RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CCR3-208	ENST00000545097	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CCR3-208	ENST00000545097	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CCR3-208	ENST00000545097	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CCR3-208	ENST00000545097	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CCR3-208	ENST00000545097	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CCR3-208	ENST00000545097	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CCR3-208	ENST00000545097	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	ABCC1	P33527	1531 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		13.07	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.06	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.05	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	KDM5C	P41229	1560 aa		13.04	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.03	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.03	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.02	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		13.02	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.02	□□□□□ -0.32
CCR3-208	ENST00000545097	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.02	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.02	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	NCOA2	Q15596	1464 aa		13	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	AFAP1	Q8N556	730 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		12.96	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		12.96	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	MAP3K1	Q13233	1512 aa		12.95	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		12.94	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	12.94	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	MBD5	Q9P267	1494 aa		12.93	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	ATP10A	O60312	1499 aa		12.92	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	ATP7A	Q04656	1500 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CCR3-208	ENST00000545097	RERE	Q9P2R6	1566 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	PTPRM	P28827	1452 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	PLXNC1	O60486	1568 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	MLEC	Q14165	292 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	AGL	P35573	1532 aa		12.83	□□□□□ -0.35
CCR3-208	ENST00000545097	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	C3	P01024	1663 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	A2M	P01023	1474 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	MIA2	Q96PC5	1412 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CCR3-208	ENST00000545097	ABCC5	O15440	1437 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CCR3-208	ENST00000545097	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CCR3-208	ENST00000545097	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CCR3-208	ENST00000545097	MROH2A	A6NES4	1674 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CCR3-208	ENST00000545097	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CCR3-208	ENST00000545097	APLP2	Q06481	763 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CCR3-208	ENST00000545097	DAPK1	P53355	1430 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CCR3-208	ENST00000545097	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
CCR3-208	ENST00000545097	CEP152	O94986	1710 aa		12.71	□□□□□ -0.37
CCR3-208	ENST00000545097	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	PTPRK	Q15262	1439 aa		12.71	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		12.7	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	HSPA2	P54652	639 aa		12.69	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	GGT6	Q6P531	493 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	STRC	Q7RTU9	1775 aa		12.68	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		12.66	□□□□□ -0.38
CCR3-208	ENST00000545097	DEPDC5	O75140	1603 aa		12.66	□□□□□ -0.38

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