RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.64■■■□□ 2.5
LTBR-211ENST00000543190 CLIP1P30622 1438 aa30.64■■■□□ 2.49
LTBR-211ENST00000543190 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.63■■■□□ 2.49
LTBR-211ENST00000543190 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.61■■■□□ 2.49
LTBR-211ENST00000543190 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.61■■■□□ 2.49
LTBR-211ENST00000543190 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
LTBR-211ENST00000543190 KDM5CP41229 1560 aa30.58■■■□□ 2.49
LTBR-211ENST00000543190 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.58■■■□□ 2.49
LTBR-211ENST00000543190 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.57■■■□□ 2.48
LTBR-211ENST00000543190 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.57■■■□□ 2.48
LTBR-211ENST00000543190 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LTBR-211ENST00000543190 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.56■■■□□ 2.48
LTBR-211ENST00000543190 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
LTBR-211ENST00000543190 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
LTBR-211ENST00000543190 PREX2Q70Z35 1606 aa30.54■■■□□ 2.48
LTBR-211ENST00000543190 ATP10AO60312 1499 aa30.53■■■□□ 2.48
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.52■■■□□ 2.48
LTBR-211ENST00000543190 REREQ9P2R6 1566 aa30.49■■■□□ 2.47
LTBR-211ENST00000543190 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.48■■■□□ 2.47
LTBR-211ENST00000543190 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.48■■■□□ 2.47
LTBR-211ENST00000543190 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.47■■■□□ 2.47
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.47■■■□□ 2.47
LTBR-211ENST00000543190 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.45■■■□□ 2.47
LTBR-211ENST00000543190 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.44■■■□□ 2.46
LTBR-211ENST00000543190 ABCC1P33527 1531 aa30.42■■■□□ 2.46
LTBR-211ENST00000543190 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
LTBR-211ENST00000543190 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.39■■■□□ 2.46
LTBR-211ENST00000543190 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.38■■■□□ 2.45
LTBR-211ENST00000543190 AFAP1Q8N556 730 aa30.35■■■□□ 2.45
LTBR-211ENST00000543190 AGLP35573 1532 aa30.34■■■□□ 2.45
LTBR-211ENST00000543190 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
LTBR-211ENST00000543190 ABCA6Q8N139 1617 aa30.33■■■□□ 2.45
LTBR-211ENST00000543190 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.31■■■□□ 2.44
LTBR-211ENST00000543190 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.3■■■□□ 2.44
LTBR-211ENST00000543190 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
LTBR-211ENST00000543190 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.26■■■□□ 2.43
LTBR-211ENST00000543190 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.25■■■□□ 2.43
LTBR-211ENST00000543190 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.23■■■□□ 2.43
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.2■■■□□ 2.43
LTBR-211ENST00000543190 MLECQ14165 292 aa30.2■■■□□ 2.43
LTBR-211ENST00000543190 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.16■■■□□ 2.42
LTBR-211ENST00000543190 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.13■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 C3P01024 1663 aa30.13■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 FBXO41Q8TF61 875 aa30.12■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.12■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 CEP162Q5TB80 1403 aa30.11■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.11■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.1■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 MROH2AA6NES4 1674 aa30.09■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 HSPA2P54652 639 aa30.09■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 PLXNC1O60486 1568 aa30.08■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 TIAM1Q13009 1591 aa30.08■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 ATP7AQ04656 1500 aa30.08■■■□□ 2.41
LTBR-211ENST00000543190 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
LTBR-211ENST00000543190 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.07■■■□□ 2.4
LTBR-211ENST00000543190 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
LTBR-211ENST00000543190 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
LTBR-211ENST00000543190 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.03■■■□□ 2.4
LTBR-211ENST00000543190 STRCQ7RTU9 1775 aa30.03■■■□□ 2.4
LTBR-211ENST00000543190 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.39
LTBR-211ENST00000543190 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
LTBR-211ENST00000543190 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.01■■■□□ 2.39
LTBR-211ENST00000543190 MBD5Q9P267 1494 aa30■■■□□ 2.39
LTBR-211ENST00000543190 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.97■■■□□ 2.39
LTBR-211ENST00000543190 NPATQ14207 1427 aa29.97■■■□□ 2.39
LTBR-211ENST00000543190 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
LTBR-211ENST00000543190 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.97■■■□□ 2.39
LTBR-211ENST00000543190 A2MP01023 1474 aa29.96■■■□□ 2.39
LTBR-211ENST00000543190 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
LTBR-211ENST00000543190 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.93■■■□□ 2.38
LTBR-211ENST00000543190 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.93■■■□□ 2.38
LTBR-211ENST00000543190 NCOA2Q15596 1464 aa29.89■■■□□ 2.38
LTBR-211ENST00000543190 ZMYM3Q14202 1370 aa29.87■■■□□ 2.37
LTBR-211ENST00000543190 PTPRTO14522 1441 aa29.87■■■□□ 2.37
LTBR-211ENST00000543190 MAP3K1Q13233 1512 aa29.86■■■□□ 2.37
LTBR-211ENST00000543190 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.86■■■□□ 2.37
LTBR-211ENST00000543190 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
LTBR-211ENST00000543190 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.85■■■□□ 2.37
LTBR-211ENST00000543190 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
LTBR-211ENST00000543190 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.84■■■□□ 2.37
LTBR-211ENST00000543190 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.82■■■□□ 2.36
LTBR-211ENST00000543190 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.82■■■□□ 2.36
LTBR-211ENST00000543190 CERKQ8TCT0 537 aa29.82■■■□□ 2.36
LTBR-211ENST00000543190 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.8■■■□□ 2.36
LTBR-211ENST00000543190 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
LTBR-211ENST00000543190 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.79■■■□□ 2.36
LTBR-211ENST00000543190 NCOA1Q15788 1441 aa29.79■■■□□ 2.36
LTBR-211ENST00000543190 PTPRKQ15262 1439 aa29.77■■■□□ 2.36
LTBR-211ENST00000543190 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.74■■■□□ 2.35
LTBR-211ENST00000543190 PLA2R1Q13018 1463 aa29.71■■■□□ 2.35
LTBR-211ENST00000543190 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.7■■■□□ 2.34
LTBR-211ENST00000543190 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.69■■■□□ 2.34
LTBR-211ENST00000543190 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
LTBR-211ENST00000543190 GGT6Q6P531 493 aa29.68■■■□□ 2.34
LTBR-211ENST00000543190 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.67■■■□□ 2.34
LTBR-211ENST00000543190 MIA2Q96PC5 1412 aa29.66■■■□□ 2.34
LTBR-211ENST00000543190 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.66■■■□□ 2.34
LTBR-211ENST00000543190 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.65■■■□□ 2.34
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