RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544057.1

PHOX2A-202, Transcript of paired like homeobox 2A, humanhuman

TSL 3

Gene PHOX2A, Length 605 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2A-202ENST00000544057 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.23■■■■■ 4.99
PHOX2A-202ENST00000544057 ADGRL1O94910 1474 aa46.23■■■■■ 4.99
PHOX2A-202ENST00000544057 RAPGEF3O95398 923 aa46.22■■■■■ 4.99
PHOX2A-202ENST00000544057 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46.22■■■■■ 4.99
PHOX2A-202ENST00000544057 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa46.21■■■■■ 4.99
PHOX2A-202ENST00000544057 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.18■■■■■ 4.98
PHOX2A-202ENST00000544057 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
PHOX2A-202ENST00000544057 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.17■■■■■ 4.98
PHOX2A-202ENST00000544057 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP46.15■■■■■ 4.98
PHOX2A-202ENST00000544057 RICTORQ6R327 1708 aa46.11■■■■■ 4.97
PHOX2A-202ENST00000544057 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP46.1■■■■■ 4.97
PHOX2A-202ENST00000544057 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.09■■■■■ 4.97
PHOX2A-202ENST00000544057 NCOA2Q15596 1464 aa46.06■■■■■ 4.96
PHOX2A-202ENST00000544057 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.05■■■■■ 4.96
PHOX2A-202ENST00000544057 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
PHOX2A-202ENST00000544057 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.03■■■■■ 4.96
PHOX2A-202ENST00000544057 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP46.01■■■■■ 4.96
PHOX2A-202ENST00000544057 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.98■■■■■ 4.95
PHOX2A-202ENST00000544057 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa45.98■■■■■ 4.95
PHOX2A-202ENST00000544057 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.97■■■■■ 4.95
PHOX2A-202ENST00000544057 ABCC1P33527 1531 aa45.97■■■■■ 4.95
PHOX2A-202ENST00000544057 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.95■■■■■ 4.95
PHOX2A-202ENST00000544057 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.91■■■■■ 4.94
PHOX2A-202ENST00000544057 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.9■■■■■ 4.94
PHOX2A-202ENST00000544057 AFAP1Q8N556 730 aa45.88■■■■■ 4.94
PHOX2A-202ENST00000544057 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa45.85■■■■■ 4.93
PHOX2A-202ENST00000544057 KDM5CP41229 1560 aa45.84■■■■■ 4.93
PHOX2A-202ENST00000544057 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.82■■■■■ 4.93
PHOX2A-202ENST00000544057 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.82■■■■■ 4.93
PHOX2A-202ENST00000544057 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa45.81■■■■■ 4.92
PHOX2A-202ENST00000544057 SYCP2Q9BX26 1530 aa45.79■■■■■ 4.92
PHOX2A-202ENST00000544057 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP45.78■■■■■ 4.92
PHOX2A-202ENST00000544057 MYT1LQ9UL68 1186 aa45.76■■■■■ 4.92
PHOX2A-202ENST00000544057 MLH3Q9UHC1 1453 aa45.74■■■■■ 4.91
PHOX2A-202ENST00000544057 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
PHOX2A-202ENST00000544057 MYOM3Q5VTT5 1437 aa45.73■■■■■ 4.91
PHOX2A-202ENST00000544057 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.73■■■■■ 4.91
PHOX2A-202ENST00000544057 HECW2Q9P2P5 1572 aa45.72■■■■■ 4.91
PHOX2A-202ENST00000544057 MIA2Q96PC5 1412 aa45.7■■■■■ 4.91
PHOX2A-202ENST00000544057 RSPH4AQ5TD94 716 aa45.69■■■■■ 4.9
PHOX2A-202ENST00000544057 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.68■■■■■ 4.9
PHOX2A-202ENST00000544057 ATP10AO60312 1499 aa45.67■■■■■ 4.9
PHOX2A-202ENST00000544057 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa45.66■■■■■ 4.9
PHOX2A-202ENST00000544057 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
PHOX2A-202ENST00000544057 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
PHOX2A-202ENST00000544057 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.64■■■■■ 4.9
