RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558131.1

RPL28-205, Transcript of ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RPL28, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28-205ENST00000558131 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
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RPL28-205ENST00000558131 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.03■■□□□ 1.92
RPL28-205ENST00000558131 SCAPERQ9BY12 1400 aa27■■□□□ 1.91
RPL28-205ENST00000558131 PREX2Q70Z35 1606 aa26.99■■□□□ 1.91
RPL28-205ENST00000558131 KDM5CP41229 1560 aa26.98■■□□□ 1.91
RPL28-205ENST00000558131 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.98■■□□□ 1.91
RPL28-205ENST00000558131 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.97■■□□□ 1.91
RPL28-205ENST00000558131 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.95■■□□□ 1.91
RPL28-205ENST00000558131 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.94■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.93■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.93■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 CLIP1P30622 1438 aa26.92■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.92■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.9■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.9■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
RPL28-205ENST00000558131 ABCC1P33527 1531 aa26.89■■□□□ 1.89
RPL28-205ENST00000558131 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
RPL28-205ENST00000558131 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.88■■□□□ 1.89
RPL28-205ENST00000558131 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.88■■□□□ 1.89
RPL28-205ENST00000558131 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.87■■□□□ 1.89
RPL28-205ENST00000558131 ABCA6Q8N139 1617 aa26.87■■□□□ 1.89
RPL28-205ENST00000558131 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.86■■□□□ 1.89
RPL28-205ENST00000558131 ATP10AO60312 1499 aa26.86■■□□□ 1.89
RPL28-205ENST00000558131 REREQ9P2R6 1566 aa26.84■■□□□ 1.89
RPL28-205ENST00000558131 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.78■■□□□ 1.88
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RPL28-205ENST00000558131 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.77■■□□□ 1.88
RPL28-205ENST00000558131 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.76■■□□□ 1.87
RPL28-205ENST00000558131 AFAP1Q8N556 730 aa26.75■■□□□ 1.87
RPL28-205ENST00000558131 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.73■■□□□ 1.87
RPL28-205ENST00000558131 MLECQ14165 292 aa26.7■■□□□ 1.86
RPL28-205ENST00000558131 AGLP35573 1532 aa26.69■■□□□ 1.86
RPL28-205ENST00000558131 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
RPL28-205ENST00000558131 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.68■■□□□ 1.86
RPL28-205ENST00000558131 C3P01024 1663 aa26.66■■□□□ 1.86
RPL28-205ENST00000558131 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
RPL28-205ENST00000558131 HSPA2P54652 639 aa26.61■■□□□ 1.85
RPL28-205ENST00000558131 TIAM1Q13009 1591 aa26.61■■□□□ 1.85
RPL28-205ENST00000558131 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.6■■□□□ 1.85
RPL28-205ENST00000558131 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.58■■□□□ 1.85
RPL28-205ENST00000558131 PLXNC1O60486 1568 aa26.58■■□□□ 1.85
RPL28-205ENST00000558131 CEP162Q5TB80 1403 aa26.56■■□□□ 1.84
RPL28-205ENST00000558131 STRCQ7RTU9 1775 aa26.56■■□□□ 1.84
RPL28-205ENST00000558131 ATP7AQ04656 1500 aa26.55■■□□□ 1.84
RPL28-205ENST00000558131 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RPL28-205ENST00000558131 MROH2AA6NES4 1674 aa26.54■■□□□ 1.84
RPL28-205ENST00000558131 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RPL28-205ENST00000558131 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.53■■□□□ 1.84
RPL28-205ENST00000558131 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.5■■□□□ 1.83
RPL28-205ENST00000558131 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.49■■□□□ 1.83
RPL28-205ENST00000558131 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.49■■□□□ 1.83
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RPL28-205ENST00000558131 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
RPL28-205ENST00000558131 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.47■■□□□ 1.83
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RPL28-205ENST00000558131 MBD5Q9P267 1494 aa26.44■■□□□ 1.82
RPL28-205ENST00000558131 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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RPL28-205ENST00000558131 A2MP01023 1474 aa26.4■■□□□ 1.82
RPL28-205ENST00000558131 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
RPL28-205ENST00000558131 NCOA2Q15596 1464 aa26.36■■□□□ 1.81
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RPL28-205ENST00000558131 NPATQ14207 1427 aa26.32■■□□□ 1.8
RPL28-205ENST00000558131 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.31■■□□□ 1.8
RPL28-205ENST00000558131 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.3■■□□□ 1.8
RPL28-205ENST00000558131 ZMYM3Q14202 1370 aa26.28■■□□□ 1.8
RPL28-205ENST00000558131 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.28■■□□□ 1.8
RPL28-205ENST00000558131 NCOA1Q15788 1441 aa26.27■■□□□ 1.8
RPL28-205ENST00000558131 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.27■■□□□ 1.8
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RPL28-205ENST00000558131 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.25■■□□□ 1.79
RPL28-205ENST00000558131 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.25■■□□□ 1.79
RPL28-205ENST00000558131 PTPRTO14522 1441 aa26.24■■□□□ 1.79
RPL28-205ENST00000558131 PTPRKQ15262 1439 aa26.24■■□□□ 1.79
RPL28-205ENST00000558131 CERKQ8TCT0 537 aa26.24■■□□□ 1.79
RPL28-205ENST00000558131 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
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RPL28-205ENST00000558131 MAP3K1Q13233 1512 aa26.2■■□□□ 1.79
RPL28-205ENST00000558131 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.19■■□□□ 1.78
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RPL28-205ENST00000558131 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.17■■□□□ 1.78
RPL28-205ENST00000558131 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.17■■□□□ 1.78
RPL28-205ENST00000558131 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.16■■□□□ 1.78
RPL28-205ENST00000558131 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.15■■□□□ 1.78
RPL28-205ENST00000558131 GGT6Q6P531 493 aa26.15■■□□□ 1.78
RPL28-205ENST00000558131 PLA2R1Q13018 1463 aa26.13■■□□□ 1.77
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RPL28-205ENST00000558131 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
RPL28-205ENST00000558131 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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