RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.01■■■□□ 2.07
TMX1-202ENST00000555574 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.99■■■□□ 2.07
TMX1-202ENST00000555574 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.98■■■□□ 2.07
TMX1-202ENST00000555574 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.96■■■□□ 2.07
TMX1-202ENST00000555574 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
TMX1-202ENST00000555574 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
TMX1-202ENST00000555574 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TMX1-202ENST00000555574 CLIP1P30622 1438 aa27.91■■■□□ 2.06
TMX1-202ENST00000555574 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.89■■■□□ 2.06
TMX1-202ENST00000555574 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.89■■■□□ 2.06
TMX1-202ENST00000555574 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.87■■■□□ 2.05
TMX1-202ENST00000555574 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.87■■■□□ 2.05
TMX1-202ENST00000555574 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.84■■■□□ 2.05
TMX1-202ENST00000555574 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.84■■■□□ 2.05
TMX1-202ENST00000555574 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.84■■■□□ 2.05
TMX1-202ENST00000555574 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.83■■■□□ 2.05
TMX1-202ENST00000555574 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.82■■■□□ 2.04
TMX1-202ENST00000555574 ATP10AO60312 1499 aa27.82■■■□□ 2.04
TMX1-202ENST00000555574 KDM5CP41229 1560 aa27.82■■■□□ 2.04
TMX1-202ENST00000555574 PREX2Q70Z35 1606 aa27.81■■■□□ 2.04
TMX1-202ENST00000555574 MLECQ14165 292 aa27.8■■■□□ 2.04
TMX1-202ENST00000555574 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.79■■■□□ 2.04
TMX1-202ENST00000555574 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.76■■■□□ 2.04
TMX1-202ENST00000555574 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.76■■■□□ 2.03
TMX1-202ENST00000555574 AFAP1Q8N556 730 aa27.74■■■□□ 2.03
TMX1-202ENST00000555574 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.74■■■□□ 2.03
TMX1-202ENST00000555574 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.73■■■□□ 2.03
TMX1-202ENST00000555574 ABCC1P33527 1531 aa27.73■■■□□ 2.03
TMX1-202ENST00000555574 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.72■■■□□ 2.03
TMX1-202ENST00000555574 ABCA6Q8N139 1617 aa27.7■■■□□ 2.03
TMX1-202ENST00000555574 HSPA2P54652 639 aa27.67■■■□□ 2.02
TMX1-202ENST00000555574 REREQ9P2R6 1566 aa27.66■■■□□ 2.02
TMX1-202ENST00000555574 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.66■■■□□ 2.02
TMX1-202ENST00000555574 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.66■■■□□ 2.02
TMX1-202ENST00000555574 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.65■■■□□ 2.02
TMX1-202ENST00000555574 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.62■■■□□ 2.01
TMX1-202ENST00000555574 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.6■■■□□ 2.01
TMX1-202ENST00000555574 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.6■■■□□ 2.01
TMX1-202ENST00000555574 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
TMX1-202ENST00000555574 FBXO41Q8TF61 875 aa27.57■■■□□ 2
TMX1-202ENST00000555574 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.56■■■□□ 2
TMX1-202ENST00000555574 AGLP35573 1532 aa27.55■■■□□ 2
TMX1-202ENST00000555574 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
TMX1-202ENST00000555574 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TMX1-202ENST00000555574 C3P01024 1663 aa27.52■■■□□ 2
TMX1-202ENST00000555574 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.47■■□□□ 1.99
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TMX1-202ENST00000555574 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.46■■□□□ 1.99
TMX1-202ENST00000555574 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.45■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 ATP7AQ04656 1500 aa27.43■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.43■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 STRCQ7RTU9 1775 aa27.43■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 TIAM1Q13009 1591 aa27.42■■□□□ 1.98
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TMX1-202ENST00000555574 CEP162Q5TB80 1403 aa27.41■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.41■■□□□ 1.98
TMX1-202ENST00000555574 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.41■■□□□ 1.98
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TMX1-202ENST00000555574 PLXNC1O60486 1568 aa27.37■■□□□ 1.97
TMX1-202ENST00000555574 MROH2AA6NES4 1674 aa27.36■■□□□ 1.97
TMX1-202ENST00000555574 A2MP01023 1474 aa27.32■■□□□ 1.96
TMX1-202ENST00000555574 CERKQ8TCT0 537 aa27.31■■□□□ 1.96
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TMX1-202ENST00000555574 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.3■■□□□ 1.96
TMX1-202ENST00000555574 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TMX1-202ENST00000555574 MBD5Q9P267 1494 aa27.26■■□□□ 1.95
TMX1-202ENST00000555574 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.26■■□□□ 1.95
TMX1-202ENST00000555574 NPATQ14207 1427 aa27.25■■□□□ 1.95
TMX1-202ENST00000555574 ZMYM3Q14202 1370 aa27.23■■□□□ 1.95
TMX1-202ENST00000555574 NCOA2Q15596 1464 aa27.22■■□□□ 1.95
TMX1-202ENST00000555574 PTPRTO14522 1441 aa27.2■■□□□ 1.94
TMX1-202ENST00000555574 NCOA1Q15788 1441 aa27.2■■□□□ 1.94
TMX1-202ENST00000555574 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.19■■□□□ 1.94
TMX1-202ENST00000555574 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.19■■□□□ 1.94
TMX1-202ENST00000555574 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.18■■□□□ 1.94
TMX1-202ENST00000555574 GGT6Q6P531 493 aa27.18■■□□□ 1.94
TMX1-202ENST00000555574 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.18■■□□□ 1.94
TMX1-202ENST00000555574 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TMX1-202ENST00000555574 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.16■■□□□ 1.94
TMX1-202ENST00000555574 PTPRKQ15262 1439 aa27.14■■□□□ 1.93
TMX1-202ENST00000555574 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.12■■□□□ 1.93
TMX1-202ENST00000555574 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TMX1-202ENST00000555574 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
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TMX1-202ENST00000555574 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.08■■□□□ 1.93
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TMX1-202ENST00000555574 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.08■■□□□ 1.93
TMX1-202ENST00000555574 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.07■■□□□ 1.92
TMX1-202ENST00000555574 PLA2R1Q13018 1463 aa27.03■■□□□ 1.92
TMX1-202ENST00000555574 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.03■■□□□ 1.92
TMX1-202ENST00000555574 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.02■■□□□ 1.92
TMX1-202ENST00000555574 KIF3BO15066 747 aa27.01■■□□□ 1.91
TMX1-202ENST00000555574 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.01■■□□□ 1.91
TMX1-202ENST00000555574 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27■■□□□ 1.91
TMX1-202ENST00000555574 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
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