RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 PREX2Q70Z35 1606 aa26.73■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.73■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.73■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 AKNAQ7Z591 1439 aa26.72■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.71■■□□□ 1.87
RABGGTA-203ENST00000543002 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RABGGTA-203ENST00000543002 ADGRL1O94910 1474 aa26.64■■□□□ 1.86
RABGGTA-203ENST00000543002 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.64■■□□□ 1.86
RABGGTA-203ENST00000543002 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.61■■□□□ 1.85
RABGGTA-203ENST00000543002 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-203ENST00000543002 RAPGEF3O95398 923 aa26.58■■□□□ 1.85
RABGGTA-203ENST00000543002 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.57■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.57■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCC1P33527 1531 aa26.56■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.54■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.54■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.54■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 RICTORQ6R327 1708 aa26.53■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 MIA2Q96PC5 1412 aa26.53■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.53■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.52■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RABGGTA-203ENST00000543002 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-203ENST00000543002 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-203ENST00000543002 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-203ENST00000543002 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.47■■□□□ 1.83
RABGGTA-203ENST00000543002 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
RABGGTA-203ENST00000543002 AFAP1Q8N556 730 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-203ENST00000543002 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-203ENST00000543002 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.44■■□□□ 1.82
RABGGTA-203ENST00000543002 MBD5Q9P267 1494 aa26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-203ENST00000543002 KDM5CP41229 1560 aa26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-203ENST00000543002 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.41■■□□□ 1.82
RABGGTA-203ENST00000543002 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.39■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.39■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.37■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.36■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.34■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-203ENST00000543002 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.29■■□□□ 1.8
RABGGTA-203ENST00000543002 TSPY4P0CV99 314 aa26.27■■□□□ 1.8
RABGGTA-203ENST00000543002 TSPY10P0CW01 314 aa26.27■■□□□ 1.8
RABGGTA-203ENST00000543002 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
RABGGTA-203ENST00000543002 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.27■■□□□ 1.8
RABGGTA-203ENST00000543002 ATP7AQ04656 1500 aa26.27■■□□□ 1.8
RABGGTA-203ENST00000543002 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
RABGGTA-203ENST00000543002 ATP10AO60312 1499 aa26.26■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.24■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCC5O15440 1437 aa26.24■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCA6Q8N139 1617 aa26.24■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 DAPK1P53355 1430 aa26.22■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.22■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.2■■□□□ 1.79
RABGGTA-203ENST00000543002 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.18■■□□□ 1.78
RABGGTA-203ENST00000543002 REREQ9P2R6 1566 aa26.18■■□□□ 1.78
RABGGTA-203ENST00000543002 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.17■■□□□ 1.78
RABGGTA-203ENST00000543002 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
RABGGTA-203ENST00000543002 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.13■■□□□ 1.77
RABGGTA-203ENST00000543002 A2MP01023 1474 aa26.13■■□□□ 1.77
RABGGTA-203ENST00000543002 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.11■■□□□ 1.77
RABGGTA-203ENST00000543002 AGLP35573 1532 aa26.11■■□□□ 1.77
RABGGTA-203ENST00000543002 PLXNC1O60486 1568 aa26.1■■□□□ 1.77
RABGGTA-203ENST00000543002 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
RABGGTA-203ENST00000543002 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.09■■□□□ 1.77
RABGGTA-203ENST00000543002 PTPRKQ15262 1439 aa26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-203ENST00000543002 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.06■■□□□ 1.76
RABGGTA-203ENST00000543002 ADGRL2O95490 1459 aa26.06■■□□□ 1.76
RABGGTA-203ENST00000543002 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.05■■□□□ 1.76
RABGGTA-203ENST00000543002 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.05■■□□□ 1.76
RABGGTA-203ENST00000543002 NCOA1Q15788 1441 aa26.04■■□□□ 1.76
RABGGTA-203ENST00000543002 ITGAEP38570 1179 aa26.04■■□□□ 1.76
RABGGTA-203ENST00000543002 KIF15Q9NS87 1388 aa26.04■■□□□ 1.76
RABGGTA-203ENST00000543002 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.03■■□□□ 1.76
RABGGTA-203ENST00000543002 MLECQ14165 292 aa26.02■■□□□ 1.76
RABGGTA-203ENST00000543002 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.01■■□□□ 1.75
RABGGTA-203ENST00000543002 ADAMTSL3P82987 1691 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-203ENST00000543002 ROCK1Q13464 1354 aa25.99■■□□□ 1.75
RABGGTA-203ENST00000543002 KIF3BO15066 747 aa25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-203ENST00000543002 ERBINQ96RT1 1412 aa25.94■■□□□ 1.74
RABGGTA-203ENST00000543002 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-203ENST00000543002 MADDQ8WXG6 1647 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-203ENST00000543002 GGT6Q6P531 493 aa25.91■■□□□ 1.74
RABGGTA-203ENST00000543002 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-203ENST00000543002 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-203ENST00000543002 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-203ENST00000543002 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
RABGGTA-203ENST00000543002 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
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