RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.65■■□□□ 1.86
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PKP3-209ENST00000533069 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.62■■□□□ 1.85
PKP3-209ENST00000533069 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.62■■□□□ 1.85
PKP3-209ENST00000533069 PREX2Q70Z35 1606 aa26.59■■□□□ 1.85
PKP3-209ENST00000533069 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.58■■□□□ 1.84
PKP3-209ENST00000533069 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.56■■□□□ 1.84
PKP3-209ENST00000533069 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.55■■□□□ 1.84
PKP3-209ENST00000533069 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.53■■□□□ 1.84
PKP3-209ENST00000533069 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.53■■□□□ 1.84
PKP3-209ENST00000533069 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.52■■□□□ 1.84
PKP3-209ENST00000533069 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.5■■□□□ 1.83
PKP3-209ENST00000533069 ABCC1P33527 1531 aa26.49■■□□□ 1.83
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PKP3-209ENST00000533069 KDM5CP41229 1560 aa26.49■■□□□ 1.83
PKP3-209ENST00000533069 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.48■■□□□ 1.83
PKP3-209ENST00000533069 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PKP3-209ENST00000533069 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.47■■□□□ 1.83
PKP3-209ENST00000533069 AFAP1Q8N556 730 aa26.44■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.44■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.43■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 ATP10AO60312 1499 aa26.42■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.42■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 TIAM1Q13009 1591 aa26.41■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.41■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.41■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.41■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.4■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.4■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.4■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.39■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PKP3-209ENST00000533069 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.38■■□□□ 1.81
PKP3-209ENST00000533069 MAP3K1Q13233 1512 aa26.35■■□□□ 1.81
PKP3-209ENST00000533069 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.35■■□□□ 1.81
PKP3-209ENST00000533069 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.35■■□□□ 1.81
PKP3-209ENST00000533069 PTPRMP28827 1452 aa26.35■■□□□ 1.81
PKP3-209ENST00000533069 NCOA2Q15596 1464 aa26.34■■□□□ 1.81
PKP3-209ENST00000533069 MADDQ8WXG6 1647 aa26.33■■□□□ 1.81
PKP3-209ENST00000533069 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PKP3-209ENST00000533069 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.33■■□□□ 1.8
PKP3-209ENST00000533069 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.32■■□□□ 1.8
PKP3-209ENST00000533069 REREQ9P2R6 1566 aa26.32■■□□□ 1.8
PKP3-209ENST00000533069 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.31■■□□□ 1.8
PKP3-209ENST00000533069 ABCA6Q8N139 1617 aa26.28■■□□□ 1.8
PKP3-209ENST00000533069 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
PKP3-209ENST00000533069 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PKP3-209ENST00000533069 MLECQ14165 292 aa26.24■■□□□ 1.79
PKP3-209ENST00000533069 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.24■■□□□ 1.79
PKP3-209ENST00000533069 AGLP35573 1532 aa26.23■■□□□ 1.79
PKP3-209ENST00000533069 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PKP3-209ENST00000533069 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PKP3-209ENST00000533069 MBD5Q9P267 1494 aa26.21■■□□□ 1.79
PKP3-209ENST00000533069 ATP7AQ04656 1500 aa26.2■■□□□ 1.79
PKP3-209ENST00000533069 APLP2Q06481 763 aa26.2■■□□□ 1.78
PKP3-209ENST00000533069 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
PKP3-209ENST00000533069 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
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PKP3-209ENST00000533069 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.16■■□□□ 1.78
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PKP3-209ENST00000533069 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.14■■□□□ 1.78
PKP3-209ENST00000533069 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.14■■□□□ 1.77
PKP3-209ENST00000533069 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.11■■□□□ 1.77
PKP3-209ENST00000533069 MIA2Q96PC5 1412 aa26.11■■□□□ 1.77
PKP3-209ENST00000533069 A2MP01023 1474 aa26.11■■□□□ 1.77
PKP3-209ENST00000533069 PLXNC1O60486 1568 aa26.09■■□□□ 1.77
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PKP3-209ENST00000533069 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PKP3-209ENST00000533069 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.05■■□□□ 1.76
PKP3-209ENST00000533069 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.04■■□□□ 1.76
PKP3-209ENST00000533069 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.04■■□□□ 1.76
PKP3-209ENST00000533069 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.04■■□□□ 1.76
PKP3-209ENST00000533069 TSPY4P0CV99 314 aa26.01■■□□□ 1.75
PKP3-209ENST00000533069 TSPY10P0CW01 314 aa26.01■■□□□ 1.75
PKP3-209ENST00000533069 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PKP3-209ENST00000533069 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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PKP3-209ENST00000533069 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.94■■□□□ 1.74
PKP3-209ENST00000533069 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.92■■□□□ 1.74
PKP3-209ENST00000533069 MROH2AA6NES4 1674 aa25.91■■□□□ 1.74
PKP3-209ENST00000533069 C3P01024 1663 aa25.91■■□□□ 1.74
PKP3-209ENST00000533069 GGT6Q6P531 493 aa25.91■■□□□ 1.74
PKP3-209ENST00000533069 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.9■■□□□ 1.74
PKP3-209ENST00000533069 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.9■■□□□ 1.74
PKP3-209ENST00000533069 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.88■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.87■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 ZMYM3Q14202 1370 aa25.87■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.86■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 NPATQ14207 1427 aa25.86■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 KIF3BO15066 747 aa25.85■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 HSPA2P54652 639 aa25.85■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 ABCC5O15440 1437 aa25.83■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PKP3-209ENST00000533069 DAPK1P53355 1430 aa25.8■■□□□ 1.72
PKP3-209ENST00000533069 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PKP3-209ENST00000533069 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.79■■□□□ 1.72
PKP3-209ENST00000533069 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.78■■□□□ 1.72
PKP3-209ENST00000533069 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.78■■□□□ 1.72
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