RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
USP3-AS1-207ENST00000560622 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.92■■□□□ 1.9
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.9■■□□□ 1.9
USP3-AS1-207ENST00000560622 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.9■■□□□ 1.9
USP3-AS1-207ENST00000560622 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.89■■□□□ 1.89
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
USP3-AS1-207ENST00000560622 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
USP3-AS1-207ENST00000560622 KDM5CP41229 1560 aa26.84■■□□□ 1.89
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.8■■□□□ 1.88
USP3-AS1-207ENST00000560622 PREX2Q70Z35 1606 aa26.79■■□□□ 1.88
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATP10AO60312 1499 aa26.78■■□□□ 1.88
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.76■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.76■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.75■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.75■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.75■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.74■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.74■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.73■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCA6Q8N139 1617 aa26.73■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCC1P33527 1531 aa26.7■■□□□ 1.87
USP3-AS1-207ENST00000560622 CLIP1P30622 1438 aa26.7■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 REREQ9P2R6 1566 aa26.7■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.68■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 MLECQ14165 292 aa26.68■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 AFAP1Q8N556 730 aa26.68■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 HSPA2P54652 639 aa26.67■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.66■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.66■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.64■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.64■■□□□ 1.86
USP3-AS1-207ENST00000560622 FBXO41Q8TF61 875 aa26.62■■□□□ 1.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.61■■□□□ 1.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.59■■□□□ 1.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 STRCQ7RTU9 1775 aa26.59■■□□□ 1.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 C3P01024 1663 aa26.59■■□□□ 1.85
USP3-AS1-207ENST00000560622 AGLP35573 1532 aa26.57■■□□□ 1.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
USP3-AS1-207ENST00000560622 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.49■■□□□ 1.83
USP3-AS1-207ENST00000560622 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLXNC1O60486 1568 aa26.41■■□□□ 1.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 MROH2AA6NES4 1674 aa26.41■■□□□ 1.82
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATP7AQ04656 1500 aa26.39■■□□□ 1.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 TIAM1Q13009 1591 aa26.38■■□□□ 1.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.38■■□□□ 1.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.37■■□□□ 1.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.37■■□□□ 1.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 CERKQ8TCT0 537 aa26.33■■□□□ 1.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
USP3-AS1-207ENST00000560622 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.31■■□□□ 1.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.3■■□□□ 1.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.29■■□□□ 1.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.29■■□□□ 1.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 MBD5Q9P267 1494 aa26.29■■□□□ 1.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.28■■□□□ 1.8
USP3-AS1-207ENST00000560622 A2MP01023 1474 aa26.26■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.26■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 PTPRTO14522 1441 aa26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEP162Q5TB80 1403 aa26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 NPATQ14207 1427 aa26.23■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 NCOA1Q15788 1441 aa26.23■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.23■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.22■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZMYM3Q14202 1370 aa26.21■■□□□ 1.79
USP3-AS1-207ENST00000560622 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.19■■□□□ 1.78
USP3-AS1-207ENST00000560622 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.17■■□□□ 1.78
USP3-AS1-207ENST00000560622 PTPRKQ15262 1439 aa26.16■■□□□ 1.78
USP3-AS1-207ENST00000560622 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
USP3-AS1-207ENST00000560622 NCOA2Q15596 1464 aa26.13■■□□□ 1.77
USP3-AS1-207ENST00000560622 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.13■■□□□ 1.77
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
USP3-AS1-207ENST00000560622 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.11■■□□□ 1.77
USP3-AS1-207ENST00000560622 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.06■■□□□ 1.76
USP3-AS1-207ENST00000560622 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLA2R1Q13018 1463 aa26.05■■□□□ 1.76
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.05■■□□□ 1.76
USP3-AS1-207ENST00000560622 GGT6Q6P531 493 aa26.05■■□□□ 1.76
USP3-AS1-207ENST00000560622 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
USP3-AS1-207ENST00000560622 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.02■■□□□ 1.76
USP3-AS1-207ENST00000560622 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.01■■□□□ 1.75
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.01■■□□□ 1.75
USP3-AS1-207ENST00000560622 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-207ENST00000560622 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-207ENST00000560622 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.98■■□□□ 1.75
USP3-AS1-207ENST00000560622 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.98■■□□□ 1.75
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