RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560587.1

ZNF280D-215, Transcript of zinc finger protein 280D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZNF280D, Length 1,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF280D-215ENST00000560587 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.61■■■■□ 3.93
ZNF280D-215ENST00000560587 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.6■■■■□ 3.93
ZNF280D-215ENST00000560587 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.59■■■■□ 3.93
ZNF280D-215ENST00000560587 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.58■■■■□ 3.93
ZNF280D-215ENST00000560587 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.58■■■■□ 3.93
ZNF280D-215ENST00000560587 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.58■■■■□ 3.93
ZNF280D-215ENST00000560587 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.57■■■■□ 3.92
ZNF280D-215ENST00000560587 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.56■■■■□ 3.92
ZNF280D-215ENST00000560587 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.54■■■■□ 3.92
ZNF280D-215ENST00000560587 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.48■■■■□ 3.91
ZNF280D-215ENST00000560587 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.47■■■■□ 3.91
ZNF280D-215ENST00000560587 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.45■■■■□ 3.91
ZNF280D-215ENST00000560587 TIAM1Q13009 1591 aa39.45■■■■□ 3.91
ZNF280D-215ENST00000560587 ABCC1P33527 1531 aa39.45■■■■□ 3.91
ZNF280D-215ENST00000560587 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
ZNF280D-215ENST00000560587 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.4■■■■□ 3.9
ZNF280D-215ENST00000560587 KDM5CP41229 1560 aa39.39■■■■□ 3.9
ZNF280D-215ENST00000560587 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.39■■■■□ 3.9
ZNF280D-215ENST00000560587 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.39■■■■□ 3.9
ZNF280D-215ENST00000560587 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.34■■■■□ 3.89
ZNF280D-215ENST00000560587 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
ZNF280D-215ENST00000560587 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.33■■■■□ 3.89
ZNF280D-215ENST00000560587 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.31■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 AFAP1Q8N556 730 aa39.31■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.29■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 MAP3K1Q13233 1512 aa39.28■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.28■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.27■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.26■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 NCOA2Q15596 1464 aa39.26■■■■□ 3.88
ZNF280D-215ENST00000560587 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.25■■■■□ 3.87
ZNF280D-215ENST00000560587 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.24■■■■□ 3.87
ZNF280D-215ENST00000560587 ATP10AO60312 1499 aa39.24■■■■□ 3.87
ZNF280D-215ENST00000560587 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.22■■■■□ 3.87
ZNF280D-215ENST00000560587 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.22■■■■□ 3.87
ZNF280D-215ENST00000560587 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.21■■■■□ 3.87
ZNF280D-215ENST00000560587 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.2■■■■□ 3.87
ZNF280D-215ENST00000560587 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.2■■■■□ 3.87
ZNF280D-215ENST00000560587 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.17■■■■□ 3.86
ZNF280D-215ENST00000560587 ABCA6Q8N139 1617 aa39.15■■■■□ 3.86
ZNF280D-215ENST00000560587 MADDQ8WXG6 1647 aa39.14■■■■□ 3.86
ZNF280D-215ENST00000560587 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.12■■■■□ 3.85
ZNF280D-215ENST00000560587 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.11■■■■□ 3.85
ZNF280D-215ENST00000560587 REREQ9P2R6 1566 aa39.1■■■■□ 3.85
ZNF280D-215ENST00000560587 APLP2Q06481 763 aa39.09■■■■□ 3.85
ZNF280D-215ENST00000560587 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
ZNF280D-215ENST00000560587 PTPRMP28827 1452 aa39.07■■■■□ 3.84
ZNF280D-215ENST00000560587 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
ZNF280D-215ENST00000560587 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
ZNF280D-215ENST00000560587 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
ZNF280D-215ENST00000560587 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
ZNF280D-215ENST00000560587 ATP7AQ04656 1500 aa39.01■■■■□ 3.84
ZNF280D-215ENST00000560587 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.01■■■■□ 3.84
ZNF280D-215ENST00000560587 MBD5Q9P267 1494 aa39■■■■□ 3.83
ZNF280D-215ENST00000560587 MLECQ14165 292 aa38.99■■■■□ 3.83
ZNF280D-215ENST00000560587 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.98■■■■□ 3.83
ZNF280D-215ENST00000560587 AGLP35573 1532 aa38.94■■■■□ 3.82
ZNF280D-215ENST00000560587 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.91■■■■□ 3.82
ZNF280D-215ENST00000560587 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.9■■■■□ 3.82
ZNF280D-215ENST00000560587 MIA2Q96PC5 1412 aa38.86■■■■□ 3.81
ZNF280D-215ENST00000560587 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.85■■■■□ 3.81
ZNF280D-215ENST00000560587 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.83■■■■□ 3.81
ZNF280D-215ENST00000560587 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.83■■■■□ 3.81
ZNF280D-215ENST00000560587 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.83■■■■□ 3.81
ZNF280D-215ENST00000560587 PLXNC1O60486 1568 aa38.82■■■■□ 3.81
ZNF280D-215ENST00000560587 A2MP01023 1474 aa38.81■■■■□ 3.8
ZNF280D-215ENST00000560587 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.72■■■■□ 3.79
ZNF280D-215ENST00000560587 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.68■■■■□ 3.78
ZNF280D-215ENST00000560587 TSPY4P0CV99 314 aa38.68■■■■□ 3.78
ZNF280D-215ENST00000560587 TSPY10P0CW01 314 aa38.68■■■■□ 3.78
ZNF280D-215ENST00000560587 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
ZNF280D-215ENST00000560587 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.65■■■■□ 3.78
ZNF280D-215ENST00000560587 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.65■■■■□ 3.78
ZNF280D-215ENST00000560587 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.63■■■■□ 3.78
ZNF280D-215ENST00000560587 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
ZNF280D-215ENST00000560587 LMTK3Q96Q04 1460 aa38.6■■■■□ 3.77
ZNF280D-215ENST00000560587 C3P01024 1663 aa38.59■■■■□ 3.77
ZNF280D-215ENST00000560587 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
ZNF280D-215ENST00000560587 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
ZNF280D-215ENST00000560587 MROH2AA6NES4 1674 aa38.56■■■■□ 3.76
ZNF280D-215ENST00000560587 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.56■■■■□ 3.76
ZNF280D-215ENST00000560587 GGT6Q6P531 493 aa38.52■■■■□ 3.76
ZNF280D-215ENST00000560587 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.52■■■■□ 3.76
ZNF280D-215ENST00000560587 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.51■■■■□ 3.76
ZNF280D-215ENST00000560587 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
ZNF280D-215ENST00000560587 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.75
ZNF280D-215ENST00000560587 ABCC5O15440 1437 aa38.48■■■■□ 3.75
ZNF280D-215ENST00000560587 DAPK1P53355 1430 aa38.47■■■■□ 3.75
ZNF280D-215ENST00000560587 KIF3BO15066 747 aa38.46■■■■□ 3.75
ZNF280D-215ENST00000560587 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.46■■■■□ 3.75
ZNF280D-215ENST00000560587 ZMYM3Q14202 1370 aa38.41■■■■□ 3.74
ZNF280D-215ENST00000560587 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
ZNF280D-215ENST00000560587 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.4■■■■□ 3.74
ZNF280D-215ENST00000560587 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
ZNF280D-215ENST00000560587 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.39■■■■□ 3.74
ZNF280D-215ENST00000560587 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.38■■■■□ 3.74
ZNF280D-215ENST00000560587 NPATQ14207 1427 aa38.36■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 249.7 ms