RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.92■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 PLCH2O75038 1416 aa27.91■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.91■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.89■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
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LRP1-204ENST00000553277 GLI2P10070 1586 aa27.83■■■□□ 2.05
LRP1-204ENST00000553277 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
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LRP1-204ENST00000553277 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.77■■■□□ 2.04
LRP1-204ENST00000553277 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
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LRP1-204ENST00000553277 PTPRKQ15262 1439 aa27.77■■■□□ 2.04
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LRP1-204ENST00000553277 MBD5Q9P267 1494 aa27.75■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 DIP2BQ9P265 1576 aa27.74■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 ABCC5O15440 1437 aa27.74■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 CD109Q6YHK3 1445 aa27.74■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 DAPK1P53355 1430 aa27.73■■■□□ 2.03
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LRP1-204ENST00000553277 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.71■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 ITGAEP38570 1179 aa27.7■■■□□ 2.02
LRP1-204ENST00000553277 FANCAO15360 1455 aa27.69■■■□□ 2.02
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LRP1-204ENST00000553277 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.66■■■□□ 2.02
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LRP1-204ENST00000553277 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.64■■■□□ 2.02
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LRP1-204ENST00000553277 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.63■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 HFM1A2PYH4 1435 aa27.63■■■□□ 2.01
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LRP1-204ENST00000553277 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.62■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.62■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
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LRP1-204ENST00000553277 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.59■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.59■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 NAIPQ13075 1403 aa27.57■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.56■■■□□ 2
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LRP1-204ENST00000553277 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.54■■■□□ 2
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LRP1-204ENST00000553277 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.53■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.53■■■□□ 2
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LRP1-204ENST00000553277 AFAP1Q8N556 730 aa27.43■■□□□ 1.98
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LRP1-204ENST00000553277 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.34■■□□□ 1.97
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LRP1-204ENST00000553277 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.27■■□□□ 1.96
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LRP1-204ENST00000553277 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
LRP1-204ENST00000553277 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
LRP1-204ENST00000553277 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.16■■□□□ 1.94
LRP1-204ENST00000553277 ABCA6Q8N139 1617 aa27.14■■□□□ 1.94
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LRP1-204ENST00000553277 UNC13BO14795 1591 aa27.13■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 A2MP01023 1474 aa27.13■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.13■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 TRIM52Q96A61 297 aa27.11■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 PZPP20742 1482 aa27.1■■□□□ 1.93
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