RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539741.5

TM7SF3-208, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-208ENST00000539741 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
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TM7SF3-208ENST00000539741 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
TM7SF3-208ENST00000539741 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
TM7SF3-208ENST00000539741 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.58■■■□□ 2.49
TM7SF3-208ENST00000539741 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.57■■■□□ 2.49
TM7SF3-208ENST00000539741 RICTORQ6R327 1708 aa30.53■■■□□ 2.48
TM7SF3-208ENST00000539741 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
TM7SF3-208ENST00000539741 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
TM7SF3-208ENST00000539741 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
TM7SF3-208ENST00000539741 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.49■■■□□ 2.47
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TM7SF3-208ENST00000539741 NCOA2Q15596 1464 aa30.44■■■□□ 2.46
TM7SF3-208ENST00000539741 AKNAQ7Z591 1439 aa30.43■■■□□ 2.46
TM7SF3-208ENST00000539741 FANCAO15360 1455 aa30.43■■■□□ 2.46
TM7SF3-208ENST00000539741 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.42■■■□□ 2.46
TM7SF3-208ENST00000539741 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.41■■■□□ 2.46
TM7SF3-208ENST00000539741 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
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TM7SF3-208ENST00000539741 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.4■■■□□ 2.46
TM7SF3-208ENST00000539741 HSPA2P54652 639 aa30.39■■■□□ 2.46
TM7SF3-208ENST00000539741 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.38■■■□□ 2.45
TM7SF3-208ENST00000539741 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.37■■■□□ 2.45
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TM7SF3-208ENST00000539741 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.36■■■□□ 2.45
TM7SF3-208ENST00000539741 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.36■■■□□ 2.45
TM7SF3-208ENST00000539741 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.35■■■□□ 2.45
TM7SF3-208ENST00000539741 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.34■■■□□ 2.45
TM7SF3-208ENST00000539741 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.3■■■□□ 2.44
TM7SF3-208ENST00000539741 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.3■■■□□ 2.44
TM7SF3-208ENST00000539741 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.44
TM7SF3-208ENST00000539741 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.29■■■□□ 2.44
TM7SF3-208ENST00000539741 KIF14Q15058 1648 aa30.27■■■□□ 2.44
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TM7SF3-208ENST00000539741 CERKQ8TCT0 537 aa30.25■■■□□ 2.43
TM7SF3-208ENST00000539741 MIA2Q96PC5 1412 aa30.23■■■□□ 2.43
TM7SF3-208ENST00000539741 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.2■■■□□ 2.43
TM7SF3-208ENST00000539741 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.18■■■□□ 2.42
TM7SF3-208ENST00000539741 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.18■■■□□ 2.42
TM7SF3-208ENST00000539741 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
TM7SF3-208ENST00000539741 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.16■■■□□ 2.42
TM7SF3-208ENST00000539741 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.15■■■□□ 2.42
TM7SF3-208ENST00000539741 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.14■■■□□ 2.42
TM7SF3-208ENST00000539741 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
TM7SF3-208ENST00000539741 PLCH2O75038 1416 aa30.13■■■□□ 2.41
TM7SF3-208ENST00000539741 ATP10AO60312 1499 aa30.13■■■□□ 2.41
TM7SF3-208ENST00000539741 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.11■■■□□ 2.41
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TM7SF3-208ENST00000539741 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.94■■■□□ 2.38
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TM7SF3-208ENST00000539741 ABCA6Q8N139 1617 aa29.85■■■□□ 2.37
TM7SF3-208ENST00000539741 DAPK1P53355 1430 aa29.85■■■□□ 2.37
TM7SF3-208ENST00000539741 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.84■■■□□ 2.37
TM7SF3-208ENST00000539741 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.83■■■□□ 2.37
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TM7SF3-208ENST00000539741 PTPRTO14522 1441 aa29.82■■■□□ 2.36
TM7SF3-208ENST00000539741 PTPRKQ15262 1439 aa29.82■■■□□ 2.36
TM7SF3-208ENST00000539741 SOCS7O14512 581 aa29.82■■■□□ 2.36
TM7SF3-208ENST00000539741 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.81■■■□□ 2.36
TM7SF3-208ENST00000539741 HFM1A2PYH4 1435 aa29.81■■■□□ 2.36
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TM7SF3-208ENST00000539741 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.79■■■□□ 2.36
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TM7SF3-208ENST00000539741 AGLP35573 1532 aa29.76■■■□□ 2.36
TM7SF3-208ENST00000539741 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.76■■■□□ 2.36
TM7SF3-208ENST00000539741 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
TM7SF3-208ENST00000539741 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.76■■■□□ 2.35
TM7SF3-208ENST00000539741 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.75■■■□□ 2.35
TM7SF3-208ENST00000539741 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.73■■■□□ 2.35
TM7SF3-208ENST00000539741 ABCC1P33527 1531 aa29.73■■■□□ 2.35
TM7SF3-208ENST00000539741 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.72■■■□□ 2.35
TM7SF3-208ENST00000539741 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.71■■■□□ 2.35
TM7SF3-208ENST00000539741 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.71■■■□□ 2.35
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