RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548421.2

BRF1-213, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BRF1, Length 1,452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-213ENST00000548421 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
BRF1-213ENST00000548421 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.87■■■■■ 4.61
BRF1-213ENST00000548421 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.85■■■■■ 4.61
BRF1-213ENST00000548421 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.84■■■■■ 4.61
BRF1-213ENST00000548421 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.6
BRF1-213ENST00000548421 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.81■■■■■ 4.6
BRF1-213ENST00000548421 CD109Q6YHK3 1445 aa43.81■■■■■ 4.6
BRF1-213ENST00000548421 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.79■■■■■ 4.6
BRF1-213ENST00000548421 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.77■■■■■ 4.6
BRF1-213ENST00000548421 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.74■■■■■ 4.59
BRF1-213ENST00000548421 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.74■■■■■ 4.59
BRF1-213ENST00000548421 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
BRF1-213ENST00000548421 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.71■■■■■ 4.59
BRF1-213ENST00000548421 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
BRF1-213ENST00000548421 FANCAO15360 1455 aa43.69■■■■■ 4.58
BRF1-213ENST00000548421 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.69■■■■■ 4.58
BRF1-213ENST00000548421 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.64■■■■■ 4.58
BRF1-213ENST00000548421 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
BRF1-213ENST00000548421 ABCC1P33527 1531 aa43.59■■■■■ 4.57
BRF1-213ENST00000548421 TSPOAP1O95153 1857 aa43.59■■■■■ 4.57
BRF1-213ENST00000548421 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.57■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.56■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.55■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 ITGAEP38570 1179 aa43.55■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 NEO1Q92859 1461 aa43.54■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 DAPK1P53355 1430 aa43.52■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 MBD5Q9P267 1494 aa43.52■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 AKNAQ7Z591 1439 aa43.51■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.51■■■■■ 4.56
BRF1-213ENST00000548421 ADGRL1O94910 1474 aa43.49■■■■■ 4.55
BRF1-213ENST00000548421 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.49■■■■■ 4.55
BRF1-213ENST00000548421 ABCC5O15440 1437 aa43.49■■■■■ 4.55
BRF1-213ENST00000548421 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.47■■■■■ 4.553e-6■■■■□ 22.9
BRF1-213ENST00000548421 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.47■■■■■ 4.55
BRF1-213ENST00000548421 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.45■■■■■ 4.55
BRF1-213ENST00000548421 PTPRKQ15262 1439 aa43.44■■■■■ 4.55
BRF1-213ENST00000548421 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.43■■■■■ 4.54
BRF1-213ENST00000548421 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
BRF1-213ENST00000548421 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.39■■■■■ 4.54
BRF1-213ENST00000548421 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.39■■■■■ 4.54
BRF1-213ENST00000548421 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.34■■■■■ 4.53
BRF1-213ENST00000548421 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.33■■■■■ 4.53
BRF1-213ENST00000548421 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.3■■■■■ 4.52
BRF1-213ENST00000548421 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.29■■■■■ 4.52
BRF1-213ENST00000548421 TSPY4P0CV99 314 aa43.29■■■■■ 4.52
BRF1-213ENST00000548421 TSPY10P0CW01 314 aa43.29■■■■■ 4.52
BRF1-213ENST00000548421 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.27■■■■■ 4.52
BRF1-213ENST00000548421 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.26■■■■■ 4.52
BRF1-213ENST00000548421 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.26■■■■■ 4.52
BRF1-213ENST00000548421 ROCK1Q13464 1354 aa43.25■■■■■ 4.51
BRF1-213ENST00000548421 ADGRL2O95490 1459 aa43.25■■■■■ 4.51
BRF1-213ENST00000548421 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
BRF1-213ENST00000548421 RICTORQ6R327 1708 aa43.21■■■■■ 4.51
BRF1-213ENST00000548421 AFAP1Q8N556 730 aa43.2■■■■■ 4.51
BRF1-213ENST00000548421 KDM5CP41229 1560 aa43.19■■■■■ 4.5
BRF1-213ENST00000548421 HFM1A2PYH4 1435 aa43.18■■■■■ 4.5
BRF1-213ENST00000548421 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.17■■■■■ 4.5
BRF1-213ENST00000548421 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.16■■■■■ 4.5
BRF1-213ENST00000548421 NCOA1Q15788 1441 aa43.16■■■■■ 4.5
BRF1-213ENST00000548421 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
BRF1-213ENST00000548421 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.14■■■■■ 4.5
BRF1-213ENST00000548421 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
BRF1-213ENST00000548421 PLXNC1O60486 1568 aa43.13■■■■■ 4.49
BRF1-213ENST00000548421 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.13■■■■■ 4.49
BRF1-213ENST00000548421 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.11■■■■■ 4.49
BRF1-213ENST00000548421 NAIPQ13075 1403 aa43.11■■■■■ 4.49
BRF1-213ENST00000548421 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.11■■■■■ 4.49
BRF1-213ENST00000548421 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.1■■■■■ 4.49
BRF1-213ENST00000548421 ATP7AQ04656 1500 aa43.1■■■■■ 4.49
BRF1-213ENST00000548421 RAPGEF3O95398 923 aa43.08■■■■■ 4.49
BRF1-213ENST00000548421 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.08■■■■■ 4.49
BRF1-213ENST00000548421 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.05■■■■■ 4.48
BRF1-213ENST00000548421 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.04■■■■■ 4.48
BRF1-213ENST00000548421 KIF15Q9NS87 1388 aa43.02■■■■■ 4.48
BRF1-213ENST00000548421 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.02■■■■■ 4.48
BRF1-213ENST00000548421 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.99■■■■■ 4.47
BRF1-213ENST00000548421 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
BRF1-213ENST00000548421 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.96■■■■■ 4.47
BRF1-213ENST00000548421 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.93■■■■■ 4.46
BRF1-213ENST00000548421 KDM6BO15054 1643 aa42.9■■■■■ 4.46
BRF1-213ENST00000548421 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.89■■■■■ 4.46
BRF1-213ENST00000548421 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.89■■■■■ 4.46
BRF1-213ENST00000548421 ABCA6Q8N139 1617 aa42.88■■■■■ 4.46
BRF1-213ENST00000548421 HRCP23327 699 aa42.87■■■■■ 4.45
BRF1-213ENST00000548421 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.83■■■■■ 4.45
BRF1-213ENST00000548421 ERBINQ96RT1 1412 aa42.82■■■■■ 4.45
BRF1-213ENST00000548421 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.78■■■■■ 4.44
BRF1-213ENST00000548421 A2MP01023 1474 aa42.75■■■■■ 4.43
BRF1-213ENST00000548421 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
BRF1-213ENST00000548421 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
BRF1-213ENST00000548421 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.73■■■■■ 4.43
BRF1-213ENST00000548421 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
BRF1-213ENST00000548421 ATP10AO60312 1499 aa42.66■■■■■ 4.42
BRF1-213ENST00000548421 UNC13BO14795 1591 aa42.64■■■■■ 4.42
BRF1-213ENST00000548421 REREQ9P2R6 1566 aa42.64■■■■■ 4.42
BRF1-213ENST00000548421 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.62■■■■■ 4.41
BRF1-213ENST00000548421 TRIM52Q96A61 297 aa42.58■■■■■ 4.41
BRF1-213ENST00000548421 DEPDC5O75140 1603 aa42.58■■■■■ 4.41
BRF1-213ENST00000548421 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.55■■■■■ 4.4
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