RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546907.1

TPCN1-208, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-208ENST00000546907 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.71■■□□□ 1.55
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TPCN1-208ENST00000546907 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.69■■□□□ 1.54
TPCN1-208ENST00000546907 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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TPCN1-208ENST00000546907 PTPRMP28827 1452 aa24.67■■□□□ 1.54
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TPCN1-208ENST00000546907 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.66■■□□□ 1.54
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TPCN1-208ENST00000546907 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.3■■□□□ 1.48
TPCN1-208ENST00000546907 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
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TPCN1-208ENST00000546907 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.09■■□□□ 1.45
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TPCN1-208ENST00000546907 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.94■■□□□ 1.42
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TPCN1-208ENST00000546907 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.91■■□□□ 1.42
TPCN1-208ENST00000546907 NCOA1Q15788 1441 aa23.91■■□□□ 1.42
TPCN1-208ENST00000546907 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.9■■□□□ 1.42
TPCN1-208ENST00000546907 KIF3BO15066 747 aa23.89■■□□□ 1.41
TPCN1-208ENST00000546907 TSPY4P0CV99 314 aa23.89■■□□□ 1.41
TPCN1-208ENST00000546907 TSPY10P0CW01 314 aa23.89■■□□□ 1.41
TPCN1-208ENST00000546907 PTPRTO14522 1441 aa23.89■■□□□ 1.41
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