PHOX2A-202ENST00000544057 MBD5Q9P267 1494 aa45.63■■■■■ 4.9
PHOX2A-202ENST00000544057 C9orf84Q5VXU9 1444 aa45.6■■■■■ 4.89
PHOX2A-202ENST00000544057 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa45.55■■■■■ 4.88
PHOX2A-202ENST00000544057 CCDC141Q6ZP82 1450 aa45.52■■■■■ 4.88
PHOX2A-202ENST00000544057 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa45.52■■■■■ 4.88
PHOX2A-202ENST00000544057 ARHGEF5Q12774 1597 aa45.5■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 ABCA6Q8N139 1617 aa45.48■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 ATP7AQ04656 1500 aa45.48■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 REREQ9P2R6 1566 aa45.48■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa45.47■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.46■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 TSPY4P0CV99 314 aa45.45■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 TSPY10P0CW01 314 aa45.45■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.44■■■■■ 4.87
PHOX2A-202ENST00000544057 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.42■■■■■ 4.86
PHOX2A-202ENST00000544057 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.37■■■■■ 4.85
PHOX2A-202ENST00000544057 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa45.37■■■■■ 4.85
PHOX2A-202ENST00000544057 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
PHOX2A-202ENST00000544057 AGLP35573 1532 aa45.34■■■■■ 4.85
PHOX2A-202ENST00000544057 ADGBQ8N7X0 1667 aa45.29■■■■■ 4.84
PHOX2A-202ENST00000544057 MLECQ14165 292 aa45.28■■■■■ 4.84
PHOX2A-202ENST00000544057 A2MP01023 1474 aa45.28■■■■■ 4.84
PHOX2A-202ENST00000544057 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
PHOX2A-202ENST00000544057 MAST1Q9Y2H9 1570 aa45.24■■■■■ 4.83
PHOX2A-202ENST00000544057 MADDQ8WXG6 1647 aa45.21■■■■■ 4.83
PHOX2A-202ENST00000544057 PLXNC1O60486 1568 aa45.19■■■■■ 4.82
PHOX2A-202ENST00000544057 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
PHOX2A-202ENST00000544057 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
PHOX2A-202ENST00000544057 ABCC5O15440 1437 aa45.18■■■■■ 4.82
PHOX2A-202ENST00000544057 SHANK2Q9UPX8 1470 aa45.17■■■■■ 4.82
PHOX2A-202ENST00000544057 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
PHOX2A-202ENST00000544057 DAPK1P53355 1430 aa45.15■■■■■ 4.82
PHOX2A-202ENST00000544057 PTPRMP28827 1452 aa45.14■■■■■ 4.82
PHOX2A-202ENST00000544057 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa45.12■■■■■ 4.81
PHOX2A-202ENST00000544057 CROCC2H7BZ55 1655 aa45.11■■■■■ 4.81
PHOX2A-202ENST00000544057 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
PHOX2A-202ENST00000544057 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
PHOX2A-202ENST00000544057 PPP6R1Q9UPN7 881 aa45.02■■■■■ 4.8
PHOX2A-202ENST00000544057 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP45.02■■■■■ 4.8
PHOX2A-202ENST00000544057 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.98■■■■■ 4.79
PHOX2A-202ENST00000544057 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.97■■■■■ 4.79
PHOX2A-202ENST00000544057 KIF3BO15066 747 aa44.97■■■■■ 4.79
PHOX2A-202ENST00000544057 GGT6Q6P531 493 aa44.97■■■■■ 4.79
PHOX2A-202ENST00000544057 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.95■■■■■ 4.79
PHOX2A-202ENST00000544057 KIF15Q9NS87 1388 aa44.94■■■■■ 4.78
PHOX2A-202ENST00000544057 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.93■■■■■ 4.78
PHOX2A-202ENST00000544057 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.91■■■■■ 4.78
PHOX2A-202ENST00000544057 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
PHOX2A-202ENST00000544057 NCOA1Q15788 1441 aa44.87■■■■■ 4.77
PHOX2A-202ENST00000544057 ADGRL2O95490 1459 aa44.86■■■■■ 4.77
PHOX2A-202ENST00000544057 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
PHOX2A-202ENST00000544057 ERBINQ96RT1 1412 aa44.83■■■■■ 4.77
PHOX2A-202ENST00000544057 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.82■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms