RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 POTEB3A0JP26 581 aa12.86□□□□□ -0.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 POTEBQ6S5H4 581 aa12.86□□□□□ -0.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.85□□□□□ -0.35
USP3-AS1-202ENST00000559357 DOK7Q18PE1 504 aa12.83□□□□□ -0.36
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM205CA6NFA0 338 aa12.8□□□□□ -0.36
USP3-AS1-202ENST00000559357 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.79□□□□□ -0.36
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIMBP2O15034 1052 aa12.74□□□□□ -0.37
USP3-AS1-202ENST00000559357 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.74□□□□□ -0.37
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa12.72□□□□□ -0.37
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF3CO14782 793 aa12.71□□□□□ -0.37
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R37O75864 691 aa12.7□□□□□ -0.38
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR153Q6NV75 609 aa12.69□□□□□ -0.38
USP3-AS1-202ENST00000559357 C2orf72A6NCS6 295 aa12.67□□□□□ -0.38
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERBB3P21860 1342 aa12.65□□□□□ -0.38
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.63□□□□□ -0.39
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARSIQ5FYB1 569 aa12.61□□□□□ -0.39
USP3-AS1-202ENST00000559357 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
USP3-AS1-202ENST00000559357 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMC2Q8TDI7 906 aa12.58□□□□□ -0.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.57□□□□□ -0.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC34A2O95436 690 aa12.55□□□□□ -0.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF687Q8N1G0 1237 aa12.52□□□□□ -0.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.49□□□□□ -0.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUDT7P0C024 238 aa12.47□□□□□ -0.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.47□□□□□ -0.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOXK1P85037 733 aa12.46□□□□□ -0.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
USP3-AS1-202ENST00000559357 DSG2Q14126 1118 aa12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLPP6Q8IY26 295 aa12.42□□□□□ -0.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 LHX6Q9UPM6 363 aa12.41□□□□□ -0.42
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-202ENST00000559357 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
USP3-AS1-202ENST00000559357 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.37□□□□□ -0.43
USP3-AS1-202ENST00000559357 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.36□□□□□ -0.43
USP3-AS1-202ENST00000559357 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTGER2P43116 358 aa12.34□□□□□ -0.43
USP3-AS1-202ENST00000559357 POTEEQ6S8J3 1075 aa12.33□□□□□ -0.44
USP3-AS1-202ENST00000559357 PBX2P40425 430 aa12.32□□□□□ -0.44
USP3-AS1-202ENST00000559357 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
USP3-AS1-202ENST00000559357 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.32□□□□□ -0.44
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-202ENST00000559357 OXER1Q8TDS5 423 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBC1D12O60347 775 aa12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-202ENST00000559357 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDE4AP27815 886 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-202ENST00000559357 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGAP33O14559 1287 aa12.21□□□□□ -0.45
USP3-AS1-202ENST00000559357 MFSD10Q14728 455 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-202ENST00000559357 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.18□□□□□ -0.46
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
USP3-AS1-202ENST00000559357 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.16□□□□□ -0.46
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSEN2P49810 448 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-202ENST00000559357 DMRTA1Q5VZB9 504 aa12.14□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.14□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 TK2O00142 265 aa12.11□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.1□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.1□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 HRO43593 1189 aa12.09□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 EVI5O60447 810 aa12.09□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOSBP53539 338 aa12.09□□□□□ -0.47
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNK17Q96T54 332 aa12.08□□□□□ -0.48
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.08□□□□□ -0.48
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.07□□□□□ -0.48
USP3-AS1-202ENST00000559357 JPH4Q96JJ6 628 aa12.05□□□□□ -0.48
USP3-AS1-202ENST00000559357 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP3K9P80192 1104 aa12.04□□□□□ -0.48
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNH8Q96L42 1107 aa12.03□□□□□ -0.48
USP3-AS1-202ENST00000559357 CAMK2BQ13554 666 aa12.02□□□□□ -0.49
USP3-AS1-202ENST00000559357 HCSTQ9UBK5 93 aa12.01□□□□□ -0.49
USP3-AS1-202ENST00000559357 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa12□□□□□ -0.49
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.99□□□□□ -0.49
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTPREP23469 700 aa11.98□□□□□ -0.49
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.97□□□□□ -0.49
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 DPYSL4O14531 572 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHF14O94880 888 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 STAC3Q96MF2 364 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXW7Q969H0 707 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL9A1P20849 921 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.1 ms