RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 MAP3K1Q13233 1512 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-211ENST00000548041 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-211ENST00000548041 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-211ENST00000548041 AKNAQ7Z591 1439 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-211ENST00000548041 ABCC1P33527 1531 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-211ENST00000548041 ADGRL1O94910 1474 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-211ENST00000548041 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CS-211ENST00000548041 NCOA2Q15596 1464 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-211ENST00000548041 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 RAPGEF3O95398 923 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 KDM5CP41229 1560 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-211ENST00000548041 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.6□□□□□ -0.23
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CS-211ENST00000548041 ABCA6Q8N139 1617 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.56□□□□□ -0.24
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CS-211ENST00000548041 APLP2Q06481 763 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-211ENST00000548041 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 BCORL1Q5H9F3 1711 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 AFAP1Q8N556 730 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 ATP7AQ04656 1500 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 MBD5Q9P267 1494 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 MIA2Q96PC5 1412 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 MADDQ8WXG6 1647 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 REREQ9P2R6 1566 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-211ENST00000548041 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.46□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 ATP10AO60312 1499 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 PLXNC1O60486 1568 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CS-211ENST00000548041 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 AGLP35573 1532 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 DAPK1P53355 1430 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 A2MP01023 1474 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 ABCC5O15440 1437 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 C3P01024 1663 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 MLECQ14165 292 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-211ENST00000548041 MROH2AA6NES4 1674 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 PTPRMP28827 1452 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 CEP152O94986 1710 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 TSPY4P0CV99 314 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 TSPY10P0CW01 314 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 PTPRKQ15262 1439 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 ADGRL2O95490 1459 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 DEPDC5O75140 1603 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CS-211ENST00000548041 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 KIF15Q9NS87 1388 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-211ENST00000548041 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.25□□□□□ -0.29
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