RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.49■■■■□ 3.91
STIP1-208ENST00000540501 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.49■■■■□ 3.91
STIP1-208ENST00000540501 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.49■■■■□ 3.91
STIP1-208ENST00000540501 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.47■■■■□ 3.91
STIP1-208ENST00000540501 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
STIP1-208ENST00000540501 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.46■■■■□ 3.91
STIP1-208ENST00000540501 TSPOAP1O95153 1857 aa39.45■■■■□ 3.91
STIP1-208ENST00000540501 FANCAO15360 1455 aa39.41■■■■□ 3.9
STIP1-208ENST00000540501 NEO1Q92859 1461 aa39.4■■■■□ 3.9
STIP1-208ENST00000540501 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.4■■■■□ 3.9
STIP1-208ENST00000540501 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
STIP1-208ENST00000540501 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.35■■■■□ 3.89
STIP1-208ENST00000540501 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
STIP1-208ENST00000540501 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.31■■■■□ 3.88
STIP1-208ENST00000540501 AKNAQ7Z591 1439 aa39.31■■■■□ 3.88
STIP1-208ENST00000540501 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
STIP1-208ENST00000540501 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
STIP1-208ENST00000540501 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.26■■■■□ 3.88
STIP1-208ENST00000540501 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.26■■■■□ 3.885e-8■■■■□ 25
STIP1-208ENST00000540501 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.25■■■■□ 3.87
STIP1-208ENST00000540501 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.25■■■■□ 3.87
STIP1-208ENST00000540501 ADGRL1O94910 1474 aa39.23■■■■□ 3.87
STIP1-208ENST00000540501 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.22■■■■□ 3.87
STIP1-208ENST00000540501 ABCC1P33527 1531 aa39.2■■■■□ 3.87
STIP1-208ENST00000540501 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
STIP1-208ENST00000540501 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
STIP1-208ENST00000540501 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.16■■■■□ 3.86
STIP1-208ENST00000540501 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.12■■■■□ 3.85
STIP1-208ENST00000540501 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.11■■■■□ 3.85
STIP1-208ENST00000540501 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
STIP1-208ENST00000540501 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.09■■■■□ 3.85
STIP1-208ENST00000540501 MBD5Q9P267 1494 aa39.08■■■■□ 3.85
STIP1-208ENST00000540501 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.05■■■■□ 3.84
STIP1-208ENST00000540501 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.05■■■■□ 3.84
STIP1-208ENST00000540501 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.05■■■■□ 3.84
STIP1-208ENST00000540501 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.03■■■■□ 3.84
STIP1-208ENST00000540501 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
STIP1-208ENST00000540501 TSPY4P0CV99 314 aa39■■■■□ 3.83
STIP1-208ENST00000540501 TSPY10P0CW01 314 aa39■■■■□ 3.83
STIP1-208ENST00000540501 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.98■■■■□ 3.83
STIP1-208ENST00000540501 KDM6BO15054 1643 aa38.98■■■■□ 3.83
STIP1-208ENST00000540501 DAPK1P53355 1430 aa38.97■■■■□ 3.83
STIP1-208ENST00000540501 RICTORQ6R327 1708 aa38.97■■■■□ 3.83
STIP1-208ENST00000540501 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
STIP1-208ENST00000540501 ABCC5O15440 1437 aa38.95■■■■□ 3.83
STIP1-208ENST00000540501 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.93■■■■□ 3.82
STIP1-208ENST00000540501 KDM5CP41229 1560 aa38.93■■■■□ 3.82
STIP1-208ENST00000540501 AFAP1Q8N556 730 aa38.93■■■■□ 3.82
STIP1-208ENST00000540501 RAPGEF3O95398 923 aa38.92■■■■□ 3.82
STIP1-208ENST00000540501 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
