RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535551.1

PGA3-202, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 3

Gene PGA3, Length 1,449 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-202ENST00000535551 TIAM1Q13009 1591 aa15.93■□□□□ 0.14
PGA3-202ENST00000535551 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PGA3-202ENST00000535551 PLCH2O75038 1416 aa15.92■□□□□ 0.14
PGA3-202ENST00000535551 FANCAO15360 1455 aa15.92■□□□□ 0.14
PGA3-202ENST00000535551 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.9■□□□□ 0.14
PGA3-202ENST00000535551 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.9■□□□□ 0.14
PGA3-202ENST00000535551 MAP3K1Q13233 1512 aa15.9■□□□□ 0.14
PGA3-202ENST00000535551 PREX2Q70Z35 1606 aa15.89■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 AKNAQ7Z591 1439 aa15.87■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.87■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 RICTORQ6R327 1708 aa15.86■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.86■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.85■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.84■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.84■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.84■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.84■□□□□ 0.13
PGA3-202ENST00000535551 ADGRL1O94910 1474 aa15.83■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.83■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.82■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.8■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.79■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.78■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 ABCC1P33527 1531 aa15.78■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.77■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.77■□□□□ 0.12
PGA3-202ENST00000535551 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.77■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 KDM5CP41229 1560 aa15.77■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.76■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 NCOA2Q15596 1464 aa15.75■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 RAPGEF3O95398 923 aa15.74■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.73■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.73■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.72■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.71■□□□□ 0.11
PGA3-202ENST00000535551 APLP2Q06481 763 aa15.7■□□□□ 0.1
PGA3-202ENST00000535551 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.7■□□□□ 0.1
PGA3-202ENST00000535551 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PGA3-202ENST00000535551 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.68■□□□□ 0.1
PGA3-202ENST00000535551 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.68■□□□□ 0.1
PGA3-202ENST00000535551 REREQ9P2R6 1566 aa15.67■□□□□ 0.1
PGA3-202ENST00000535551 MIA2Q96PC5 1412 aa15.66■□□□□ 0.1
PGA3-202ENST00000535551 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.64■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.64■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 ATP10AO60312 1499 aa15.64■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.63■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.63■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.63■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.63■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.63■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.62■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.62■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 MBD5Q9P267 1494 aa15.62■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.61■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 AFAP1Q8N556 730 aa15.61■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 ABCA6Q8N139 1617 aa15.61■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.61■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.6■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 ATP7AQ04656 1500 aa15.6■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.59■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.59■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 AGLP35573 1532 aa15.59■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.59■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PGA3-202ENST00000535551 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.57■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.57■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.56■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.55■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 PLXNC1O60486 1568 aa15.54■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 MADDQ8WXG6 1647 aa15.53■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.53■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.52■□□□□ 0.08
PGA3-202ENST00000535551 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.51■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.51■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.51■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 A2MP01023 1474 aa15.49■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 PTPRMP28827 1452 aa15.48■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 TSPY4P0CV99 314 aa15.47■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 TSPY10P0CW01 314 aa15.47■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.46■□□□□ 0.07
PGA3-202ENST00000535551 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.44■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 MROH2AA6NES4 1674 aa15.44■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms