RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539594.5

ESRRA-206, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-206ENST00000539594 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.5■■■■■ 4.71
ESRRA-206ENST00000539594 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
ESRRA-206ENST00000539594 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.48■■■■■ 4.71
ESRRA-206ENST00000539594 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.47■■■■■ 4.71
ESRRA-206ENST00000539594 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.44■■■■■ 4.71
ESRRA-206ENST00000539594 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.4■■■■■ 4.7
ESRRA-206ENST00000539594 TIAM1Q13009 1591 aa44.39■■■■■ 4.7
ESRRA-206ENST00000539594 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.39■■■■■ 4.7
ESRRA-206ENST00000539594 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
ESRRA-206ENST00000539594 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.34■■■■■ 4.69
ESRRA-206ENST00000539594 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.34■■■■■ 4.69
ESRRA-206ENST00000539594 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.33■■■■■ 4.69
ESRRA-206ENST00000539594 MAP3K1Q13233 1512 aa44.32■■■■■ 4.69
ESRRA-206ENST00000539594 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.29■■■■■ 4.68
ESRRA-206ENST00000539594 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.29■■■■■ 4.68
ESRRA-206ENST00000539594 ABCC1P33527 1531 aa44.26■■■■■ 4.68
ESRRA-206ENST00000539594 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
ESRRA-206ENST00000539594 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.24■■■■■ 4.67
ESRRA-206ENST00000539594 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
ESRRA-206ENST00000539594 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.22■■■■■ 4.67
ESRRA-206ENST00000539594 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.21■■■■■ 4.67
ESRRA-206ENST00000539594 KDM5CP41229 1560 aa44.19■■■■■ 4.66
ESRRA-206ENST00000539594 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
ESRRA-206ENST00000539594 NCOA2Q15596 1464 aa44.16■■■■■ 4.66
ESRRA-206ENST00000539594 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.16■■■■■ 4.66
ESRRA-206ENST00000539594 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.15■■■■■ 4.66
ESRRA-206ENST00000539594 APLP2Q06481 763 aa44.15■■■■■ 4.66
ESRRA-206ENST00000539594 AFAP1Q8N556 730 aa44.15■■■■■ 4.66
ESRRA-206ENST00000539594 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.14■■■■■ 4.66
ESRRA-206ENST00000539594 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.13■■■■■ 4.65
ESRRA-206ENST00000539594 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.1■■■■■ 4.65
ESRRA-206ENST00000539594 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.09■■■■■ 4.65
ESRRA-206ENST00000539594 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.09■■■■■ 4.65
ESRRA-206ENST00000539594 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.06■■■■■ 4.64
ESRRA-206ENST00000539594 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
ESRRA-206ENST00000539594 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.05■■■■■ 4.64
ESRRA-206ENST00000539594 ATP10AO60312 1499 aa44.04■■■■■ 4.64
ESRRA-206ENST00000539594 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
ESRRA-206ENST00000539594 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.02■■■■■ 4.64
ESRRA-206ENST00000539594 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.99■■■■■ 4.63
ESRRA-206ENST00000539594 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.99■■■■■ 4.63
ESRRA-206ENST00000539594 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.97■■■■■ 4.632e-7■■■■□ 19.5
ESRRA-206ENST00000539594 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.94■■■■■ 4.63
ESRRA-206ENST00000539594 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.91■■■■■ 4.62
ESRRA-206ENST00000539594 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.9■■■■■ 4.62
ESRRA-206ENST00000539594 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
ESRRA-206ENST00000539594 REREQ9P2R6 1566 aa43.88■■■■■ 4.62
