RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538176.5

CCDC78-215, Transcript of coiled-coil domain containing 78, human

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,166 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC78-215	ENST00000538176	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		34.35	■■■■□ 3.09
CCDC78-215	ENST00000538176	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		34.32	■■■■□ 3.08
CCDC78-215	ENST00000538176	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	34.3	■■■■□ 3.08
CCDC78-215	ENST00000538176	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		34.28	■■■■□ 3.08
CCDC78-215	ENST00000538176	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		34.26	■■■■□ 3.08
CCDC78-215	ENST00000538176	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CCDC78-215	ENST00000538176	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CCDC78-215	ENST00000538176	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34.24	■■■■□ 3.07
CCDC78-215	ENST00000538176	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		34.23	■■■■□ 3.07
CCDC78-215	ENST00000538176	PREX2	Q70Z35	1606 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CCDC78-215	ENST00000538176	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		34.17	■■■■□ 3.06
CCDC78-215	ENST00000538176	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		34.16	■■■■□ 3.06
CCDC78-215	ENST00000538176	AFAP1	Q8N556	730 aa		34.16	■■■■□ 3.06
CCDC78-215	ENST00000538176	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		34.15	■■■■□ 3.06
CCDC78-215	ENST00000538176	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		34.14	■■■■□ 3.06
CCDC78-215	ENST00000538176	ATP10A	O60312	1499 aa		34.14	■■■■□ 3.06
CCDC78-215	ENST00000538176	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	34.13	■■■■□ 3.05
CCDC78-215	ENST00000538176	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		34.12	■■■■□ 3.05
CCDC78-215	ENST00000538176	KDM5C	P41229	1560 aa		34.11	■■■■□ 3.05
CCDC78-215	ENST00000538176	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		34.11	■■■■□ 3.05
CCDC78-215	ENST00000538176	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	34.1	■■■■□ 3.05
CCDC78-215	ENST00000538176	ABCC1	P33527	1531 aa		34.09	■■■■□ 3.05
CCDC78-215	ENST00000538176	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		34.08	■■■■□ 3.05
CCDC78-215	ENST00000538176	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		34.07	■■■■□ 3.05
CCDC78-215	ENST00000538176	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		34.07	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	34.07	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	PTPRM	P28827	1452 aa		34.07	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		34.06	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		34.04	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		34.03	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		34.03	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		34.03	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		34.02	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		34.01	■■■■□ 3.04
CCDC78-215	ENST00000538176	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.98	■■■■□ 3.03
CCDC78-215	ENST00000538176	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.96	■■■■□ 3.03
CCDC78-215	ENST00000538176	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.94	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.94	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	MLEC	Q14165	292 aa		33.93	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.93	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.89	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
CCDC78-215	ENST00000538176	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
CCDC78-215	ENST00000538176	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.86	■■■■□ 3.01
CCDC78-215	ENST00000538176	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.85	■■■■□ 3.01
CCDC78-215	ENST00000538176	AGL	P35573	1532 aa		33.84	■■■■□ 3.01
CCDC78-215	ENST00000538176	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.84	■■■■□ 3.01
CCDC78-215	ENST00000538176	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.84	■■■■□ 3.01
CCDC78-215	ENST00000538176	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.83	■■■■□ 3.01
CCDC78-215	ENST00000538176	APLP2	Q06481	763 aa		33.81	■■■■□ 3
CCDC78-215	ENST00000538176	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.8	■■■■□ 3
CCDC78-215	ENST00000538176	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
CCDC78-215	ENST00000538176	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
CCDC78-215	ENST00000538176	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.76	■■■□□ 2.99
CCDC78-215	ENST00000538176	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.74	■■■□□ 2.99
CCDC78-215	ENST00000538176	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.72	■■■□□ 2.99
CCDC78-215	ENST00000538176	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
CCDC78-215	ENST00000538176	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
CCDC78-215	ENST00000538176	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CCDC78-215	ENST00000538176	A2M	P01023	1474 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CCDC78-215	ENST00000538176	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CCDC78-215	ENST00000538176	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CCDC78-215	ENST00000538176	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.62	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.62	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CCDC78-215	ENST00000538176	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CCDC78-215	ENST00000538176	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
CCDC78-215	ENST00000538176	GGT6	Q6P531	493 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CCDC78-215	ENST00000538176	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CCDC78-215	ENST00000538176	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CCDC78-215	ENST00000538176	C3	P01024	1663 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CCDC78-215	ENST00000538176	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CCDC78-215	ENST00000538176	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CCDC78-215	ENST00000538176	HSPA2	P54652	639 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CCDC78-215	ENST00000538176	KIF3B	O15066	747 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CCDC78-215	ENST00000538176	NPAT	Q14207	1427 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CCDC78-215	ENST00000538176	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CCDC78-215	ENST00000538176	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CCDC78-215	ENST00000538176	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CCDC78-215	ENST00000538176	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
CCDC78-215	ENST00000538176	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CCDC78-215	ENST00000538176	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CCDC78-215	ENST00000538176	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CCDC78-215	ENST00000538176	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
CCDC78-215	ENST00000538176	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CCDC78-215	ENST00000538176	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CCDC78-215	ENST00000538176	ABCC5	O15440	1437 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CCDC78-215	ENST00000538176	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.22	■■■□□ 2.91

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