RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539034.1

CLIP1-AS1-202, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLIP1-AS1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.19□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.19□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 G3V3G9 751 aa11.18□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPP1R37O75864 691 aa11.18□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.18□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NLRP6P59044 892 aa11.17□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.16□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.16□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.16□□□□□ -0.62
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 E2F4Q16254 413 aa11.09□□□□□ -0.63
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MICALL2Q8IY33 904 aa11.08□□□□□ -0.64
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.05□□□□□ -0.64
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.04□□□□□ -0.64
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.03□□□□□ -0.64
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.02□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SEMA3EO15041 775 aa11□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MFSD10Q14728 455 aa10.99□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.99□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.98□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PDE4AP27815 886 aa10.97□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SNPHO15079 494 aa10.95□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ST18O60284 1047 aa10.94□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POTEMA6NI47 508 aa10.91□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POTEGQ6S5H5 508 aa10.91□□□□□ -0.66
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CAMK2BQ13554 666 aa10.89□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.88□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C2orf72A6NCS6 295 aa10.87□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.87□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.86□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TMC2Q8TDI7 906 aa10.85□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MARVELD3Q96A59 401 aa10.85□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZMYND10O75800 440 aa10.84□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NEUROD2Q15784 382 aa10.84□□□□□ -0.67
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DOK7Q18PE1 504 aa10.83□□□□□ -0.68
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.83□□□□□ -0.68
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KIF3CO14782 793 aa10.82□□□□□ -0.68
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.82□□□□□ -0.68
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EMP3P54852 163 aa10.77□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 BARGINQ6ZT62 677 aa10.77□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 RIMBP2O15034 1052 aa10.76□□□□□ -0.69
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C14orf37Q86TY3 774 aa10.75□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.74□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DSG2Q14126 1118 aa10.73□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ARSIQ5FYB1 569 aa10.73□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.73□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM205CA6NFA0 338 aa10.72□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DPYSL4O14531 572 aa10.72□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLPP6Q8IY26 295 aa10.72□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PDIA6Q15084 440 aa10.71□□□□□ -0.69
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FOXK1P85037 733 aa10.7□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GPR153Q6NV75 609 aa10.7□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.7□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.69□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POTEB3A0JP26 581 aa10.68□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 POTEBQ6S5H4 581 aa10.68□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 AK7Q96M32 723 aa10.68□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ERBB3P21860 1342 aa10.67□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.67□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.65□□□□□ -0.7
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC34A2O95436 690 aa10.63□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NUDT7P0C024 238 aa10.63□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.63□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GPR37O15354 613 aa10.61□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.6□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TRIM66O15016 1216 aa10.58□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ARXQ96QS3 562 aa10.57□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.57□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TBC1D12O60347 775 aa10.55□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PDE4DQ08499 809 aa10.55□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 LHX6Q9UPM6 363 aa10.55□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 OXER1Q8TDS5 423 aa10.54□□□□□ -0.72
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GRXCR2A6NFK2 248 aa10.53□□□□□ -0.72
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