RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539696.5

MVK-208, Transcript of mevalonate kinase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MVK, Length 608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVK-208ENST00000539696 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.87■■■■■ 4.61
MVK-208ENST00000539696 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
MVK-208ENST00000539696 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.87■■■■■ 4.61
MVK-208ENST00000539696 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.82■■■■■ 4.6
MVK-208ENST00000539696 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.81■■■■■ 4.6
MVK-208ENST00000539696 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
MVK-208ENST00000539696 AKNAQ7Z591 1439 aa43.76■■■■■ 4.6
MVK-208ENST00000539696 KDM6BO15054 1643 aa43.71■■■■■ 4.59
MVK-208ENST00000539696 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.68■■■■■ 4.58
MVK-208ENST00000539696 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
MVK-208ENST00000539696 ADGRL1O94910 1474 aa43.66■■■■■ 4.58
MVK-208ENST00000539696 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
MVK-208ENST00000539696 MIA2Q96PC5 1412 aa43.61■■■■■ 4.57
MVK-208ENST00000539696 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.59■■■■■ 4.57
MVK-208ENST00000539696 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
MVK-208ENST00000539696 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.59■■■■■ 4.57
MVK-208ENST00000539696 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
MVK-208ENST00000539696 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.58■■■■■ 4.57
MVK-208ENST00000539696 ABCC1P33527 1531 aa43.55■■■■■ 4.56
MVK-208ENST00000539696 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.52■■■■■ 4.56
MVK-208ENST00000539696 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
MVK-208ENST00000539696 RAPGEF3O95398 923 aa43.48■■■■■ 4.55
MVK-208ENST00000539696 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.48■■■■■ 4.55
MVK-208ENST00000539696 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.48■■■■■ 4.55
MVK-208ENST00000539696 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.47■■■■■ 4.55
MVK-208ENST00000539696 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.44■■■■■ 4.54
MVK-208ENST00000539696 RICTORQ6R327 1708 aa43.43■■■■■ 4.54
MVK-208ENST00000539696 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.43■■■■■ 4.54
MVK-208ENST00000539696 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.43■■■■■ 4.54
MVK-208ENST00000539696 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.41■■■■■ 4.54
MVK-208ENST00000539696 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.4■■■■■ 4.54
MVK-208ENST00000539696 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.39■■■■■ 4.54
MVK-208ENST00000539696 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.36■■■■■ 4.53
MVK-208ENST00000539696 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.36■■■■■ 4.53
MVK-208ENST00000539696 AFAP1Q8N556 730 aa43.35■■■■■ 4.53
MVK-208ENST00000539696 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
MVK-208ENST00000539696 MBD5Q9P267 1494 aa43.33■■■■■ 4.53
MVK-208ENST00000539696 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.31■■■■■ 4.52
MVK-208ENST00000539696 KDM5CP41229 1560 aa43.3■■■■■ 4.52
MVK-208ENST00000539696 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.28■■■■■ 4.52
MVK-208ENST00000539696 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.26■■■■■ 4.52
MVK-208ENST00000539696 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.25■■■■■ 4.51
MVK-208ENST00000539696 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
MVK-208ENST00000539696 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.23■■■■■ 4.51
MVK-208ENST00000539696 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
MVK-208ENST00000539696 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.2■■■■■ 4.51
MVK-208ENST00000539696 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.2■■■■■ 4.51
MVK-208ENST00000539696 TSPY4P0CV99 314 aa43.18■■■■■ 4.5
MVK-208ENST00000539696 TSPY10P0CW01 314 aa43.18■■■■■ 4.5
MVK-208ENST00000539696 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.17■■■■■ 4.5
MVK-208ENST00000539696 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
MVK-208ENST00000539696 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.16■■■■■ 4.5
MVK-208ENST00000539696 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
MVK-208ENST00000539696 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.1■■■■■ 4.49
MVK-208ENST00000539696 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.09■■■■■ 4.49
MVK-208ENST00000539696 ATP7AQ04656 1500 aa43.08■■■■■ 4.49
MVK-208ENST00000539696 ABCC5O15440 1437 aa43.08■■■■■ 4.49
MVK-208ENST00000539696 DAPK1P53355 1430 aa43.08■■■■■ 4.49
MVK-208ENST00000539696 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
MVK-208ENST00000539696 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.07■■■■■ 4.49
MVK-208ENST00000539696 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.06■■■■■ 4.48
MVK-208ENST00000539696 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.04■■■■■ 4.48
MVK-208ENST00000539696 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.03■■■■■ 4.48
MVK-208ENST00000539696 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.03■■■■■ 4.48
MVK-208ENST00000539696 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.03■■■■■ 4.48
MVK-208ENST00000539696 ATP10AO60312 1499 aa43■■■■■ 4.47
MVK-208ENST00000539696 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.98■■■■■ 4.47
MVK-208ENST00000539696 ABCA6Q8N139 1617 aa42.97■■■■■ 4.47
MVK-208ENST00000539696 ITGAEP38570 1179 aa42.88■■■■■ 4.45
MVK-208ENST00000539696 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.88■■■■■ 4.45
MVK-208ENST00000539696 REREQ9P2R6 1566 aa42.87■■■■■ 4.45
MVK-208ENST00000539696 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.87■■■■■ 4.45
MVK-208ENST00000539696 PLXNC1O60486 1568 aa42.86■■■■■ 4.45
MVK-208ENST00000539696 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.86■■■■■ 4.45
MVK-208ENST00000539696 A2MP01023 1474 aa42.84■■■■■ 4.45
MVK-208ENST00000539696 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
MVK-208ENST00000539696 ADGRL2O95490 1459 aa42.81■■■■■ 4.44
MVK-208ENST00000539696 PTPRKQ15262 1439 aa42.8■■■■■ 4.44
MVK-208ENST00000539696 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
MVK-208ENST00000539696 NCOA1Q15788 1441 aa42.77■■■■■ 4.44
MVK-208ENST00000539696 KIF15Q9NS87 1388 aa42.77■■■■■ 4.44
MVK-208ENST00000539696 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.76■■■■■ 4.44
MVK-208ENST00000539696 ROCK1Q13464 1354 aa42.76■■■■■ 4.44
MVK-208ENST00000539696 AGLP35573 1532 aa42.74■■■■■ 4.43
MVK-208ENST00000539696 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.72■■■■■ 4.43
MVK-208ENST00000539696 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.69■■■■■ 4.42
MVK-208ENST00000539696 ERBINQ96RT1 1412 aa42.62■■■■■ 4.41
MVK-208ENST00000539696 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.58■■■■■ 4.41
MVK-208ENST00000539696 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
MVK-208ENST00000539696 KIF3BO15066 747 aa42.57■■■■■ 4.41
MVK-208ENST00000539696 MLECQ14165 292 aa42.57■■■■■ 4.41
MVK-208ENST00000539696 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.54■■■■■ 4.4
MVK-208ENST00000539696 GGT6Q6P531 493 aa42.48■■■■■ 4.39
MVK-208ENST00000539696 HFM1A2PYH4 1435 aa42.46■■■■■ 4.39
MVK-208ENST00000539696 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.45■■■■■ 4.39
MVK-208ENST00000539696 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.44■■■■■ 4.38
MVK-208ENST00000539696 NAIPQ13075 1403 aa42.43■■■■■ 4.38
MVK-208ENST00000539696 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
MVK-208ENST00000539696 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
MVK-208ENST00000539696 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.41■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms