RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556975.5

TMEM260-214, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM260, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-214ENST00000556975 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.56■■■■□ 3.44
TMEM260-214ENST00000556975 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.54■■■■□ 3.44
TMEM260-214ENST00000556975 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.51■■■■□ 3.44
TMEM260-214ENST00000556975 CEP162Q5TB80 1403 aa36.5■■■■□ 3.43
TMEM260-214ENST00000556975 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.48■■■■□ 3.43
TMEM260-214ENST00000556975 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.47■■■■□ 3.43
TMEM260-214ENST00000556975 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.47■■■■□ 3.43
TMEM260-214ENST00000556975 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.45■■■■□ 3.43
TMEM260-214ENST00000556975 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TMEM260-214ENST00000556975 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.44■■■■□ 3.42
TMEM260-214ENST00000556975 PREX2Q70Z35 1606 aa36.43■■■■□ 3.42
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.4■■■■□ 3.42
TMEM260-214ENST00000556975 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
TMEM260-214ENST00000556975 AFAP1Q8N556 730 aa36.36■■■■□ 3.41
TMEM260-214ENST00000556975 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.36■■■■□ 3.41
TMEM260-214ENST00000556975 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.35■■■■□ 3.41
TMEM260-214ENST00000556975 PTPRMP28827 1452 aa36.35■■■■□ 3.41
TMEM260-214ENST00000556975 KDM5CP41229 1560 aa36.34■■■■□ 3.41
TMEM260-214ENST00000556975 ATP10AO60312 1499 aa36.32■■■■□ 3.41
TMEM260-214ENST00000556975 ABCC1P33527 1531 aa36.3■■■■□ 3.4
TMEM260-214ENST00000556975 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
TMEM260-214ENST00000556975 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.29■■■■□ 3.4
TMEM260-214ENST00000556975 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.29■■■■□ 3.4
TMEM260-214ENST00000556975 MADDQ8WXG6 1647 aa36.29■■■■□ 3.4
TMEM260-214ENST00000556975 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.29■■■■□ 3.4
TMEM260-214ENST00000556975 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.26■■■■□ 3.4
TMEM260-214ENST00000556975 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.25■■■■□ 3.39
TMEM260-214ENST00000556975 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.24■■■■□ 3.39
TMEM260-214ENST00000556975 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.23■■■■□ 3.39
TMEM260-214ENST00000556975 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.2■■■■□ 3.39
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
TMEM260-214ENST00000556975 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.18■■■■□ 3.38
TMEM260-214ENST00000556975 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
TMEM260-214ENST00000556975 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.17■■■■□ 3.38
TMEM260-214ENST00000556975 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.17■■■■□ 3.38
TMEM260-214ENST00000556975 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
TMEM260-214ENST00000556975 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.15■■■■□ 3.38
TMEM260-214ENST00000556975 MLECQ14165 292 aa36.14■■■■□ 3.38
TMEM260-214ENST00000556975 REREQ9P2R6 1566 aa36.14■■■■□ 3.38
TMEM260-214ENST00000556975 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.13■■■■□ 3.37
TMEM260-214ENST00000556975 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.12■■■■□ 3.37
TMEM260-214ENST00000556975 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.11■■■■□ 3.37
TMEM260-214ENST00000556975 ABCA6Q8N139 1617 aa36.09■■■■□ 3.37
TMEM260-214ENST00000556975 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.08■■■■□ 3.37
TMEM260-214ENST00000556975 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.37
TMEM260-214ENST00000556975 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.07■■■■□ 3.37
TMEM260-214ENST00000556975 TIAM1Q13009 1591 aa36.07■■■■□ 3.37
TMEM260-214ENST00000556975 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.04■■■■□ 3.36
TMEM260-214ENST00000556975 AGLP35573 1532 aa36.03■■■■□ 3.36
TMEM260-214ENST00000556975 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
TMEM260-214ENST00000556975 NCOA2Q15596 1464 aa35.98■■■■□ 3.35
TMEM260-214ENST00000556975 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
TMEM260-214ENST00000556975 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.95■■■■□ 3.35
TMEM260-214ENST00000556975 MAP3K1Q13233 1512 aa35.93■■■■□ 3.34
TMEM260-214ENST00000556975 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.93■■■■□ 3.34
TMEM260-214ENST00000556975 MBD5Q9P267 1494 aa35.92■■■■□ 3.34
TMEM260-214ENST00000556975 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.92■■■■□ 3.34
TMEM260-214ENST00000556975 ATP7AQ04656 1500 aa35.91■■■■□ 3.34
TMEM260-214ENST00000556975 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
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TMEM260-214ENST00000556975 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.82■■■■□ 3.32
TMEM260-214ENST00000556975 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
TMEM260-214ENST00000556975 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.81■■■■□ 3.32
TMEM260-214ENST00000556975 A2MP01023 1474 aa35.8■■■■□ 3.32
TMEM260-214ENST00000556975 PLXNC1O60486 1568 aa35.78■■■■□ 3.32
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TMEM260-214ENST00000556975 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.75■■■■□ 3.31
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TMEM260-214ENST00000556975 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.73■■■■□ 3.31
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TMEM260-214ENST00000556975 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.72■■■■□ 3.31
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TMEM260-214ENST00000556975 C3P01024 1663 aa35.7■■■■□ 3.31
TMEM260-214ENST00000556975 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.69■■■■□ 3.3
TMEM260-214ENST00000556975 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.68■■■■□ 3.3
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TMEM260-214ENST00000556975 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
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TMEM260-214ENST00000556975 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.64■■■■□ 3.3
TMEM260-214ENST00000556975 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.64■■■■□ 3.3
TMEM260-214ENST00000556975 MROH2AA6NES4 1674 aa35.62■■■■□ 3.29
TMEM260-214ENST00000556975 TSPY4P0CV99 314 aa35.61■■■■□ 3.29
TMEM260-214ENST00000556975 TSPY10P0CW01 314 aa35.61■■■■□ 3.29
TMEM260-214ENST00000556975 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.6■■■■□ 3.29
TMEM260-214ENST00000556975 GGT6Q6P531 493 aa35.6■■■■□ 3.29
TMEM260-214ENST00000556975 ZMYM3Q14202 1370 aa35.6■■■■□ 3.29
TMEM260-214ENST00000556975 NPATQ14207 1427 aa35.54■■■■□ 3.28
TMEM260-214ENST00000556975 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
TMEM260-214ENST00000556975 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.5■■■■□ 3.27
TMEM260-214ENST00000556975 KIF3BO15066 747 aa35.49■■■■□ 3.27
TMEM260-214ENST00000556975 PTPRKQ15262 1439 aa35.41■■■■□ 3.26
TMEM260-214ENST00000556975 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.4■■■■□ 3.26
TMEM260-214ENST00000556975 STRCQ7RTU9 1775 aa35.39■■■■□ 3.26
TMEM260-214ENST00000556975 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.38■■■■□ 3.25
TMEM260-214ENST00000556975 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.38■■■■□ 3.25
TMEM260-214ENST00000556975 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.36■■■■□ 3.25
TMEM260-214ENST00000556975 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
TMEM260-214ENST00000556975 ABCC5O15440 1437 aa35.33■■■■□ 3.25
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