RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553123.1

MARS-231, Transcript of methionyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene MARS, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MARS-231	ENST00000553123	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MARS-231	ENST00000553123	HECW1	Q76N89	1606 aa		12.52	□□□□□ -0.4
MARS-231	ENST00000553123	DIP2B	Q9P265	1576 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MARS-231	ENST00000553123	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MARS-231	ENST00000553123	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
MARS-231	ENST00000553123	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MARS-231	ENST00000553123	GLI2	P10070	1586 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MARS-231	ENST00000553123	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
MARS-231	ENST00000553123	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MARS-231	ENST00000553123	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
MARS-231	ENST00000553123	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		12.46	□□□□□ -0.42
MARS-231	ENST00000553123	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MARS-231	ENST00000553123	CD109	Q6YHK3	1445 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MARS-231	ENST00000553123	ABCB7	O75027	752 aa		12.43	□□□□□ -0.42
MARS-231	ENST00000553123	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
MARS-231	ENST00000553123	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MARS-231	ENST00000553123	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	12.41	□□□□□ -0.42	3e-6	■□□□□ 8.9
MARS-231	ENST00000553123	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MARS-231	ENST00000553123	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MARS-231	ENST00000553123	DSG3	P32926	999 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	KIF14	Q15058	1648 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	TIAM1	Q13009	1591 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	MAP3K1	Q13233	1512 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		12.37	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	PLCH2	O75038	1416 aa		12.37	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		12.35	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	TSPOAP1	O95153	1857 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MARS-231	ENST00000553123	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	FANCA	O15360	1455 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	NCOA2	Q15596	1464 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		12.31	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	NEO1	Q92859	1461 aa		12.31	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	AKNA	Q7Z591	1439 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	RAPGEF3	O95398	923 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	FBXO3	Q9UK99	471 aa		12.29	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		12.28	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
MARS-231	ENST00000553123	PROM2	Q8N271	834 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	ADGRL1	O94910	1474 aa		12.25	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		12.25	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	KDM6B	O15054	1643 aa		12.25	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	PREX2	Q70Z35	1606 aa		12.25	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	12.24	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	AFAP1	Q8N556	730 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		12.23	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		12.22	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		12.21	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		12.21	□□□□□ -0.45
MARS-231	ENST00000553123	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		12.21	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		12.21	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	ABCC1	P33527	1531 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	MBD5	Q9P267	1494 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	MIA2	Q96PC5	1412 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		12.18	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		12.17	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		12.16	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	RICTOR	Q6R327	1708 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	SPDYE6	P0CI01	402 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MARS-231	ENST00000553123	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		12.14	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	KDM5C	P41229	1560 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	ABCC5	O15440	1437 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MARS-231	ENST00000553123	TSPY4	P0CV99	314 aa		12.1	□□□□□ -0.47

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