RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.52■■■□□ 2.16
CS-219ENST00000550655 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.51■■■□□ 2.15
CS-219ENST00000550655 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.5■■■□□ 2.15
CS-219ENST00000550655 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.46■■■□□ 2.15
CS-219ENST00000550655 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.44■■■□□ 2.14
CS-219ENST00000550655 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.43■■■□□ 2.14
CS-219ENST00000550655 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.43■■■□□ 2.14
CS-219ENST00000550655 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.42■■■□□ 2.14
CS-219ENST00000550655 ABCC1P33527 1531 aa28.4■■■□□ 2.14
CS-219ENST00000550655 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.4■■■□□ 2.14
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CS-219ENST00000550655 KDM5CP41229 1560 aa28.37■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 TIAM1Q13009 1591 aa28.37■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.37■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.37■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.35■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.34■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.34■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.33■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.33■■■□□ 2.13
CS-219ENST00000550655 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.32■■■□□ 2.12
CS-219ENST00000550655 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.3■■■□□ 2.12
CS-219ENST00000550655 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
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CS-219ENST00000550655 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.25■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.25■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 MAP3K1Q13233 1512 aa28.23■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.23■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 ABCA6Q8N139 1617 aa28.22■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 MADDQ8WXG6 1647 aa28.22■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 AFAP1Q8N556 730 aa28.21■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 NCOA2Q15596 1464 aa28.21■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.21■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.2■■■□□ 2.11
CS-219ENST00000550655 ATP10AO60312 1499 aa28.2■■■□□ 2.1
CS-219ENST00000550655 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.2■■■□□ 2.1
CS-219ENST00000550655 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.18■■■□□ 2.1
CS-219ENST00000550655 REREQ9P2R6 1566 aa28.16■■■□□ 2.1
CS-219ENST00000550655 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.16■■■□□ 2.1
CS-219ENST00000550655 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CS-219ENST00000550655 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CS-219ENST00000550655 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.15■■■□□ 2.1
CS-219ENST00000550655 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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CS-219ENST00000550655 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CS-219ENST00000550655 PTPRMP28827 1452 aa28.11■■■□□ 2.09
CS-219ENST00000550655 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.11■■■□□ 2.09
CS-219ENST00000550655 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
CS-219ENST00000550655 ATP7AQ04656 1500 aa28.07■■■□□ 2.08
CS-219ENST00000550655 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CS-219ENST00000550655 MBD5Q9P267 1494 aa28.06■■■□□ 2.08
CS-219ENST00000550655 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.05■■■□□ 2.08
CS-219ENST00000550655 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CS-219ENST00000550655 AGLP35573 1532 aa28.02■■■□□ 2.08
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CS-219ENST00000550655 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.95■■■□□ 2.06
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CS-219ENST00000550655 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.9■■■□□ 2.06
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CS-219ENST00000550655 A2MP01023 1474 aa27.89■■■□□ 2.05
CS-219ENST00000550655 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.84■■■□□ 2.05
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CS-219ENST00000550655 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.83■■■□□ 2.05
CS-219ENST00000550655 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.81■■■□□ 2.04
CS-219ENST00000550655 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.81■■■□□ 2.04
CS-219ENST00000550655 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.8■■■□□ 2.04
CS-219ENST00000550655 MROH2AA6NES4 1674 aa27.8■■■□□ 2.04
CS-219ENST00000550655 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.77■■■□□ 2.04
CS-219ENST00000550655 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.76■■■□□ 2.04
CS-219ENST00000550655 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
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CS-219ENST00000550655 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.74■■■□□ 2.03
CS-219ENST00000550655 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.74■■■□□ 2.03
CS-219ENST00000550655 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
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CS-219ENST00000550655 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
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CS-219ENST00000550655 TSPY4P0CV99 314 aa27.68■■■□□ 2.02
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CS-219ENST00000550655 ABCC5O15440 1437 aa27.66■■■□□ 2.02
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CS-219ENST00000550655 DAPK1P53355 1430 aa27.64■■■□□ 2.02
CS-219ENST00000550655 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
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CS-219ENST00000550655 ZMYM3Q14202 1370 aa27.59■■■□□ 2.01
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CS-219ENST00000550655 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.58■■■□□ 2.01
CS-219ENST00000550655 NPATQ14207 1427 aa27.57■■■□□ 2
CS-219ENST00000550655 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.56■■■□□ 2
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