RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 MICALL2Q8IY33 904 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-205ENST00000558714 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-205ENST00000558714 SNPHO15079 494 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-205ENST00000558714 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-205ENST00000558714 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-205ENST00000558714 PPP1R37O75864 691 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-205ENST00000558714 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-205ENST00000558714 KIF3CO14782 793 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-205ENST00000558714 ST18O60284 1047 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-205ENST00000558714 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 DOK7Q18PE1 504 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 TMC2Q8TDI7 906 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 C2orf72A6NCS6 295 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 POTEMA6NI47 508 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 POTEGQ6S5H5 508 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 RIMBP2O15034 1052 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 NBR1Q14596 966 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD3-205ENST00000558714 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 SLC34A2O95436 690 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 FOXK1P85037 733 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 PDE4AP27815 886 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 EMP3P54852 163 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 GPR153Q6NV75 609 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 MARVELD3Q96A59 401 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 DSG2Q14126 1118 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 PLPP6Q8IY26 295 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-205ENST00000558714 ARSIQ5FYB1 569 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 MFSD10Q14728 455 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 P3H3Q8IVL6 736 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 FAM205CA6NFA0 338 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 ERBB3P21860 1342 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 TBC1D12O60347 775 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 POTEB3A0JP26 581 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 NUDT7P0C024 238 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 POTEBQ6S5H4 581 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 OXER1Q8TDS5 423 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-205ENST00000558714 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 WDR70Q9NW82 654 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 LHX6Q9UPM6 363 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 CAMK2BQ13554 666 aa6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-205ENST00000558714 PBX2P40425 430 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 MAP3K9P80192 1104 aa6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 EVI5O60447 810 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 E2F4Q16254 413 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.55□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-205ENST00000558714 ARHGAP33O14559 1287 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 FOSBP53539 338 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 JPH4Q96JJ6 628 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 DPYSL4O14531 572 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 PDIA6Q15084 440 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 KCNH8Q96L42 1107 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 SEMA3EO15041 775 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 PHF14O94880 888 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 PTGER2P43116 358 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 MMRN1Q13201 1228 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-205ENST00000558714 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.47□□□□□ -1.37
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