RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLCH2O75038 1416 aa26.05■■□□□ 1.76
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FANCAO15360 1455 aa26.04■■□□□ 1.76
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.03■■□□□ 1.76
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.01■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.99■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.96■■□□□ 1.75
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.95■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.94■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AKNAQ7Z591 1439 aa25.94■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RICTORQ6R327 1708 aa25.92■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.9■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADGRL1O94910 1474 aa25.9■■□□□ 1.74
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.88■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCC1P33527 1531 aa25.86■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.86■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NCOA2Q15596 1464 aa25.85■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.84■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.83■■□□□ 1.73
GMDS-AS1-211ENST00000533653 APLP2Q06481 763 aa25.82■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.8■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.8■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.79■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.79■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDM5CP41229 1560 aa25.78■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.78■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.77■■□□□ 1.72
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.73■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAPGEF3O95398 923 aa25.72■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.72■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.71■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.7■■□□□ 1.7
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.68■■□□□ 1.7
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.67■■□□□ 1.7
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MIA2Q96PC5 1412 aa25.66■■□□□ 1.7
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.65■■□□□ 1.7
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.65■■□□□ 1.7
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POTEDQ86YR6 584 aa25.64■■□□□ 1.7
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.63■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.61■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-211ENST00000533653 REREQ9P2R6 1566 aa25.6■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-211ENST00000533653 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MBD5Q9P267 1494 aa25.59■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.59■■□□□ 1.69
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.57■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.57■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCA6Q8N139 1617 aa25.57■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.56■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP7AQ04656 1500 aa25.55■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AFAP1Q8N556 730 aa25.55■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.55■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.54■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP10AO60312 1499 aa25.53■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.53■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.52■■□□□ 1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.49■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.49■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.49■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.48■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.48■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.48■■□□□ 1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AGLP35573 1532 aa25.45■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.45■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLXNC1O60486 1568 aa25.44■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.44■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.4■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.37■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A2MP01023 1474 aa25.36■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MADDQ8WXG6 1647 aa25.35■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.35■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TSPY4P0CV99 314 aa25.34■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TSPY10P0CW01 314 aa25.34■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DAPK1P53355 1430 aa25.34■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCC5O15440 1437 aa25.32■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.25■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.24■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADGRL2O95490 1459 aa25.24■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTPRMP28827 1452 aa25.22■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MROH2AA6NES4 1674 aa25.21■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.2■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ERBINQ96RT1 1412 aa25.19■■□□□ 1.62
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