ESRRA-206ENST00000539594 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
ESRRA-206ENST00000539594 ABCA6Q8N139 1617 aa43.88■■■■■ 4.61
ESRRA-206ENST00000539594 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.87■■■■■ 4.61
ESRRA-206ENST00000539594 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.84■■■■■ 4.61
ESRRA-206ENST00000539594 MBD5Q9P267 1494 aa43.84■■■■■ 4.61
ESRRA-206ENST00000539594 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.82■■■■■ 4.61
ESRRA-206ENST00000539594 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.82■■■■■ 4.6
ESRRA-206ENST00000539594 MIA2Q96PC5 1412 aa43.8■■■■■ 4.6
ESRRA-206ENST00000539594 ATP7AQ04656 1500 aa43.78■■■■■ 4.6
ESRRA-206ENST00000539594 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
ESRRA-206ENST00000539594 MADDQ8WXG6 1647 aa43.77■■■■■ 4.6
ESRRA-206ENST00000539594 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.73■■■■■ 4.59
ESRRA-206ENST00000539594 AGLP35573 1532 aa43.73■■■■■ 4.59
ESRRA-206ENST00000539594 PTPRMP28827 1452 aa43.71■■■■■ 4.59
ESRRA-206ENST00000539594 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.71■■■■■ 4.59
ESRRA-206ENST00000539594 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.7■■■■■ 4.59
ESRRA-206ENST00000539594 MLECQ14165 292 aa43.69■■■■■ 4.58
ESRRA-206ENST00000539594 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
ESRRA-206ENST00000539594 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.64■■■■■ 4.58
ESRRA-206ENST00000539594 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.61■■■■■ 4.57
ESRRA-206ENST00000539594 A2MP01023 1474 aa43.59■■■■■ 4.57
ESRRA-206ENST00000539594 TSPY4P0CV99 314 aa43.59■■■■■ 4.57
ESRRA-206ENST00000539594 TSPY10P0CW01 314 aa43.59■■■■■ 4.57
ESRRA-206ENST00000539594 PLXNC1O60486 1568 aa43.55■■■■■ 4.56
ESRRA-206ENST00000539594 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.53■■■■■ 4.56
ESRRA-206ENST00000539594 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.52■■■■■ 4.56
ESRRA-206ENST00000539594 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.47■■■■■ 4.55
ESRRA-206ENST00000539594 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
ESRRA-206ENST00000539594 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
ESRRA-206ENST00000539594 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
ESRRA-206ENST00000539594 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.38■■■■■ 4.53
ESRRA-206ENST00000539594 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.34■■■■■ 4.53
ESRRA-206ENST00000539594 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.33■■■■■ 4.53
ESRRA-206ENST00000539594 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.32■■■■■ 4.53
ESRRA-206ENST00000539594 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
ESRRA-206ENST00000539594 ABCC5O15440 1437 aa43.31■■■■■ 4.52
ESRRA-206ENST00000539594 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.29■■■■■ 4.52
ESRRA-206ENST00000539594 DAPK1P53355 1430 aa43.29■■■■■ 4.52
ESRRA-206ENST00000539594 GGT6Q6P531 493 aa43.27■■■■■ 4.52
ESRRA-206ENST00000539594 MROH2AA6NES4 1674 aa43.25■■■■■ 4.51
ESRRA-206ENST00000539594 C3P01024 1663 aa43.22■■■■■ 4.51
ESRRA-206ENST00000539594 KIF3BO15066 747 aa43.22■■■■■ 4.51
ESRRA-206ENST00000539594 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
ESRRA-206ENST00000539594 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
ESRRA-206ENST00000539594 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
ESRRA-206ENST00000539594 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.17■■■■■ 4.5
ESRRA-206ENST00000539594 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
ESRRA-206ENST00000539594 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.16■■■■■ 4.5
ESRRA-206ENST00000539594 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
ESRRA-206ENST00000539594 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.15■■■■■ 4.5
ESRRA-206ENST00000539594 ZMYM3Q14202 1370 aa43.13■■■■■ 4.49
ESRRA-206ENST00000539594 KIF15Q9NS87 1388 aa43.12■■■■■ 4.49
ESRRA-206ENST00000539594 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms