RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-209ENST00000559551 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-209ENST00000559551 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-209ENST00000559551 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCC5O15440 1437 aa21.52■■□□□ 1.04
RABGGTA-209ENST00000559551 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.52■■□□□ 1.03
RABGGTA-209ENST00000559551 MAPKBP1O60336 1514 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-209ENST00000559551 DAPK1P53355 1430 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-209ENST00000559551 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
RABGGTA-209ENST00000559551 PLCH2O75038 1416 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.5■■□□□ 1.03
RABGGTA-209ENST00000559551 MBD5Q9P267 1494 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-209ENST00000559551 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 HFM1A2PYH4 1435 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.43■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NAIPQ13075 1403 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 AKNAQ7Z591 1439 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 KDM6BO15054 1643 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCC1P33527 1531 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 HRCP23327 699 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 DIP2BQ9P265 1576 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 ROCK1Q13464 1354 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 FANCAO15360 1455 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 ADGRL2O95490 1459 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 GLI2P10070 1586 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 CD109Q6YHK3 1445 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 NCOA1Q15788 1441 aa21.33■■□□□ 1.01
RABGGTA-209ENST00000559551 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.33■■□□□ 1
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-209ENST00000559551 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-209ENST00000559551 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.31■■□□□ 1
RABGGTA-209ENST00000559551 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
RABGGTA-209ENST00000559551 ADGRL1O94910 1474 aa21.26■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.25■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 TSPOAP1O95153 1857 aa21.25■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.25■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.24■□□□□ 0.99
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RABGGTA-209ENST00000559551 TSPY10P0CW01 314 aa21.23■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.23■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 PLXNC1O60486 1568 aa21.22■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.22■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 AFAP1Q8N556 730 aa21.21■□□□□ 0.99
RABGGTA-209ENST00000559551 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.2■□□□□ 0.98
RABGGTA-209ENST00000559551 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RABGGTA-209ENST00000559551 NEO1Q92859 1461 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF15Q9NS87 1388 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-209ENST00000559551 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-209ENST00000559551 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-209ENST00000559551 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.15■□□□□ 0.98
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RABGGTA-209ENST00000559551 ATP7AQ04656 1500 aa21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-209ENST00000559551 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.13■□□□□ 0.97
RABGGTA-209ENST00000559551 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.13■□□□□ 0.97
RABGGTA-209ENST00000559551 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
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RABGGTA-209ENST00000559551 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.1■□□□□ 0.97
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RABGGTA-209ENST00000559551 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.06■□□□□ 0.96
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RABGGTA-209ENST00000559551 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-209ENST00000559551 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCA6Q8N139 1617 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGGTA-209ENST00000559551 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.04■□□□□ 0.96
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RABGGTA-209ENST00000559551 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.03■□□□□ 0.96
RABGGTA-209ENST00000559551 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.99■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.99■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 DEPDC5O75140 1603 aa20.98■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.98■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.98■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 FOXD1Q16676 465 aa20.97■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 NUP155O75694 1391 aa20.97■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
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