RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558982.5

MIR9-3HG-206, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 4

Gene MIR9-3HG, Length 569 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-206ENST00000558982 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.3■■■□□ 2.44
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.29■■■□□ 2.44
MIR9-3HG-206ENST00000558982 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.29■■■□□ 2.44
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PREX2Q70Z35 1606 aa30.28■■■□□ 2.44
MIR9-3HG-206ENST00000558982 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.27■■■□□ 2.44
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.26■■■□□ 2.43
MIR9-3HG-206ENST00000558982 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.22■■■□□ 2.43
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.21■■■□□ 2.43
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.21■■■□□ 2.43
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.19■■■□□ 2.42
MIR9-3HG-206ENST00000558982 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.19■■■□□ 2.42
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.19■■■□□ 2.42
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KDM5CP41229 1560 aa30.15■■■□□ 2.42
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ABCC1P33527 1531 aa30.14■■■□□ 2.42
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.13■■■□□ 2.41
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.12■■■□□ 2.41
MIR9-3HG-206ENST00000558982 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.12■■■□□ 2.41
MIR9-3HG-206ENST00000558982 AFAP1Q8N556 730 aa30.1■■■□□ 2.41
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.1■■■□□ 2.41
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MADDQ8WXG6 1647 aa30.09■■■□□ 2.41
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.07■■■□□ 2.4
MIR9-3HG-206ENST00000558982 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.07■■■□□ 2.4
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.06■■■□□ 2.4
MIR9-3HG-206ENST00000558982 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.06■■■□□ 2.4
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ATP10AO60312 1499 aa30.05■■■□□ 2.4
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PTPRMP28827 1452 aa30.04■■■□□ 2.4
MIR9-3HG-206ENST00000558982 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.04■■■□□ 2.4
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TIAM1Q13009 1591 aa30.01■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.99■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ABCA6Q8N139 1617 aa29.99■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.98■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.96■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
MIR9-3HG-206ENST00000558982 REREQ9P2R6 1566 aa29.93■■■□□ 2.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.91■■■□□ 2.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.9■■■□□ 2.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MLECQ14165 292 aa29.9■■■□□ 2.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.9■■■□□ 2.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NCOA2Q15596 1464 aa29.89■■■□□ 2.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.89■■■□□ 2.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.86■■■□□ 2.37
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MAP3K1Q13233 1512 aa29.84■■■□□ 2.37
MIR9-3HG-206ENST00000558982 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
MIR9-3HG-206ENST00000558982 AGLP35573 1532 aa29.81■■■□□ 2.36
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MBD5Q9P267 1494 aa29.8■■■□□ 2.36
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ATP7AQ04656 1500 aa29.8■■■□□ 2.36
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.73■■■□□ 2.35
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.72■■■□□ 2.35
MIR9-3HG-206ENST00000558982 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.72■■■□□ 2.35
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PLXNC1O60486 1568 aa29.7■■■□□ 2.35
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.66■■■□□ 2.34
MIR9-3HG-206ENST00000558982 A2MP01023 1474 aa29.66■■■□□ 2.34
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.65■■■□□ 2.34
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.63■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-206ENST00000558982 C3P01024 1663 aa29.63■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.63■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.6■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.57■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MIA2Q96PC5 1412 aa29.56■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.56■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-206ENST00000558982 APLP2Q06481 763 aa29.55■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MROH2AA6NES4 1674 aa29.53■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.53■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-206ENST00000558982 HSPA2P54652 639 aa29.52■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-206ENST00000558982 GGT6Q6P531 493 aa29.45■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.45■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TSPY4P0CV99 314 aa29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TSPY10P0CW01 314 aa29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZMYM3Q14202 1370 aa29.43■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-206ENST00000558982 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.41■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.39■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.39■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KIF3BO15066 747 aa29.37■■■□□ 2.29
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.37■■■□□ 2.29
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NPATQ14207 1427 aa29.37■■■□□ 2.29
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ABCC5O15440 1437 aa29.34■■■□□ 2.29
MIR9-3HG-206ENST00000558982 STRCQ7RTU9 1775 aa29.34■■■□□ 2.29
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PTPRKQ15262 1439 aa29.32■■■□□ 2.28
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.31■■■□□ 2.28
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
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