215	ENST00000560915	KDM5C	P41229	1560 aa		42.73	■■■■■ 4.43
KATNBL1-215	ENST00000560915	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.73	■■■■■ 4.43
KATNBL1-215	ENST00000560915	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.72	■■■■■ 4.43
KATNBL1-215	ENST00000560915	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.71	■■■■■ 4.43
KATNBL1-215	ENST00000560915	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.71	■■■■■ 4.43
KATNBL1-215	ENST00000560915	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.71	■■■■■ 4.43
KATNBL1-215	ENST00000560915	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.68	■■■■■ 4.42
KATNBL1-215	ENST00000560915	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
KATNBL1-215	ENST00000560915	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.66	■■■■■ 4.42
KATNBL1-215	ENST00000560915	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.65	■■■■■ 4.42
KATNBL1-215	ENST00000560915	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.65	■■■■■ 4.42
KATNBL1-215	ENST00000560915	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.63	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.62	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.61	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.61	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.61	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.59	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	KDM6B	O15054	1643 aa		42.59	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.59	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.58	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.58	■■■■■ 4.41
KATNBL1-215	ENST00000560915	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.56	■■■■■ 4.4
KATNBL1-215	ENST00000560915	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.56	■■■■■ 4.4
KATNBL1-215	ENST00000560915	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.55	■■■■■ 4.4
KATNBL1-215	ENST00000560915	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.52	■■■■■ 4.4
KATNBL1-215	ENST00000560915	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.52	■■■■■ 4.4
KATNBL1-215	ENST00000560915	NAIP	Q13075	1403 aa		42.49	■■■■■ 4.39
KATNBL1-215	ENST00000560915	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.48	■■■■■ 4.39
KATNBL1-215	ENST00000560915	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.46	■■■■■ 4.39
KATNBL1-215	ENST00000560915	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.45	■■■■■ 4.39
KATNBL1-215	ENST00000560915	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.43	■■■■■ 4.38
KATNBL1-215	ENST00000560915	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.4	■■■■■ 4.38
KATNBL1-215	ENST00000560915	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.39	■■■■■ 4.38
KATNBL1-215	ENST00000560915	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.38	■■■■■ 4.37
KATNBL1-215	ENST00000560915	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.38	■■■■■ 4.37
KATNBL1-215	ENST00000560915	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.32	■■■■■ 4.37
KATNBL1-215	ENST00000560915	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KATNBL1-215	ENST00000560915	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KATNBL1-215	ENST00000560915	A2M	P01023	1474 aa		42.27	■■■■■ 4.36
KATNBL1-215	ENST00000560915	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.25	■■■■■ 4.35
KATNBL1-215	ENST00000560915	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.23	■■■■■ 4.35
KATNBL1-215	ENST00000560915	ATP10A	O60312	1499 aa		42.22	■■■■■ 4.35
KATNBL1-215	ENST00000560915	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
KATNBL1-215	ENST00000560915	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.18	■■■■■ 4.34
KATNBL1-215	ENST00000560915	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.13	■■■■■ 4.33
KATNBL1-215	ENST00000560915	HRC	P23327	699 aa		42.13	■■■■■ 4.33
KATNBL1-215	ENST00000560915	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.12	■■■■■ 4.33
KATNBL1-215	ENST00000560915	UNC13B	O14795	1591 aa		42.07	■■■■■ 4.33
KATNBL1-215	ENST00000560915	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.07	■■■■■ 4.32
KATNBL1-215	ENST00000560915	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
KATNBL1-215	ENST00000560915	AGL	P35573	1532 aa		42.02	■■■■■ 4.32

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