RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551336.1

RPLP0-222, Transcript of ribosomal protein lateral stalk subunit P0, human

TSL 3

Gene RPLP0, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPLP0-222	ENST00000551336	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.26	■■■□□ 2.76
RPLP0-222	ENST00000551336	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPLP0-222	ENST00000551336	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPLP0-222	ENST00000551336	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RPLP0-222	ENST00000551336	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPLP0-222	ENST00000551336	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RPLP0-222	ENST00000551336	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RPLP0-222	ENST00000551336	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPLP0-222	ENST00000551336	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPLP0-222	ENST00000551336	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPLP0-222	ENST00000551336	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPLP0-222	ENST00000551336	ATP10A	O60312	1499 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RPLP0-222	ENST00000551336	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
RPLP0-222	ENST00000551336	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPLP0-222	ENST00000551336	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPLP0-222	ENST00000551336	KDM5C	P41229	1560 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPLP0-222	ENST00000551336	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32	■■■□□ 2.71
RPLP0-222	ENST00000551336	MLEC	Q14165	292 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPLP0-222	ENST00000551336	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPLP0-222	ENST00000551336	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPLP0-222	ENST00000551336	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.95	■■■□□ 2.7
RPLP0-222	ENST00000551336	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RPLP0-222	ENST00000551336	ABCC1	P33527	1531 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RPLP0-222	ENST00000551336	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
RPLP0-222	ENST00000551336	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPLP0-222	ENST00000551336	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPLP0-222	ENST00000551336	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPLP0-222	ENST00000551336	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RPLP0-222	ENST00000551336	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RPLP0-222	ENST00000551336	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RPLP0-222	ENST00000551336	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RPLP0-222	ENST00000551336	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RPLP0-222	ENST00000551336	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RPLP0-222	ENST00000551336	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.82	■■■□□ 2.69
RPLP0-222	ENST00000551336	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RPLP0-222	ENST00000551336	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RPLP0-222	ENST00000551336	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
RPLP0-222	ENST00000551336	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
RPLP0-222	ENST00000551336	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RPLP0-222	ENST00000551336	AGL	P35573	1532 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RPLP0-222	ENST00000551336	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
RPLP0-222	ENST00000551336	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
RPLP0-222	ENST00000551336	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPLP0-222	ENST00000551336	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RPLP0-222	ENST00000551336	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RPLP0-222	ENST00000551336	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RPLP0-222	ENST00000551336	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPLP0-222	ENST00000551336	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RPLP0-222	ENST00000551336	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.66
RPLP0-222	ENST00000551336	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.7	■■■□□ 2.66
RPLP0-222	ENST00000551336	HSPA2	P54652	639 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RPLP0-222	ENST00000551336	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPLP0-222	ENST00000551336	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.64	■■■□□ 2.66	2e-7	■■□□□ 14.2
RPLP0-222	ENST00000551336	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RPLP0-222	ENST00000551336	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RPLP0-222	ENST00000551336	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
RPLP0-222	ENST00000551336	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPLP0-222	ENST00000551336	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RPLP0-222	ENST00000551336	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
RPLP0-222	ENST00000551336	C3	P01024	1663 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RPLP0-222	ENST00000551336	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
RPLP0-222	ENST00000551336	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RPLP0-222	ENST00000551336	A2M	P01023	1474 aa		31.52	■■■□□ 2.64
RPLP0-222	ENST00000551336	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
RPLP0-222	ENST00000551336	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RPLP0-222	ENST00000551336	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.48	■■■□□ 2.63
RPLP0-222	ENST00000551336	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RPLP0-222	ENST00000551336	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RPLP0-222	ENST00000551336	NPAT	Q14207	1427 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RPLP0-222	ENST00000551336	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RPLP0-222	ENST00000551336	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RPLP0-222	ENST00000551336	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RPLP0-222	ENST00000551336	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RPLP0-222	ENST00000551336	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
RPLP0-222	ENST00000551336	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.42	■■■□□ 2.62
RPLP0-222	ENST00000551336	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPLP0-222	ENST00000551336	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RPLP0-222	ENST00000551336	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RPLP0-222	ENST00000551336	GGT6	Q6P531	493 aa		31.36	■■■□□ 2.61
RPLP0-222	ENST00000551336	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RPLP0-222	ENST00000551336	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
RPLP0-222	ENST00000551336	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
RPLP0-222	ENST00000551336	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.33	■■■□□ 2.61
RPLP0-222	ENST00000551336	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.33	■■■□□ 2.61
RPLP0-222	ENST00000551336	PTPRT	O14522	1441 aa		31.32	■■■□□ 2.61
RPLP0-222	ENST00000551336	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.32	■■■□□ 2.6
RPLP0-222	ENST00000551336	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RPLP0-222	ENST00000551336	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RPLP0-222	ENST00000551336	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RPLP0-222	ENST00000551336	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RPLP0-222	ENST00000551336	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RPLP0-222	ENST00000551336	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.26	■■■□□ 2.6
RPLP0-222	ENST00000551336	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RPLP0-222	ENST00000551336	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPLP0-222	ENST00000551336	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPLP0-222	ENST00000551336	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
RPLP0-222	ENST00000551336	KIF3B	O15066	747 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPLP0-222	ENST00000551336	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.18	■■■□□ 2.58
RPLP0-222	ENST00000551336	APLP2	Q06481	763 aa		31.18	■■■□□ 2.58
RPLP0-222	ENST00000551336	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.18	■■■□□ 2.58

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