STIP1-208ENST00000540501 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.91■■■■□ 3.82
STIP1-208ENST00000540501 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.89■■■■□ 3.82
STIP1-208ENST00000540501 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
STIP1-208ENST00000540501 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.88■■■■□ 3.81
STIP1-208ENST00000540501 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.87■■■■□ 3.81
STIP1-208ENST00000540501 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.87■■■■□ 3.81
STIP1-208ENST00000540501 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.86■■■■□ 3.81
STIP1-208ENST00000540501 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.86■■■■□ 3.81
STIP1-208ENST00000540501 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.84■■■■□ 3.81
STIP1-208ENST00000540501 ITGAEP38570 1179 aa38.83■■■■□ 3.81
STIP1-208ENST00000540501 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.82■■■■□ 3.81
STIP1-208ENST00000540501 MYT1LQ9UL68 1186 aa38.81■■■■□ 3.8
STIP1-208ENST00000540501 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
STIP1-208ENST00000540501 ATP7AQ04656 1500 aa38.78■■■■□ 3.8
STIP1-208ENST00000540501 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.78■■■■□ 3.8
STIP1-208ENST00000540501 ROCK1Q13464 1354 aa38.77■■■■□ 3.8
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.77■■■■□ 3.8
STIP1-208ENST00000540501 ADGRL2O95490 1459 aa38.77■■■■□ 3.8
STIP1-208ENST00000540501 PTPRKQ15262 1439 aa38.76■■■■□ 3.8
STIP1-208ENST00000540501 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.75■■■■□ 3.79
STIP1-208ENST00000540501 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.74■■■■□ 3.79
STIP1-208ENST00000540501 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.73■■■■□ 3.79
STIP1-208ENST00000540501 PLXNC1O60486 1568 aa38.71■■■■□ 3.79
STIP1-208ENST00000540501 NCOA1Q15788 1441 aa38.7■■■■□ 3.79
STIP1-208ENST00000540501 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.62■■■■□ 3.77
STIP1-208ENST00000540501 KIF15Q9NS87 1388 aa38.6■■■■□ 3.77
STIP1-208ENST00000540501 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.59■■■■□ 3.77
STIP1-208ENST00000540501 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.59■■■■□ 3.77
STIP1-208ENST00000540501 ABCA6Q8N139 1617 aa38.59■■■■□ 3.77
STIP1-208ENST00000540501 ATP10AO60312 1499 aa38.59■■■■□ 3.77
STIP1-208ENST00000540501 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.58■■■■□ 3.77
STIP1-208ENST00000540501 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.58■■■■□ 3.77
STIP1-208ENST00000540501 HFM1A2PYH4 1435 aa38.55■■■■□ 3.76
STIP1-208ENST00000540501 REREQ9P2R6 1566 aa38.54■■■■□ 3.76
STIP1-208ENST00000540501 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
STIP1-208ENST00000540501 A2MP01023 1474 aa38.54■■■■□ 3.76
STIP1-208ENST00000540501 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.51■■■■□ 3.76
STIP1-208ENST00000540501 NAIPQ13075 1403 aa38.49■■■■□ 3.75
STIP1-208ENST00000540501 ERBINQ96RT1 1412 aa38.49■■■■□ 3.75
STIP1-208ENST00000540501 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.47■■■■□ 3.75
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.46■■■■□ 3.75
STIP1-208ENST00000540501 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
STIP1-208ENST00000540501 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.44■■■■□ 3.74
STIP1-208ENST00000540501 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
STIP1-208ENST00000540501 AGLP35573 1532 aa38.4■■■■□ 3.74
STIP1-208ENST00000540501 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.37■■■■□ 3.73
STIP1-208ENST00000540501 HRCP23327 699 aa38.36■■■■□ 3.73
STIP1-208ENST00000540501 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.33■■■■□ 3.73
STIP1-208ENST00000540501 KIF3BO15066 747 aa38.31■■■■□ 3.72
STIP1-208ENST00000540501 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms